RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567690.5

CCNDBP1-212, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 936 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-212ENST00000567690 RYR1P21817 5038 aa4.84□□□□□ -1.63
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CCNDBP1-212ENST00000567690 PSCAO43653 123 aa4.84□□□□□ -1.63
CCNDBP1-212ENST00000567690 IGLC3P0DOY3 106 aa4.84□□□□□ -1.63
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
CCNDBP1-212ENST00000567690 G0S2P27469 103 aa4.84□□□□□ -1.63
CCNDBP1-212ENST00000567690 RIGQ13278 110 aa4.84□□□□□ -1.63
CCNDBP1-212ENST00000567690 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa4.84□□□□□ -1.63
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CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC25A29Q8N8R3 303 aa4.84□□□□□ -1.63
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CCNDBP1-212ENST00000567690 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
CCNDBP1-212ENST00000567690 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa4.84□□□□□ -1.63
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZFP30Q9Y2G7 519 aa4.84□□□□□ -1.63
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CCNDBP1-212ENST00000567690 BATFQ16520 125 aa4.83□□□□□ -1.64
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CCNDBP1-212ENST00000567690 C9orf85Q96MD7 179 aa4.83□□□□□ -1.64
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CCNDBP1-212ENST00000567690 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa4.82□□□□□ -1.64
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CCNDBP1-212ENST00000567690 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa4.82□□□□□ -1.64
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CCNDBP1-212ENST00000567690 H3BVH4 76 aa4.82□□□□□ -1.64
CCNDBP1-212ENST00000567690 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
CCNDBP1-212ENST00000567690 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
CCNDBP1-212ENST00000567690 S100A4P26447 101 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
CCNDBP1-212ENST00000567690 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
CCNDBP1-212ENST00000567690 XGP55808 180 aa4.82□□□□□ -1.64
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CCNDBP1-212ENST00000567690 Q5VSD8 79 aa4.82□□□□□ -1.64
CCNDBP1-212ENST00000567690 SH2D6Q7Z4S9 175 aa4.82□□□□□ -1.64
CCNDBP1-212ENST00000567690 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa4.82□□□□□ -1.64
CCNDBP1-212ENST00000567690 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa4.82□□□□□ -1.64
CCNDBP1-212ENST00000567690 TMEM70Q9BUB7 260 aa4.82□□□□□ -1.64
CCNDBP1-212ENST00000567690 JPT2Q9H910 190 aa4.82□□□□□ -1.64
CCNDBP1-212ENST00000567690 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa4.82□□□□□ -1.64
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CCNDBP1-212ENST00000567690 LINC01556Q5JQF7 62 aa4.81□□□□□ -1.64
CCNDBP1-212ENST00000567690 PET117Q6UWS5 81 aa4.81□□□□□ -1.64
CCNDBP1-212ENST00000567690 Q6ZSN1 163 aa4.81□□□□□ -1.64
CCNDBP1-212ENST00000567690 ATOH7Q8N100 152 aa4.81□□□□□ -1.64
CCNDBP1-212ENST00000567690 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa4.81□□□□□ -1.64
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CCNDBP1-212ENST00000567690 TMEM191AQ9H0A3 160 aa4.81□□□□□ -1.64
CCNDBP1-212ENST00000567690 HSPB8Q9UJY1 196 aa4.81□□□□□ -1.64
CCNDBP1-212ENST00000567690 HSPG2P98160 4391 aa4.81□□□□□ -1.64
CCNDBP1-212ENST00000567690 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa4.8□□□□□ -1.64
CCNDBP1-212ENST00000567690 LRCOL1A6NCL2 159 aa4.8□□□□□ -1.64
CCNDBP1-212ENST00000567690 HSBP1L1C9JCN9 74 aa4.8□□□□□ -1.64
CCNDBP1-212ENST00000567690 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa4.8□□□□□ -1.64
CCNDBP1-212ENST00000567690 K7EP13 123 aa4.8□□□□□ -1.64
CCNDBP1-212ENST00000567690 LECT2O14960 151 aa4.8□□□□□ -1.64
CCNDBP1-212ENST00000567690 SH2D1AO60880 128 aa4.8□□□□□ -1.64
CCNDBP1-212ENST00000567690 INAFM2P0DMQ5 153 aa4.8□□□□□ -1.64
CCNDBP1-212ENST00000567690 RPS20P60866 119 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
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CCNDBP1-212ENST00000567690 LELP1Q5T871 98 aa4.8□□□□□ -1.64
CCNDBP1-212ENST00000567690 FAM74A4Q5TZK3 123 aa4.8□□□□□ -1.64
CCNDBP1-212ENST00000567690 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
CCNDBP1-212ENST00000567690 GTSF1LQ9H1H1 148 aa4.8□□□□□ -1.64
CCNDBP1-212ENST00000567690 ST20Q9HBF5 79 aa4.8□□□□□ -1.64
CCNDBP1-212ENST00000567690 Q9UF83 564 aa4.8□□□□□ -1.64
CCNDBP1-212ENST00000567690 A0A087WWL8 130 aa4.79□□□□□ -1.64
CCNDBP1-212ENST00000567690 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa4.79□□□□□ -1.64
CCNDBP1-212ENST00000567690 ARMS2P0C7Q2 107 aa4.79□□□□□ -1.64
CCNDBP1-212ENST00000567690 MAJINQ3KP22 176 aa4.79□□□□□ -1.64
CCNDBP1-212ENST00000567690 FA2HQ7L5A8 372 aa4.79□□□□□ -1.64
CCNDBP1-212ENST00000567690 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
CCNDBP1-212ENST00000567690 STPG4Q8N801 248 aa4.79□□□□□ -1.64
CCNDBP1-212ENST00000567690 Q8N814 137 aa4.79□□□□□ -1.64
CCNDBP1-212ENST00000567690 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
CCNDBP1-212ENST00000567690 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
CCNDBP1-212ENST00000567690 FABP5P3A8MUU1 101 aa4.78□□□□□ -1.64
CCNDBP1-212ENST00000567690 A8MWV9 139 aa4.78□□□□□ -1.64
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