RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551936.5

CS-229, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 744 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-229ENST00000551936 A0A1B0GUV1 79 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-229ENST00000551936 K7EN84 100 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-229ENST00000551936 CTRLP40313 264 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-229ENST00000551936 C9orf163Q8N9P6 203 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-229ENST00000551936 CNFNQ9BYD5 112 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-229ENST00000551936 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
CS-229ENST00000551936 TWIST1Q15672 202 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-229ENST00000551936 TMEM243Q9BU79 118 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-229ENST00000551936 GFRA4Q9GZZ7 299 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-229ENST00000551936 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa9.33□□□□□ -0.92
CS-229ENST00000551936 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa9.33□□□□□ -0.92
CS-229ENST00000551936 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
CS-229ENST00000551936 GATD1Q8NB37 220 aa9.32□□□□□ -0.92
CS-229ENST00000551936 CLRN3Q8NCR9 226 aa9.32□□□□□ -0.92
CS-229ENST00000551936 COTL1Q14019 142 aa9.31□□□□□ -0.92
CS-229ENST00000551936 SDIM1Q6ZPB5 146 aa9.31□□□□□ -0.92
CS-229ENST00000551936 GTSF1Q8WW33 167 aa9.31□□□□□ -0.92
CS-229ENST00000551936 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-229ENST00000551936 UBE2L6O14933 153 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-229ENST00000551936 TEX261Q6UWH6 196 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-229ENST00000551936 LYPD6BQ8NI32 183 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-229ENST00000551936 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
CS-229ENST00000551936 TMEM250H0YL14 139 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-229ENST00000551936 PANO1I0J062 215 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-229ENST00000551936 AMTP48728 403 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-229ENST00000551936 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
CS-229ENST00000551936 CNBPP62633 177 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CS-229ENST00000551936 BLOC1S1P78537 153 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-229ENST00000551936 GATCO43716 136 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
CS-229ENST00000551936 SLPIP03973 132 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-229ENST00000551936 FAM231DQ6ZW35 169 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-229ENST00000551936 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
CS-229ENST00000551936 hDV102S1A0JD36 115 aa9.27□□□□□ -0.93
CS-229ENST00000551936 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
CS-229ENST00000551936 NCR2O95944 276 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-229ENST00000551936 OXTP01178 125 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-229ENST00000551936 SMIM15Q7Z3B0 74 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-229ENST00000551936 A8MWL6 223 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-229ENST00000551936 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
CS-229ENST00000551936 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
CS-229ENST00000551936 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
CS-229ENST00000551936 GAGE12HA6NDE8 117 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-229ENST00000551936 SDHAF1A6NFY7 115 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-229ENST00000551936 H7C423 109 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-229ENST00000551936 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
CS-229ENST00000551936 CT83Q5H943 113 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-229ENST00000551936 C15orf56Q8N910 161 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-229ENST00000551936 AP5S1Q9NUS5 200 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-229ENST00000551936 HMCN2Q8NDA2 5059 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-229ENST00000551936 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-229ENST00000551936 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
CS-229ENST00000551936 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-229ENST00000551936 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-229ENST00000551936 APCSP02743 223 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-229ENST00000551936 CEBPGP53567 150 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-229ENST00000551936 FAM231BA6NCW3 169 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-229ENST00000551936 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
CS-229ENST00000551936 GAS8-AS1O95177 125 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-229ENST00000551936 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-229ENST00000551936 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
CS-229ENST00000551936 I3L3M4 83 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-229ENST00000551936 FGF6P10767 208 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-229ENST00000551936 PMCHP20382 165 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-229ENST00000551936 RAB14P61106 215 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-229ENST00000551936 IFITM2Q01629 132 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-229ENST00000551936 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
CS-229ENST00000551936 CFAP161Q6P656 301 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-229ENST00000551936 LINC01551Q86U37 167 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-229ENST00000551936 FAM210AQ96ND0 272 aa9.21□□□□□ -0.94
CS-229ENST00000551936 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
CS-229ENST00000551936 SRP19P09132 144 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
CS-229ENST00000551936 CHTF8P0CG12 524 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-229ENST00000551936 ESDP10768 282 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-229ENST00000551936 TSKUQ8WUA8 353 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-229ENST00000551936 RNF185Q96GF1 192 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-229ENST00000551936 SMIM7Q9BQ49 75 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-229ENST00000551936 TMEM191AQ9H0A3 160 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-229ENST00000551936 OSTCQ9NRP0 149 aa9.2□□□□□ -0.94
CS-229ENST00000551936 A0A087WYN8 130 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-229ENST00000551936 A0A1B0GUT8 65 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-229ENST00000551936 HIGD1CA8MV81 97 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-229ENST00000551936 TSHBP01222 138 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-229ENST00000551936 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
CS-229ENST00000551936 RAB4AP20338 218 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-229ENST00000551936 RPS10P46783 165 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
CS-229ENST00000551936 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
CS-229ENST00000551936 HIGD2BQ4VC39 106 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-229ENST00000551936 OR5A1Q8NGJ0 315 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-229ENST00000551936 SPACA4Q8TDM5 124 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-229ENST00000551936 BORCS7Q96B45 105 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-229ENST00000551936 DPH3Q96FX2 82 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-229ENST00000551936 ST20Q9HBF5 79 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-229ENST00000551936 ZNF727A8MUV8 499 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-229ENST00000551936 FOXI1Q12951 378 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-229ENST00000551936 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-229ENST00000551936 COX6A2Q02221 97 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-229ENST00000551936 BTF3L4Q96K17 158 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-229ENST00000551936 TMEM242Q9NWH2 141 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-229ENST00000551936 PLAC8Q9NZF1 115 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-229ENST00000551936 V9GYV3 84 aa9.17□□□□□ -0.94
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