RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 C18orf32Q8TCD1 76 aa6.5□□□□□ -1.37
CS-220ENST00000550700 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CS-220ENST00000550700 A0A096LPF7 62 aa6.49□□□□□ -1.37
CS-220ENST00000550700 LINC01546A6NGU7 62 aa6.49□□□□□ -1.37
CS-220ENST00000550700 NUDT3O95989 172 aa6.49□□□□□ -1.37
CS-220ENST00000550700 LINC00614P0C842 121 aa6.49□□□□□ -1.37
CS-220ENST00000550700 CCL18P55774 89 aa6.49□□□□□ -1.37
CS-220ENST00000550700 AP5S1Q9NUS5 200 aa6.49□□□□□ -1.37
CS-220ENST00000550700 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-220ENST00000550700 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-220ENST00000550700 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-220ENST00000550700 HIST1H2BKO60814 126 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-220ENST00000550700 HIST1H2BJP06899 126 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-220ENST00000550700 P0DMU3 169 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-220ENST00000550700 FAM231AP0DMU4 169 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-220ENST00000550700 FAM231CP0DMU5 169 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-220ENST00000550700 HIST1H2BOP23527 126 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-220ENST00000550700 HIST1H2BBP33778 126 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-220ENST00000550700 HIST1H2BDP58876 126 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-220ENST00000550700 HIST1H2BCP62807 126 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-220ENST00000550700 LAGE3Q14657 143 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-220ENST00000550700 HIST2H2BEQ16778 126 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-220ENST00000550700 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
CS-220ENST00000550700 HIST1H2BHQ93079 126 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-220ENST00000550700 HIST1H2BNQ99877 126 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-220ENST00000550700 HIST1H2BMQ99879 126 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-220ENST00000550700 TGP01266 2768 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-220ENST00000550700 DNAH9Q9NYC9 4486 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-220ENST00000550700 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-220ENST00000550700 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-220ENST00000550700 GAS8-AS1O95177 125 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-220ENST00000550700 S100A6P06703 90 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-220ENST00000550700 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CS-220ENST00000550700 IQCJQ1A5X6 159 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-220ENST00000550700 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CS-220ENST00000550700 LELP1Q5T871 98 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-220ENST00000550700 LYPD5Q6UWN5 251 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-220ENST00000550700 NIT1Q86X76 327 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-220ENST00000550700 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-220ENST00000550700 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-220ENST00000550700 K7EP13 123 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-220ENST00000550700 UBE2L6O14933 153 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-220ENST00000550700 HSBP1O75506 76 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-220ENST00000550700 NPSP0C0P6 89 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-220ENST00000550700 AMTP48728 403 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-220ENST00000550700 Q8N3U1 123 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-220ENST00000550700 TMEM243Q9BU79 118 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-220ENST00000550700 CHCHD7Q9BUK0 85 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-220ENST00000550700 APLNQ9ULZ1 77 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-220ENST00000550700 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CS-220ENST00000550700 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CS-220ENST00000550700 TSHBP01222 138 aa6.45□□□□□ -1.38
CS-220ENST00000550700 ESDP10768 282 aa6.45□□□□□ -1.38
CS-220ENST00000550700 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CS-220ENST00000550700 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa6.45□□□□□ -1.38
CS-220ENST00000550700 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CS-220ENST00000550700 TIMM21Q9BVV7 248 aa6.45□□□□□ -1.38
CS-220ENST00000550700 Q9UF83 564 aa6.45□□□□□ -1.38
CS-220ENST00000550700 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-220ENST00000550700 HBDP02042 147 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-220ENST00000550700 C20orf203Q8NBC4 194 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-220ENST00000550700 TMEM101Q96IK0 257 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-220ENST00000550700 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
CS-220ENST00000550700 CHCHD5Q9BSY4 110 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-220ENST00000550700 UPK3BQ9BT76 320 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-220ENST00000550700 CYSLTR1Q9Y271 337 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-220ENST00000550700 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CS-220ENST00000550700 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CS-220ENST00000550700 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-220ENST00000550700 A0A1B0GUV1 79 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-220ENST00000550700 BTF3P20290 206 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CS-220ENST00000550700 NDUFA6P56556 154 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-220ENST00000550700 ESRGQ1W209 222 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-220ENST00000550700 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-220ENST00000550700 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-220ENST00000550700 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-220ENST00000550700 SPANXA1Q9NS26 97 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-220ENST00000550700 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-220ENST00000550700 A0A087WX48 190 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-220ENST00000550700 SERF1AO75920 110 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-220ENST00000550700 ATP5LO75964 103 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-220ENST00000550700 CASC10Q5T4H9 136 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-220ENST00000550700 ZFAND6Q6FIF0 208 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-220ENST00000550700 C2orf66Q6UXQ4 117 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-220ENST00000550700 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-220ENST00000550700 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
CS-220ENST00000550700 TOMM6Q96B49 74 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-220ENST00000550700 TMEM141Q96I45 108 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-220ENST00000550700 S100A2P29034 98 aa6.41□□□□□ -1.38
CS-220ENST00000550700 LGALS9CQ6DKI2 356 aa6.41□□□□□ -1.38
CS-220ENST00000550700 ERASQ7Z444 233 aa6.41□□□□□ -1.38
CS-220ENST00000550700 C10orf126Q8N4M7 172 aa6.41□□□□□ -1.38
CS-220ENST00000550700 TIMM17AQ99595 171 aa6.41□□□□□ -1.38
CS-220ENST00000550700 HSPB8Q9UJY1 196 aa6.41□□□□□ -1.38
CS-220ENST00000550700 TMEM262E9PQX1 116 aa6.4□□□□□ -1.38
CS-220ENST00000550700 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
CS-220ENST00000550700 SIVA1O15304 175 aa6.4□□□□□ -1.38
CS-220ENST00000550700 CCL25O15444 150 aa6.4□□□□□ -1.38
CS-220ENST00000550700 FGF6P10767 208 aa6.4□□□□□ -1.38
CS-220ENST00000550700 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
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