RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549221.5

CS-216, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-216ENST00000549221 NUPR2A6NF83 97 aa5.61□□□□□ -1.51
CS-216ENST00000549221 LINC01546A6NGU7 62 aa5.61□□□□□ -1.51
CS-216ENST00000549221 I3L3M4 83 aa5.61□□□□□ -1.51
CS-216ENST00000549221 VCYO14598 125 aa5.61□□□□□ -1.51
CS-216ENST00000549221 SERF1AO75920 110 aa5.61□□□□□ -1.51
CS-216ENST00000549221 PMCHP20382 165 aa5.61□□□□□ -1.51
CS-216ENST00000549221 ESRGQ1W209 222 aa5.61□□□□□ -1.51
CS-216ENST00000549221 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
CS-216ENST00000549221 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
CS-216ENST00000549221 NIT1Q86X76 327 aa5.61□□□□□ -1.51
CS-216ENST00000549221 Q8N8P6 123 aa5.61□□□□□ -1.51
CS-216ENST00000549221 CHCHD7Q9BUK0 85 aa5.61□□□□□ -1.51
CS-216ENST00000549221 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
CS-216ENST00000549221 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
CS-216ENST00000549221 A0A096LNJ9 63 aa5.6□□□□□ -1.51
CS-216ENST00000549221 NDUFA6P56556 154 aa5.6□□□□□ -1.51
CS-216ENST00000549221 RAB5BP61020 215 aa5.6□□□□□ -1.51
CS-216ENST00000549221 COTL1Q14019 142 aa5.6□□□□□ -1.51
CS-216ENST00000549221 PMCHL1Q16048 86 aa5.6□□□□□ -1.51
CS-216ENST00000549221 LYPD5Q6UWN5 251 aa5.6□□□□□ -1.51
CS-216ENST00000549221 BAGE3Q86Y29 109 aa5.6□□□□□ -1.51
CS-216ENST00000549221 C15orf53Q8NAA6 179 aa5.6□□□□□ -1.51
CS-216ENST00000549221 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa5.6□□□□□ -1.51
CS-216ENST00000549221 GTSF1LQ9H1H1 148 aa5.6□□□□□ -1.51
CS-216ENST00000549221 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
CS-216ENST00000549221 TENM2Q9NT68 2774 aa5.59□□□□□ -1.51
CS-216ENST00000549221 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa5.59□□□□□ -1.51
CS-216ENST00000549221 LINC00614P0C842 121 aa5.59□□□□□ -1.51
CS-216ENST00000549221 ESDP10768 282 aa5.59□□□□□ -1.51
CS-216ENST00000549221 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
CS-216ENST00000549221 FA2HQ7L5A8 372 aa5.59□□□□□ -1.51
CS-216ENST00000549221 Q8N3U1 123 aa5.59□□□□□ -1.51
CS-216ENST00000549221 KIR2DL4Q99706 377 aa5.59□□□□□ -1.51
CS-216ENST00000549221 AP5S1Q9NUS5 200 aa5.59□□□□□ -1.51
CS-216ENST00000549221 VPS13DQ5THJ4 4388 aa5.59□□□□□ -1.52
CS-216ENST00000549221 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
CS-216ENST00000549221 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
CS-216ENST00000549221 FCER1GP30273 86 aa5.58□□□□□ -1.52
CS-216ENST00000549221 AMTP48728 403 aa5.58□□□□□ -1.52
CS-216ENST00000549221 TIRAPP58753 221 aa5.58□□□□□ -1.52
CS-216ENST00000549221 RPL39P62891 51 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
CS-216ENST00000549221 SH2D6Q7Z4S9 175 aa5.58□□□□□ -1.52
CS-216ENST00000549221 WFDC10BQ8IUB3 73 aa5.58□□□□□ -1.52
CS-216ENST00000549221 FAM19A2Q8N3H0 131 aa5.58□□□□□ -1.52
CS-216ENST00000549221 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
CS-216ENST00000549221 LINC00588Q9Y4M8 146 aa5.58□□□□□ -1.52
CS-216ENST00000549221 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa5.57□□□□□ -1.52
CS-216ENST00000549221 LAGE3Q14657 143 aa5.57□□□□□ -1.52
CS-216ENST00000549221 PDZD11Q5EBL8 140 aa5.57□□□□□ -1.52
CS-216ENST00000549221 CASC10Q5T4H9 136 aa5.57□□□□□ -1.52
CS-216ENST00000549221 LELP1Q5T871 98 aa5.57□□□□□ -1.52
CS-216ENST00000549221 LINC00173Q6ZV60 143 aa5.57□□□□□ -1.52
CS-216ENST00000549221 C20orf203Q8NBC4 194 aa5.57□□□□□ -1.52
CS-216ENST00000549221 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
CS-216ENST00000549221 TMEM243Q9BU79 118 aa5.57□□□□□ -1.52
CS-216ENST00000549221 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa5.56□□□□□ -1.52
CS-216ENST00000549221 IFITM10A6NMD0 228 aa5.56□□□□□ -1.52
CS-216ENST00000549221 HSBP1O75506 76 aa5.56□□□□□ -1.52
CS-216ENST00000549221 BTF3P20290 206 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
CS-216ENST00000549221 GAGE6Q13070 117 aa5.56□□□□□ -1.52
CS-216ENST00000549221 ORMDL2Q53FV1 153 aa5.56□□□□□ -1.52
CS-216ENST00000549221 C2orf66Q6UXQ4 117 aa5.56□□□□□ -1.52
CS-216ENST00000549221 FAM104AQ969W3 186 aa5.56□□□□□ -1.52
CS-216ENST00000549221 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
CS-216ENST00000549221 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa5.55□□□□□ -1.52
CS-216ENST00000549221 C5orf52A6NGY3 159 aa5.55□□□□□ -1.52
CS-216ENST00000549221 K7EMI3 77 aa5.55□□□□□ -1.52
CS-216ENST00000549221 FGF6P10767 208 aa5.55□□□□□ -1.52
CS-216ENST00000549221 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
CS-216ENST00000549221 MPV17L2Q567V2 206 aa5.55□□□□□ -1.52
CS-216ENST00000549221 TMEM97Q5BJF2 176 aa5.55□□□□□ -1.52
CS-216ENST00000549221 HIST3H2BBQ8N257 126 aa5.55□□□□□ -1.52
CS-216ENST00000549221 TOMM6Q96B49 74 aa5.55□□□□□ -1.52
CS-216ENST00000549221 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
CS-216ENST00000549221 CHCHD5Q9BSY4 110 aa5.55□□□□□ -1.52
CS-216ENST00000549221 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa5.55□□□□□ -1.52
CS-216ENST00000549221 ALMS1Q8TCU4 4167 aa5.55□□□□□ -1.52
CS-216ENST00000549221 IGIPA6NJ69 53 aa5.54□□□□□ -1.52
CS-216ENST00000549221 C3orf84H3BNL1 204 aa5.54□□□□□ -1.52
CS-216ENST00000549221 HBDP02042 147 aa5.54□□□□□ -1.52
CS-216ENST00000549221 CCL18P55774 89 aa5.54□□□□□ -1.52
CS-216ENST00000549221 TCTAP57738 103 aa5.54□□□□□ -1.52
CS-216ENST00000549221 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
CS-216ENST00000549221 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa5.54□□□□□ -1.52
CS-216ENST00000549221 Q8N976 141 aa5.54□□□□□ -1.52
CS-216ENST00000549221 CYSLTR1Q9Y271 337 aa5.54□□□□□ -1.52
CS-216ENST00000549221 IGHV3-30P01768 117 aa5.53□□□□□ -1.52
CS-216ENST00000549221 IGHV3-33P01772 117 aa5.53□□□□□ -1.52
CS-216ENST00000549221 S100A6P06703 90 aa5.53□□□□□ -1.52
CS-216ENST00000549221 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa5.53□□□□□ -1.52
CS-216ENST00000549221 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa5.53□□□□□ -1.52
CS-216ENST00000549221 RBX1P62877 108 aa5.53□□□□□ -1.52
CS-216ENST00000549221 Q6ZUT4 128 aa5.53□□□□□ -1.52
CS-216ENST00000549221 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
CS-216ENST00000549221 UPK3BQ9BT76 320 aa5.53□□□□□ -1.52
CS-216ENST00000549221 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa5.52□□□□□ -1.53
CS-216ENST00000549221 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa5.52□□□□□ -1.53
CS-216ENST00000549221 TMEM262E9PQX1 116 aa5.52□□□□□ -1.53
CS-216ENST00000549221 UBE2L6O14933 153 aa5.52□□□□□ -1.53
CS-216ENST00000549221 DNAH10OSP0CZ25 163 aa5.52□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 86.7 ms