RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568622.1

KIAA0556-208, Transcript of KIAA0556, humanhuman

TSL 2

Gene KIAA0556, Length 570 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556-208ENST00000568622 WDR73Q6P4I2 378 aa6.95□□□□□ -1.3
KIAA0556-208ENST00000568622 KCNRGQ8N5I3 272 aa6.95□□□□□ -1.3
KIAA0556-208ENST00000568622 FAM213BQ8TBF2 198 aa6.95□□□□□ -1.3
KIAA0556-208ENST00000568622 GAGE12HA6NDE8 117 aa6.94□□□□□ -1.3
KIAA0556-208ENST00000568622 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.94□□□□□ -1.3
KIAA0556-208ENST00000568622 SMIM12Q96EX1 92 aa6.94□□□□□ -1.3
KIAA0556-208ENST00000568622 CNFNQ9BYD5 112 aa6.94□□□□□ -1.3
KIAA0556-208ENST00000568622 A0A1B0GV50 99 aa6.93□□□□□ -1.3
KIAA0556-208ENST00000568622 F2Z2F3 143 aa6.93□□□□□ -1.3
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KIAA0556-208ENST00000568622 STPG4Q8N801 248 aa6.92□□□□□ -1.3
KIAA0556-208ENST00000568622 TPPP3Q9BW30 176 aa6.92□□□□□ -1.3
KIAA0556-208ENST00000568622 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa6.91□□□□□ -1.3
KIAA0556-208ENST00000568622 HMSDA8MTL9 139 aa6.91□□□□□ -1.3
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KIAA0556-208ENST00000568622 FOXI1Q12951 378 aa6.91□□□□□ -1.3
KIAA0556-208ENST00000568622 HIGD2BQ4VC39 106 aa6.91□□□□□ -1.3
KIAA0556-208ENST00000568622 GATD1Q8NB37 220 aa6.91□□□□□ -1.3
KIAA0556-208ENST00000568622 GTSF1Q8WW33 167 aa6.91□□□□□ -1.3
KIAA0556-208ENST00000568622 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
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KIAA0556-208ENST00000568622 H7C423 109 aa6.9□□□□□ -1.3
KIAA0556-208ENST00000568622 UBE2L6O14933 153 aa6.9□□□□□ -1.3
KIAA0556-208ENST00000568622 NCR2O95944 276 aa6.9□□□□□ -1.3
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KIAA0556-208ENST00000568622 XKRY2A2RUG3 117 aa6.89□□□□□ -1.31
KIAA0556-208ENST00000568622 RAB19A4D1S5 217 aa6.89□□□□□ -1.31
KIAA0556-208ENST00000568622 BCL2L11O43521 198 aa6.89□□□□□ -1.31
KIAA0556-208ENST00000568622 BATF3Q9NR55 127 aa6.89□□□□□ -1.31
KIAA0556-208ENST00000568622 GNG13Q9P2W3 67 aa6.89□□□□□ -1.31
KIAA0556-208ENST00000568622 LINC00474Q9P2X8 69 aa6.89□□□□□ -1.31
KIAA0556-208ENST00000568622 LPAP08519 4548 aa6.88□□□□□ -1.31
KIAA0556-208ENST00000568622 IFNA1P01562 189 aa6.88□□□□□ -1.31
KIAA0556-208ENST00000568622 GNG4P50150 75 aa6.88□□□□□ -1.31
KIAA0556-208ENST00000568622 REG3GQ6UW15 175 aa6.88□□□□□ -1.31
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KIAA0556-208ENST00000568622 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.88□□□□□ -1.31
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KIAA0556-208ENST00000568622 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa6.87□□□□□ -1.31
KIAA0556-208ENST00000568622 FAM231BA6NCW3 169 aa6.87□□□□□ -1.31
KIAA0556-208ENST00000568622 FGF6P10767 208 aa6.87□□□□□ -1.31
KIAA0556-208ENST00000568622 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
KIAA0556-208ENST00000568622 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
KIAA0556-208ENST00000568622 Q6ZRP5 223 aa6.87□□□□□ -1.31
KIAA0556-208ENST00000568622 NUDT10Q8NFP7 164 aa6.87□□□□□ -1.31
KIAA0556-208ENST00000568622 LYPD6BQ8NI32 183 aa6.87□□□□□ -1.31
KIAA0556-208ENST00000568622 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
KIAA0556-208ENST00000568622 NUDT11Q96G61 164 aa6.87□□□□□ -1.31
KIAA0556-208ENST00000568622 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
KIAA0556-208ENST00000568622 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa6.86□□□□□ -1.31
KIAA0556-208ENST00000568622 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
KIAA0556-208ENST00000568622 PDE6DO43924 150 aa6.86□□□□□ -1.31
KIAA0556-208ENST00000568622 ESDP10768 282 aa6.86□□□□□ -1.31
KIAA0556-208ENST00000568622 BIN3Q9NQY0 253 aa6.86□□□□□ -1.31
KIAA0556-208ENST00000568622 PKIGQ9Y2B9 76 aa6.86□□□□□ -1.31
KIAA0556-208ENST00000568622 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa6.85□□□□□ -1.31
KIAA0556-208ENST00000568622 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa6.85□□□□□ -1.31
KIAA0556-208ENST00000568622 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa6.85□□□□□ -1.31
KIAA0556-208ENST00000568622 SDHAF1A6NFY7 115 aa6.85□□□□□ -1.31
KIAA0556-208ENST00000568622 APCSP02743 223 aa6.85□□□□□ -1.31
KIAA0556-208ENST00000568622 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
KIAA0556-208ENST00000568622 TWIST1Q15672 202 aa6.85□□□□□ -1.31
KIAA0556-208ENST00000568622 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa6.85□□□□□ -1.31
KIAA0556-208ENST00000568622 CARD19Q96LW7 228 aa6.85□□□□□ -1.31
KIAA0556-208ENST00000568622 K7EN84 100 aa6.84□□□□□ -1.31
KIAA0556-208ENST00000568622 CCL25O15444 150 aa6.84□□□□□ -1.31
KIAA0556-208ENST00000568622 GAS8-AS1O95177 125 aa6.84□□□□□ -1.31
KIAA0556-208ENST00000568622 XCL1P47992 114 aa6.84□□□□□ -1.31
KIAA0556-208ENST00000568622 PTTG1IPP53801 180 aa6.84□□□□□ -1.31
KIAA0556-208ENST00000568622 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
KIAA0556-208ENST00000568622 RGS21Q2M5E4 152 aa6.84□□□□□ -1.31
KIAA0556-208ENST00000568622 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
KIAA0556-208ENST00000568622 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
KIAA0556-208ENST00000568622 LINC00526Q96FQ7 95 aa6.84□□□□□ -1.31
KIAA0556-208ENST00000568622 FAM210AQ96ND0 272 aa6.84□□□□□ -1.31
KIAA0556-208ENST00000568622 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
KIAA0556-208ENST00000568622 BCL2P10415 239 aa6.83□□□□□ -1.32
KIAA0556-208ENST00000568622 SYCNQ0VAF6 134 aa6.83□□□□□ -1.32
KIAA0556-208ENST00000568622 TEX261Q6UWH6 196 aa6.83□□□□□ -1.32
KIAA0556-208ENST00000568622 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.83□□□□□ -1.32
KIAA0556-208ENST00000568622 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa6.83□□□□□ -1.32
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