RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560557.1

FAM227B-211, Transcript of family with sequence similarity 227 member B, humanhuman

TSL 3

Gene FAM227B, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227B-211ENST00000560557 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa-0.51□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa-0.51□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP-0.51□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP-0.52□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 PAPPAQ13219 1627 aa-0.52□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 SYNMO15061 1565 aa-0.52□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP-0.52□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP-0.52□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa-0.52□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 RPL7P18124 248 aaKnown RBP-0.52□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 UBE2D1P51668 147 aa-0.52□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 DEFB135Q30KP9 77 aa-0.52□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 TMEM78Q5T7P6 136 aa-0.52□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 SPANXN1Q5VSR9 72 aa-0.52□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 LINC01545Q5VT33 79 aa-0.52□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 CHMP6Q96FZ7 201 aa-0.52□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 SDF2Q99470 211 aa-0.52□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 BOLA2Q9H3K6 86 aa-0.52□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 BANF2Q9H503 90 aa-0.52□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 GID8Q9NWU2 228 aa-0.52□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 NDUFA12Q9UI09 145 aa-0.52□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 R4GMQ9 66 aa-0.52□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 ACACAQ13085 2346 aa-0.52□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 ZZEF1O43149 2961 aa-0.52□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 LRRC37A2A6NM11 1700 aa-0.52□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 KDM5CP41229 1560 aa-0.53□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 BICRAQ9NZM4 1560 aa-0.53□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 CUBNO60494 3623 aa-0.53□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 TEX15Q9BXT5 2789 aa-0.53□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 M0R135 149 aa-0.53□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 PPP1R17O96001 155 aa-0.53□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 MT-ND4LP03901 98 aa-0.53□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 PIRTP0C851 137 aa-0.53□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP-0.53□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 TMEM170BQ5T4T1 132 aa-0.53□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 TMEM244Q5VVB8 128 aa-0.53□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 SAMD13Q5VXD3 122 aa-0.53□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa-0.53□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 OR8I2Q8N0Y5 310 aa-0.53□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 SPTSSBQ8NFR3 76 aa-0.53□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 C10orf82Q8WW14 230 aa-0.53□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP-0.53□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 LAMA1P25391 3075 aa-0.53□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP-0.53□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 DNAH3Q8TD57 4116 aa-0.53□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 LRRC37A3O60309 1634 aa-0.53□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa-0.53□□□□□ -2.49
FAM227B-211ENST00000560557 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP-0.54□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 BIRC6Q9NR09 4857 aa-0.54□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 MYH6P13533 1939 aa-0.54□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa-0.54□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 ROCK1Q13464 1354 aa-0.54□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP-0.54□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 SBF2Q86WG5 1849 aa-0.54□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa-0.54□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 PIPP12273 146 aaPredicted RBP-0.54□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 CCL18P55774 89 aa-0.54□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 NCS1P62166 190 aa-0.54□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 UBE2G1P62253 170 aa-0.54□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 COX17Q14061 63 aa-0.54□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 Q6JHZ5 121 aa-0.54□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa-0.54□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 TCTE3Q8IZS6 198 aa-0.54□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 MNS1Q8NEH6 495 aa-0.54□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 VSTM2AQ8TAG5 236 aa-0.54□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa-0.54□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 LINC00472Q9H8W2 130 aa-0.54□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 SAR1AQ9NR31 198 aa-0.54□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 LINC00312Q9Y6C7 94 aa-0.54□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 TRANK1O15050 2925 aa-0.54□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 DOCK1Q14185 1865 aa-0.54□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 LRRK2Q5S007 2527 aa-0.55□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 DSPP15924 2871 aaKnown RBP-0.55□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 PRDM2Q13029 1718 aa-0.55□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 NWD2Q9ULI1 1742 aa-0.55□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP-0.55□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa-0.55□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 CLPSL1A2RUU4 121 aa-0.55□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 SNCGO76070 127 aa-0.55□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 NCR2O95944 276 aa-0.55□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 IFNGP01579 166 aa-0.55□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 COX8AP10176 69 aa-0.55□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 CBLN1P23435 193 aa-0.55□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 S100GP29377 79 aa-0.55□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 CMPK1P30085 196 aa-0.55□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 TMEM128Q5BJH2 165 aa-0.55□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 SCIMPQ6UWF3 145 aa-0.55□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 TOMM20LQ6UXN7 152 aa-0.55□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 MMGT1Q8N4V1 131 aa-0.55□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 DEFB123Q8N688 67 aa-0.55□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP-0.55□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 PCBD2Q9H0N5 130 aa-0.55□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP-0.55□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa-0.55□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 PKD1L2Q7Z442 2459 aa-0.55□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 RNF213Q63HN8 5207 aa-0.55□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 ZNF236Q9UL36 1845 aa-0.55□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 KALRNO60229 2985 aa-0.55□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP-0.55□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 ERCC6Q03468 1493 aa-0.55□□□□□ -2.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.4 ms