RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563295.1

KIFC3-215, Transcript of kinesin family member C3, humanhuman

TSL 5

Gene KIFC3, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFC3-215ENST00000563295 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa6.58□□□□□ -1.36
KIFC3-215ENST00000563295 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa6.58□□□□□ -1.36
KIFC3-215ENST00000563295 CRPP02741 224 aa6.58□□□□□ -1.36
KIFC3-215ENST00000563295 XGP55808 180 aa6.58□□□□□ -1.36
KIFC3-215ENST00000563295 IQCJQ1A5X6 159 aa6.58□□□□□ -1.36
KIFC3-215ENST00000563295 MPV17L2Q567V2 206 aa6.58□□□□□ -1.36
KIFC3-215ENST00000563295 ATRAIDQ6UW56 229 aa6.58□□□□□ -1.36
KIFC3-215ENST00000563295 SMIM15Q7Z3B0 74 aa6.58□□□□□ -1.36
KIFC3-215ENST00000563295 Q8N976 141 aa6.58□□□□□ -1.36
KIFC3-215ENST00000563295 GTSF1Q8WW33 167 aa6.58□□□□□ -1.36
KIFC3-215ENST00000563295 BAALCQ8WXS3 180 aa6.58□□□□□ -1.36
KIFC3-215ENST00000563295 DNAH5Q8TE73 4624 aa6.57□□□□□ -1.36
KIFC3-215ENST00000563295 LECT2O14960 151 aa6.57□□□□□ -1.36
KIFC3-215ENST00000563295 ANGP03950 147 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
KIFC3-215ENST00000563295 WFDC2Q14508 124 aa6.57□□□□□ -1.36
KIFC3-215ENST00000563295 CT83Q5H943 113 aa6.57□□□□□ -1.36
KIFC3-215ENST00000563295 ENHOQ6UWT2 76 aa6.57□□□□□ -1.36
KIFC3-215ENST00000563295 FRZBQ92765 325 aa6.57□□□□□ -1.36
KIFC3-215ENST00000563295 BORCS7Q96B45 105 aa6.57□□□□□ -1.36
KIFC3-215ENST00000563295 IMMP2LQ96T52 175 aa6.57□□□□□ -1.36
KIFC3-215ENST00000563295 TMEM70Q9BUB7 260 aa6.57□□□□□ -1.36
KIFC3-215ENST00000563295 C1orf43Q9BWL3 253 aa6.57□□□□□ -1.36
KIFC3-215ENST00000563295 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
KIFC3-215ENST00000563295 RBX1P62877 108 aa6.56□□□□□ -1.36
KIFC3-215ENST00000563295 GAGE6Q13070 117 aa6.56□□□□□ -1.36
KIFC3-215ENST00000563295 MIAQ16674 131 aa6.56□□□□□ -1.36
KIFC3-215ENST00000563295 PGLYRP4Q96LB8 373 aa6.56□□□□□ -1.36
KIFC3-215ENST00000563295 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa6.55□□□□□ -1.36
KIFC3-215ENST00000563295 SCO1O75880 301 aa6.55□□□□□ -1.36
KIFC3-215ENST00000563295 LINC00269Q8N2A0 174 aa6.55□□□□□ -1.36
KIFC3-215ENST00000563295 GATD1Q8NB37 220 aa6.55□□□□□ -1.36
KIFC3-215ENST00000563295 TMEM243Q9BU79 118 aa6.55□□□□□ -1.36
KIFC3-215ENST00000563295 GFRA4Q9GZZ7 299 aa6.55□□□□□ -1.36
KIFC3-215ENST00000563295 PRR34Q9NV39 138 aa6.55□□□□□ -1.36
KIFC3-215ENST00000563295 APOBP04114 4563 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
KIFC3-215ENST00000563295 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
KIFC3-215ENST00000563295 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa6.54□□□□□ -1.36
KIFC3-215ENST00000563295 A0A1B0GUV1 79 aa6.54□□□□□ -1.36
KIFC3-215ENST00000563295 FAM231BA6NCW3 169 aa6.54□□□□□ -1.36
KIFC3-215ENST00000563295 EPM2AB3EWF7 344 aa6.54□□□□□ -1.36
KIFC3-215ENST00000563295 COTL1Q14019 142 aa6.54□□□□□ -1.36
KIFC3-215ENST00000563295 COX19Q49B96 90 aa6.54□□□□□ -1.36
KIFC3-215ENST00000563295 C14orf177Q52M58 125 aa6.54□□□□□ -1.36
KIFC3-215ENST00000563295 CBLN2Q8IUK8 224 aa6.54□□□□□ -1.36
KIFC3-215ENST00000563295 TSKUQ8WUA8 353 aa6.54□□□□□ -1.36
KIFC3-215ENST00000563295 A0A1B0GUT8 65 aa6.53□□□□□ -1.36
KIFC3-215ENST00000563295 HIGD1CA8MV81 97 aa6.53□□□□□ -1.36
KIFC3-215ENST00000563295 UBE2L6O14933 153 aa6.53□□□□□ -1.36
KIFC3-215ENST00000563295 S100A8P05109 93 aa6.53□□□□□ -1.36
KIFC3-215ENST00000563295 AMTP48728 403 aa6.53□□□□□ -1.36
KIFC3-215ENST00000563295 NAT8BQ9UHF3 227 aa6.53□□□□□ -1.36
KIFC3-215ENST00000563295 CLPSL2Q6UWE3 100 aa6.52□□□□□ -1.37
KIFC3-215ENST00000563295 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa6.52□□□□□ -1.37
KIFC3-215ENST00000563295 V9GYV3 84 aa6.52□□□□□ -1.37
KIFC3-215ENST00000563295 ABCA13Q86UQ4 5058 aa6.52□□□□□ -1.37
KIFC3-215ENST00000563295 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa6.51□□□□□ -1.37
KIFC3-215ENST00000563295 SDHAF1A6NFY7 115 aa6.51□□□□□ -1.37
KIFC3-215ENST00000563295 NCR2O95944 276 aa6.51□□□□□ -1.37
KIFC3-215ENST00000563295 HLA-DQA1P01909 254 aa6.51□□□□□ -1.37
KIFC3-215ENST00000563295 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
KIFC3-215ENST00000563295 REG3AQ06141 175 aa6.51□□□□□ -1.37
KIFC3-215ENST00000563295 Q5VSD8 79 aa6.51□□□□□ -1.37
KIFC3-215ENST00000563295 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
KIFC3-215ENST00000563295 TMEM191AQ9H0A3 160 aa6.51□□□□□ -1.37
KIFC3-215ENST00000563295 FAM30AQ9NZY2 134 aa6.51□□□□□ -1.37
KIFC3-215ENST00000563295 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa6.5□□□□□ -1.37
KIFC3-215ENST00000563295 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa6.5□□□□□ -1.37
KIFC3-215ENST00000563295 A0A1B0GW15 77 aa6.5□□□□□ -1.37
KIFC3-215ENST00000563295 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa6.5□□□□□ -1.37
KIFC3-215ENST00000563295 USP17L23D6RBM5 183 aa6.5□□□□□ -1.37
KIFC3-215ENST00000563295 FAM229AH3BQW9 127 aa6.5□□□□□ -1.37
KIFC3-215ENST00000563295 RPS10P46783 165 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
KIFC3-215ENST00000563295 RIGQ13278 110 aa6.5□□□□□ -1.37
KIFC3-215ENST00000563295 Q6ZSA8 131 aa6.5□□□□□ -1.37
KIFC3-215ENST00000563295 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa6.5□□□□□ -1.37
KIFC3-215ENST00000563295 C20orf203Q8NBC4 194 aa6.5□□□□□ -1.37
KIFC3-215ENST00000563295 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
KIFC3-215ENST00000563295 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa6.49□□□□□ -1.37
KIFC3-215ENST00000563295 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa6.49□□□□□ -1.37
KIFC3-215ENST00000563295 C1orf196B1AJZ1 125 aa6.49□□□□□ -1.37
KIFC3-215ENST00000563295 H7C423 109 aa6.49□□□□□ -1.37
KIFC3-215ENST00000563295 I3L3M4 83 aa6.49□□□□□ -1.37
KIFC3-215ENST00000563295 MT-ND6P03923 174 aa6.49□□□□□ -1.37
KIFC3-215ENST00000563295 RAB5AP20339 215 aa6.49□□□□□ -1.37
KIFC3-215ENST00000563295 PMCHP20382 165 aa6.49□□□□□ -1.37
KIFC3-215ENST00000563295 HAMPP81172 84 aa6.49□□□□□ -1.37
KIFC3-215ENST00000563295 LINC01620Q4KN68 170 aa6.49□□□□□ -1.37
KIFC3-215ENST00000563295 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.49□□□□□ -1.37
KIFC3-215ENST00000563295 NUP35Q8NFH5 326 aa6.49□□□□□ -1.37
KIFC3-215ENST00000563295 MRAP2Q96G30 205 aa6.49□□□□□ -1.37
KIFC3-215ENST00000563295 ST20Q9HBF5 79 aa6.49□□□□□ -1.37
KIFC3-215ENST00000563295 APCSP02743 223 aa6.48□□□□□ -1.37
KIFC3-215ENST00000563295 PRSS1P07477 247 aa6.48□□□□□ -1.37
KIFC3-215ENST00000563295 RAB4AP20338 218 aa6.48□□□□□ -1.37
KIFC3-215ENST00000563295 RAB5BP61020 215 aa6.48□□□□□ -1.37
KIFC3-215ENST00000563295 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa6.48□□□□□ -1.37
KIFC3-215ENST00000563295 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa6.48□□□□□ -1.37
KIFC3-215ENST00000563295 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa6.47□□□□□ -1.37
KIFC3-215ENST00000563295 COLCA2A8K830 154 aa6.47□□□□□ -1.37
KIFC3-215ENST00000563295 PPP1R17O96001 155 aa6.47□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.1 ms