RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552253.1

PTPRB-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRB, Length 2,373 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-211ENST00000552253 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
PTPRB-211ENST00000552253 PSMB2P49721 201 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRB-211ENST00000552253 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
PTPRB-211ENST00000552253 FHL3Q13643 280 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRB-211ENST00000552253 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRB-211ENST00000552253 MUSTN1Q8IVN3 82 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRB-211ENST00000552253 TMEM61Q8N0U2 210 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRB-211ENST00000552253 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRB-211ENST00000552253 CDIP1Q9H305 208 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRB-211ENST00000552253 PRO1854Q9UHT4 67 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRB-211ENST00000552253 MXRA5Q9NR99 2828 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRB-211ENST00000552253 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
PTPRB-211ENST00000552253 CSMD2Q7Z408 3487 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRB-211ENST00000552253 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRB-211ENST00000552253 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRB-211ENST00000552253 A0A0J9YXY3 114 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRB-211ENST00000552253 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRB-211ENST00000552253 CD28P10747 220 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRB-211ENST00000552253 CRYBA4P53673 196 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRB-211ENST00000552253 BEAN1Q3B7T3 259 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRB-211ENST00000552253 ARL17AQ8IVW1 177 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRB-211ENST00000552253 LINC00467Q9BRT7 94 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRB-211ENST00000552253 CKS1BP61024 79 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRB-211ENST00000552253 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRB-211ENST00000552253 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRB-211ENST00000552253 DUX3Q96PT4 197 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRB-211ENST00000552253 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP4.28□□□□□ -1.72
PTPRB-211ENST00000552253 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRB-211ENST00000552253 A0A0B4J2C4 111 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRB-211ENST00000552253 HTN1P15515 57 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRB-211ENST00000552253 DEFB114Q30KQ6 69 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRB-211ENST00000552253 CFAP161Q6P656 301 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRB-211ENST00000552253 SPXQ9BT56 116 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRB-211ENST00000552253 MAP6D1Q9H9H5 199 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRB-211ENST00000552253 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRB-211ENST00000552253 A8MWV9 139 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRB-211ENST00000552253 A8MZ25 164 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRB-211ENST00000552253 RS1O15537 224 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRB-211ENST00000552253 PRB1P04280 392 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRB-211ENST00000552253 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
PTPRB-211ENST00000552253 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRB-211ENST00000552253 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
PTPRB-211ENST00000552253 RAX2Q96IS3 184 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRB-211ENST00000552253 LINC01600Q96MT4 127 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRB-211ENST00000552253 POLQO75417 2590 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRB-211ENST00000552253 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRB-211ENST00000552253 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRB-211ENST00000552253 IGHV3-53P01767 116 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRB-211ENST00000552253 TEN1Q86WV5 123 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRB-211ENST00000552253 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
PTPRB-211ENST00000552253 C4orf3Q8WVX3 66 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRB-211ENST00000552253 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
PTPRB-211ENST00000552253 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRB-211ENST00000552253 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
PTPRB-211ENST00000552253 LOC100996750A0A140TA64 210 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRB-211ENST00000552253 M0QXV9 152 aa4.26□□□□□ -1.73
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PTPRB-211ENST00000552253 VSIG2Q96IQ7 327 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRB-211ENST00000552253 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRB-211ENST00000552253 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
PTPRB-211ENST00000552253 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
PTPRB-211ENST00000552253 ZNF415Q09FC8 603 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRB-211ENST00000552253 ODF3L2Q3SX64 289 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRB-211ENST00000552253 Q6ZUT4 128 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRB-211ENST00000552253 C1orf158Q8N1D5 194 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRB-211ENST00000552253 IL17DQ8TAD2 202 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRB-211ENST00000552253 TIMM21Q9BVV7 248 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRB-211ENST00000552253 ERG28Q9UKR5 140 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRB-211ENST00000552253 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRB-211ENST00000552253 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRB-211ENST00000552253 FAM229AH3BQW9 127 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRB-211ENST00000552253 ANKRD29Q8N6D5 301 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRB-211ENST00000552253 DNAJC30Q96LL9 226 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRB-211ENST00000552253 LINC01587Q99440 93 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRB-211ENST00000552253 SPANXDQ9BXN6 97 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRB-211ENST00000552253 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
PTPRB-211ENST00000552253 SPANXCQ9NY87 97 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRB-211ENST00000552253 PEMTQ9UBM1 199 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRB-211ENST00000552253 CREBBPQ92793 2442 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRB-211ENST00000552253 TEX15Q9BXT5 2789 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRB-211ENST00000552253 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRB-211ENST00000552253 SPINK8P0C7L1 97 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRB-211ENST00000552253 SCGB1C2P0DMR2 95 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRB-211ENST00000552253 XGP55808 180 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRB-211ENST00000552253 COX6A2Q02221 97 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRB-211ENST00000552253 NDUFA12Q9UI09 145 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRB-211ENST00000552253 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRB-211ENST00000552253 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRB-211ENST00000552253 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP4.24□□□□□ -1.73
PTPRB-211ENST00000552253 TRIAP1O43715 76 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRB-211ENST00000552253 MT-ATP8P03928 68 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRB-211ENST00000552253 TIRAPP58753 221 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRB-211ENST00000552253 DEFB113Q30KQ7 82 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRB-211ENST00000552253 ZFAND6Q6FIF0 208 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRB-211ENST00000552253 Q6ZSV7 163 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRB-211ENST00000552253 RNF183Q96D59 192 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRB-211ENST00000552253 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRB-211ENST00000552253 C9JAW5 83 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRB-211ENST00000552253 SLC25A20O43772 301 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRB-211ENST00000552253 LINC00694P0DN24 101 aa4.24□□□□□ -1.73
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