RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 OR11H2Q8NH07 326 aa14.61□□□□□ -0.07
PACSIN3-211ENST00000539589 IGHV3-53P01767 116 aa14.61□□□□□ -0.07
PACSIN3-211ENST00000539589 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
PACSIN3-211ENST00000539589 Q6ZSN1 163 aa14.61□□□□□ -0.07
PACSIN3-211ENST00000539589 A6NDN8 102 aa14.6□□□□□ -0.07
PACSIN3-211ENST00000539589 IL17DQ8TAD2 202 aa14.6□□□□□ -0.07
PACSIN3-211ENST00000539589 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PACSIN3-211ENST00000539589 CHAC1Q9BUX1 264 aa14.6□□□□□ -0.07
PACSIN3-211ENST00000539589 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa14.59□□□□□ -0.07
PACSIN3-211ENST00000539589 E9PLD3 99 aa14.59□□□□□ -0.07
PACSIN3-211ENST00000539589 C3orf56Q8N813 242 aa14.59□□□□□ -0.07
PACSIN3-211ENST00000539589 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa14.59□□□□□ -0.07
PACSIN3-211ENST00000539589 DNAJC30Q96LL9 226 aa14.59□□□□□ -0.07
PACSIN3-211ENST00000539589 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa14.59□□□□□ -0.07
PACSIN3-211ENST00000539589 NPSP0C0P6 89 aa14.59□□□□□ -0.07
PACSIN3-211ENST00000539589 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PACSIN3-211ENST00000539589 ANK2Q01484 3957 aa14.59□□□□□ -0.07
PACSIN3-211ENST00000539589 C11orf86A6NJI1 115 aa14.58□□□□□ -0.08
PACSIN3-211ENST00000539589 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
PACSIN3-211ENST00000539589 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa14.58□□□□□ -0.08
PACSIN3-211ENST00000539589 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa14.58□□□□□ -0.08
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PACSIN3-211ENST00000539589 PRADC1Q9BSG0 188 aa14.56□□□□□ -0.08
PACSIN3-211ENST00000539589 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa14.56□□□□□ -0.08
PACSIN3-211ENST00000539589 EMP1P54849 157 aa14.56□□□□□ -0.08
PACSIN3-211ENST00000539589 HERVK_113P61574 105 aa14.56□□□□□ -0.08
PACSIN3-211ENST00000539589 Q9UF83 564 aa14.56□□□□□ -0.08
PACSIN3-211ENST00000539589 SHISA2Q6UWI4 295 aa14.55□□□□□ -0.08
PACSIN3-211ENST00000539589 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
PACSIN3-211ENST00000539589 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa14.55□□□□□ -0.08
PACSIN3-211ENST00000539589 WIPF1O43516 503 aa14.54□□□□□ -0.08
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PACSIN3-211ENST00000539589 VAMP3Q15836 100 aa14.54□□□□□ -0.08
PACSIN3-211ENST00000539589 DNAH3Q8TD57 4116 aa14.54□□□□□ -0.08
PACSIN3-211ENST00000539589 H3BRM9 83 aa14.53□□□□□ -0.08
PACSIN3-211ENST00000539589 UBE2V1Q13404 147 aa14.53□□□□□ -0.08
PACSIN3-211ENST00000539589 VCX2Q9H322 139 aa14.53□□□□□ -0.08
PACSIN3-211ENST00000539589 NACAE9PAV3 2078 aa14.53□□□□□ -0.08
PACSIN3-211ENST00000539589 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa14.53□□□□□ -0.08
PACSIN3-211ENST00000539589 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
PACSIN3-211ENST00000539589 NFE4Q86UQ8 179 aa14.53□□□□□ -0.08
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNRF2Q8NHG8 242 aa14.53□□□□□ -0.08
PACSIN3-211ENST00000539589 C16orf74Q96GX8 76 aa14.53□□□□□ -0.08
PACSIN3-211ENST00000539589 PTTG1IPP53801 180 aa14.52□□□□□ -0.09
PACSIN3-211ENST00000539589 TAL2Q16559 108 aa14.52□□□□□ -0.09
PACSIN3-211ENST00000539589 TMEM170BQ5T4T1 132 aa14.52□□□□□ -0.09
PACSIN3-211ENST00000539589 Q6ZTI0 123 aa14.52□□□□□ -0.09
PACSIN3-211ENST00000539589 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa14.52□□□□□ -0.09
PACSIN3-211ENST00000539589 CEND1Q8N111 149 aa14.51□□□□□ -0.09
PACSIN3-211ENST00000539589 TM2D2Q9BX73 214 aa14.51□□□□□ -0.09
PACSIN3-211ENST00000539589 TRAV4A0A0B4J268 109 aa14.51□□□□□ -0.09
PACSIN3-211ENST00000539589 COTL1Q14019 142 aa14.51□□□□□ -0.09
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF479Q96JC4 524 aa14.51□□□□□ -0.09
PACSIN3-211ENST00000539589 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
PACSIN3-211ENST00000539589 CRYBA4P53673 196 aa14.5□□□□□ -0.09
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PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF815PA8K554 130 aa14.49□□□□□ -0.09
PACSIN3-211ENST00000539589 FXYD2P54710 66 aa14.49□□□□□ -0.09
PACSIN3-211ENST00000539589 CCL25O15444 150 aa14.49□□□□□ -0.09
PACSIN3-211ENST00000539589 OXLD1Q5BKU9 147 aa14.49□□□□□ -0.09
PACSIN3-211ENST00000539589 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
PACSIN3-211ENST00000539589 HIST1H4GQ99525 98 aa14.49□□□□□ -0.09
PACSIN3-211ENST00000539589 SPANXA1Q9NS26 97 aa14.49□□□□□ -0.09
PACSIN3-211ENST00000539589 RRN3P1Q2M238 152 aa14.48□□□□□ -0.09
PACSIN3-211ENST00000539589 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa14.48□□□□□ -0.09
PACSIN3-211ENST00000539589 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa14.48□□□□□ -0.09
PACSIN3-211ENST00000539589 C9orf118A6NHY6 69 aa14.48□□□□□ -0.09
PACSIN3-211ENST00000539589 SMIM13P0DJ93 91 aa14.48□□□□□ -0.09
PACSIN3-211ENST00000539589 AMELXQ99217 191 aa14.48□□□□□ -0.09
PACSIN3-211ENST00000539589 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa14.47□□□□□ -0.09
PACSIN3-211ENST00000539589 PLAC8L1A1L4L8 177 aa14.47□□□□□ -0.09
PACSIN3-211ENST00000539589 K7EQD1 137 aa14.46□□□□□ -0.09
PACSIN3-211ENST00000539589 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa14.46□□□□□ -0.09
PACSIN3-211ENST00000539589 K7EP13 123 aa14.46□□□□□ -0.1
PACSIN3-211ENST00000539589 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.1
PACSIN3-211ENST00000539589 SCGB1D4Q6XE38 83 aa14.46□□□□□ -0.1
PACSIN3-211ENST00000539589 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.1
PACSIN3-211ENST00000539589 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa14.46□□□□□ -0.1
PACSIN3-211ENST00000539589 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa14.45□□□□□ -0.1
PACSIN3-211ENST00000539589 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM104AQ969W3 186 aa14.45□□□□□ -0.1
PACSIN3-211ENST00000539589 OVOL2Q9BRP0 275 aa14.45□□□□□ -0.1
PACSIN3-211ENST00000539589 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP14.44□□□□□ -0.1
PACSIN3-211ENST00000539589 A0A0J9YXV3 536 aa14.44□□□□□ -0.1
PACSIN3-211ENST00000539589 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP14.44□□□□□ -0.1
PACSIN3-211ENST00000539589 RAB37Q96AX2 223 aa14.44□□□□□ -0.1
PACSIN3-211ENST00000539589 TRGV2A0A075B6R0 118 aa14.44□□□□□ -0.1
PACSIN3-211ENST00000539589 TMEM223A0PJW6 202 aa14.44□□□□□ -0.1
PACSIN3-211ENST00000539589 CIDEAO60543 219 aa14.43□□□□□ -0.1
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP14.43□□□□□ -0.1
PACSIN3-211ENST00000539589 KRTAP10-11P60412 298 aa14.43□□□□□ -0.1
PACSIN3-211ENST00000539589 GAGE12BA1L429 117 aa14.42□□□□□ -0.1
PACSIN3-211ENST00000539589 H3BUT2 72 aa14.42□□□□□ -0.1
PACSIN3-211ENST00000539589 GAGE7O76087 117 aa14.42□□□□□ -0.1
PACSIN3-211ENST00000539589 GAGE12FP0CL80 117 aa14.42□□□□□ -0.1
PACSIN3-211ENST00000539589 GAGE12GP0CL81 117 aa14.42□□□□□ -0.1
PACSIN3-211ENST00000539589 GAGE12IP0CL82 117 aa14.42□□□□□ -0.1
PACSIN3-211ENST00000539589 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP14.42□□□□□ -0.1
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC25A29Q8N8R3 303 aa14.42□□□□□ -0.1
PACSIN3-211ENST00000539589 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP14.42□□□□□ -0.1
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