RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549308.5

PTPRR-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 1,603 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-209ENST00000549308 SCGB1D1O95968 90 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRR-209ENST00000549308 GYPEP15421 78 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRR-209ENST00000549308 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRR-209ENST00000549308 PYY3Q5JQD4 70 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRR-209ENST00000549308 IFI27L1Q96BM0 104 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRR-209ENST00000549308 H0Y8G0 127 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRR-209ENST00000549308 ATP5LO75964 103 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRR-209ENST00000549308 SMIM6P0DI80 62 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRR-209ENST00000549308 C11orf45Q8TAV5 145 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRR-209ENST00000549308 SCGB3A1Q96QR1 104 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRR-209ENST00000549308 B9D2Q9BPU9 175 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRR-209ENST00000549308 NOTCH1P46531 2555 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRR-209ENST00000549308 MGAM2Q2M2H8 2515 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRR-209ENST00000549308 LINC01549A6NIU2 74 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRR-209ENST00000549308 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRR-209ENST00000549308 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRR-209ENST00000549308 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRR-209ENST00000549308 LINC00694P0DN24 101 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRR-209ENST00000549308 RPL39P62891 51 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRR-209ENST00000549308 Q6ZTC4 211 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRR-209ENST00000549308 C20orf203Q8NBC4 194 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRR-209ENST00000549308 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPRR-209ENST00000549308 C20orf202A1L168 122 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRR-209ENST00000549308 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
PTPRR-209ENST00000549308 DEFA6Q01524 100 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRR-209ENST00000549308 PET117Q6UWS5 81 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRR-209ENST00000549308 Q6ZN92 141 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRR-209ENST00000549308 LINC00518Q8N0U6 118 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRR-209ENST00000549308 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRR-209ENST00000549308 VSIG2Q96IQ7 327 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRR-209ENST00000549308 CHCHD7Q9BUK0 85 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRR-209ENST00000549308 PRSS1P07477 247 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRR-209ENST00000549308 ERASQ7Z444 233 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRR-209ENST00000549308 C12orf57Q99622 126 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRR-209ENST00000549308 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
PTPRR-209ENST00000549308 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
PTPRR-209ENST00000549308 TMEM97Q5BJF2 176 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRR-209ENST00000549308 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRR-209ENST00000549308 SPATA12Q7Z6I5 190 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRR-209ENST00000549308 Q8N976 141 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRR-209ENST00000549308 GTSF1LQ9H1H1 148 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRR-209ENST00000549308 ICOSQ9Y6W8 199 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRR-209ENST00000549308 A0A096LPF7 62 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRR-209ENST00000549308 TMEM141Q96I45 108 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRR-209ENST00000549308 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRR-209ENST00000549308 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRR-209ENST00000549308 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRR-209ENST00000549308 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
PTPRR-209ENST00000549308 CDPF1Q6NVV7 123 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRR-209ENST00000549308 TIMM17AQ99595 171 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRR-209ENST00000549308 TMEM243Q9BU79 118 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRR-209ENST00000549308 IGIPA6NJ69 53 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRR-209ENST00000549308 UBE2L6O14933 153 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRR-209ENST00000549308 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
PTPRR-209ENST00000549308 LGALS9CQ6DKI2 356 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRR-209ENST00000549308 BAALCQ8WXS3 180 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRR-209ENST00000549308 PMCHL2Q9BQD1 86 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRR-209ENST00000549308 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRR-209ENST00000549308 TRAV10A0A0B4J240 114 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRR-209ENST00000549308 LINC01545Q5VT33 79 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRR-209ENST00000549308 ATOH7Q8N100 152 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRR-209ENST00000549308 SPANXA1Q9NS26 97 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRR-209ENST00000549308 SMAGPQ0VAQ4 97 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRR-209ENST00000549308 SH2D6Q7Z4S9 175 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRR-209ENST00000549308 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRR-209ENST00000549308 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRR-209ENST00000549308 A0A087WX48 190 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPRR-209ENST00000549308 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPRR-209ENST00000549308 H3BNG1 76 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPRR-209ENST00000549308 S100A12P80511 92 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPRR-209ENST00000549308 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPRR-209ENST00000549308 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPRR-209ENST00000549308 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.07
PTPRR-209ENST00000549308 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.07
PTPRR-209ENST00000549308 CHCHD5Q9BSY4 110 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPRR-209ENST00000549308 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRR-209ENST00000549308 FGF6P10767 208 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRR-209ENST00000549308 GAGE6Q13070 117 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRR-209ENST00000549308 ODF1Q14990 250 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRR-209ENST00000549308 PMVKQ15126 192 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRR-209ENST00000549308 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRR-209ENST00000549308 TEX43Q6ZNM6 134 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRR-209ENST00000549308 TIMM21Q9BVV7 248 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRR-209ENST00000549308 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PTPRR-209ENST00000549308 PRSS29PA6NIE9 313 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRR-209ENST00000549308 H7C423 109 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRR-209ENST00000549308 NPSP0C0P6 89 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRR-209ENST00000549308 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRR-209ENST00000549308 TMEM101Q96IK0 257 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRR-209ENST00000549308 VCX2Q9H322 139 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRR-209ENST00000549308 Q6ZUT4 128 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRR-209ENST00000549308 VAMP8Q9BV40 100 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRR-209ENST00000549308 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
PTPRR-209ENST00000549308 DPM2O94777 84 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRR-209ENST00000549308 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
PTPRR-209ENST00000549308 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
PTPRR-209ENST00000549308 OR5A1Q8NGJ0 315 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRR-209ENST00000549308 CST9LQ9H4G1 147 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRR-209ENST00000549308 TENM3Q9P273 2699 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRR-209ENST00000549308 F8VRH5 84 aa8.36□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.2 ms