RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544125.1

MDM2-231, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 2

Gene MDM2, Length 649 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-231	ENST00000544125		Q96NJ1	140 aa		0.27	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	AMELX	Q99217	191 aa		0.27	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		0.27	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	DYNLRB1	Q9NP97	96 aa		0.27	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125		V9GYH0	126 aa		0.27	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		0.27	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		0.27	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		0.27	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		0.26	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	PI4KA	P42356	2102 aa		0.26	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	GOLGA4	Q13439	2230 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	MAST4	O15021	2626 aa		0.26	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		0.26	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	TMEM218	A2RU14	115 aa		0.26	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	CLPSL1	A2RUU4	121 aa		0.26	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	OOSP1	A8MZH6	123 aa		0.26	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	TMEM262	E9PQX1	116 aa		0.26	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125		F8VRH5	84 aa		0.26	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125		M0R135	149 aa		0.26	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	APOC3	P02656	99 aa		0.26	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	SPINK8	P0C7L1	97 aa		0.26	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	CCL18	P55774	89 aa		0.26	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	GNG11	P61952	73 aa		0.26	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	COX6A2	Q02221	97 aa		0.26	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	HSD52	Q0P140	79 aa		0.26	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	COX17	Q14061	63 aa		0.26	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	BAGE2	Q86Y30	109 aa		0.26	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		0.26	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	UQCR10	Q9UDW1	63 aa		0.26	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		0.26	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		0.26	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		0.26	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	CASZ1	Q86V15	1759 aa		0.26	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	F5	P12259	2224 aa		0.25	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	PXDN	Q92626	1479 aa		0.25	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	MBD5	Q9P267	1494 aa		0.25	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		0.25	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	TRAV1-2	A0A0B4J238	106 aa		0.25	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	NAP1L6	A6NFF2	107 aa		0.25	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	ATP6V1G2-DDX39B	F2Z307	99 aa		0.25	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	CHKB-CPT1B	H3BT56	60 aa		0.25	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	UQCR11	O14957	56 aa		0.25	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	NMB	P08949	121 aa		0.25	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		0.25	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		0.25	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	ACBD7	Q8N6N7	88 aa		0.25	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		0.25	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	JMJD1C	Q15652	2540 aa		0.25	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	AHCTF1	Q8WYP5	2266 aa		0.25	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	MYH6	P13533	1939 aa		0.25	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		0.25	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		0.24	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	MAPKBP1	O60336	1514 aa		0.24	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		0.24	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	ASXL3	Q9C0F0	2248 aa		0.24	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	TRAV30	A0A087WSZ9	112 aa		0.24	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	IGLC7	A0M8Q6	106 aa		0.24	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	HMGN4	O00479	90 aa		0.24	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	SFT2D2	O95562	160 aa		0.24	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	COX6C	P09669	75 aa		0.24	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	LINC00032	P0C843	101 aa		0.24	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	TRAPPC2	P0DI81	140 aa		0.24	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	TRAPPC2B	P0DI82	140 aa		0.24	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	SNCA	P37840	140 aa		0.24	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	RBP2	P50120	134 aa		0.24	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	C14orf144	Q96I85	54 aa		0.24	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		0.24	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	C12orf57	Q99622	126 aa		0.24	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	NXT2	Q9NPJ8	142 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	NDUFA4L2	Q9NRX3	87 aa		0.24	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	FAIM	Q9NVQ4	179 aa		0.24	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	AP4S1	Q9Y587	144 aa		0.24	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	LINC01558	Q9Y6Z2	57 aa		0.24	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		0.24	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	SPTBN2	O15020	2390 aa		0.24	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	CACNA1H	O95180	2353 aa		0.24	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	LRRC37A3	O60309	1634 aa		0.24	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		0.23	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	MYOM2	P54296	1465 aa		0.23	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		0.23	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	ZNF609	O15014	1411 aa		0.23	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		0.23	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	MYH9	P35579	1960 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	PLXNA2	O75051	1894 aa		0.23	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		0.23	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	F8	P00451	2351 aa		0.23	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	ZNF815P	A8K554	130 aa		0.23	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	NDUFC1	O43677	76 aa		0.23	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	MGP	P08493	103 aa		0.23	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		0.23	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	CNFN	Q9BYD5	112 aa		0.23	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	MANBAL	Q9NQG1	85 aa		0.23	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		0.23	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		0.23	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	PRO1854	Q9UHT4	67 aa		0.23	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	SPCS1	Q9Y6A9	102 aa		0.23	□□□□□ -2.37
MDM2-231	ENST00000544125	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		0.22	□□□□□ -2.37

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