RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533078.5

CMTM1-216, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CMTM1, Length 565 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM1-216ENST00000533078 RASL11AQ6T310 242 aa7.26□□□□□ -1.25
CMTM1-216ENST00000533078 XKRY2A2RUG3 117 aa7.25□□□□□ -1.25
CMTM1-216ENST00000533078 TRGC1P0CF51 173 aa7.25□□□□□ -1.25
CMTM1-216ENST00000533078 RPS20P60866 119 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CMTM1-216ENST00000533078 IFITM2Q01629 132 aa7.25□□□□□ -1.25
CMTM1-216ENST00000533078 HIGD2BQ4VC39 106 aa7.25□□□□□ -1.25
CMTM1-216ENST00000533078 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa7.25□□□□□ -1.25
CMTM1-216ENST00000533078 C15orf56Q8N910 161 aa7.25□□□□□ -1.25
CMTM1-216ENST00000533078 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa7.25□□□□□ -1.25
CMTM1-216ENST00000533078 FAM210AQ96ND0 272 aa7.25□□□□□ -1.25
CMTM1-216ENST00000533078 MLST8Q9BVC4 326 aa7.25□□□□□ -1.25
CMTM1-216ENST00000533078 SCO2A0A1W2PP80 73 aa7.24□□□□□ -1.25
CMTM1-216ENST00000533078 ODF1Q14990 250 aa7.24□□□□□ -1.25
CMTM1-216ENST00000533078 Q6ZRP5 223 aa7.24□□□□□ -1.25
CMTM1-216ENST00000533078 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa7.24□□□□□ -1.25
CMTM1-216ENST00000533078 NIT2Q9NQR4 276 aa7.24□□□□□ -1.25
CMTM1-216ENST00000533078 HMSDA8MTL9 139 aa7.23□□□□□ -1.25
CMTM1-216ENST00000533078 GAS8-AS1O95177 125 aa7.23□□□□□ -1.25
CMTM1-216ENST00000533078 C9orf62Q8N4C0 152 aa7.23□□□□□ -1.25
CMTM1-216ENST00000533078 SFT2D1Q8WV19 159 aa7.23□□□□□ -1.25
CMTM1-216ENST00000533078 GFRA4Q9GZZ7 299 aa7.23□□□□□ -1.25
CMTM1-216ENST00000533078 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CMTM1-216ENST00000533078 F2Z2F3 143 aa7.22□□□□□ -1.25
CMTM1-216ENST00000533078 Q5BKY6 102 aa7.22□□□□□ -1.25
CMTM1-216ENST00000533078 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CMTM1-216ENST00000533078 TMUB2Q71RG4 321 aa7.22□□□□□ -1.25
CMTM1-216ENST00000533078 OR2D3Q8NGH3 330 aa7.22□□□□□ -1.25
CMTM1-216ENST00000533078 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CMTM1-216ENST00000533078 A0A096LNI7 61 aa7.21□□□□□ -1.26
CMTM1-216ENST00000533078 A0A1B0GV50 99 aa7.21□□□□□ -1.26
CMTM1-216ENST00000533078 FAM231BA6NCW3 169 aa7.21□□□□□ -1.26
CMTM1-216ENST00000533078 UMAD1C9J7I0 102 aa7.21□□□□□ -1.26
CMTM1-216ENST00000533078 RPL35P42766 123 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
CMTM1-216ENST00000533078 KRTAP10-8P60410 259 aa7.21□□□□□ -1.26
CMTM1-216ENST00000533078 KCNRGQ8N5I3 272 aa7.21□□□□□ -1.26
CMTM1-216ENST00000533078 FAM213BQ8TBF2 198 aa7.21□□□□□ -1.26
CMTM1-216ENST00000533078 LPAP08519 4548 aa7.2□□□□□ -1.26
CMTM1-216ENST00000533078 G3V3Q6 166 aa7.2□□□□□ -1.26
CMTM1-216ENST00000533078 ATP6V1G1O75348 118 aa7.2□□□□□ -1.26
CMTM1-216ENST00000533078 IGLC6P0CF74 106 aa7.2□□□□□ -1.26
CMTM1-216ENST00000533078 CARD19Q96LW7 228 aa7.2□□□□□ -1.26
CMTM1-216ENST00000533078 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa7.19□□□□□ -1.26
CMTM1-216ENST00000533078 H7C423 109 aa7.19□□□□□ -1.26
CMTM1-216ENST00000533078 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa7.19□□□□□ -1.26
CMTM1-216ENST00000533078 ARPC5O15511 151 aa7.19□□□□□ -1.26
CMTM1-216ENST00000533078 IFNA1P01562 189 aa7.19□□□□□ -1.26
CMTM1-216ENST00000533078 APCSP02743 223 aa7.19□□□□□ -1.26
CMTM1-216ENST00000533078 S100A1P23297 94 aa7.19□□□□□ -1.26
CMTM1-216ENST00000533078 SMIM15Q7Z3B0 74 aa7.19□□□□□ -1.26
CMTM1-216ENST00000533078 MBD3L1Q8WWY6 194 aa7.19□□□□□ -1.26
CMTM1-216ENST00000533078 TMEM101Q96IK0 257 aa7.19□□□□□ -1.26
CMTM1-216ENST00000533078 BTF3L4Q96K17 158 aa7.19□□□□□ -1.26
CMTM1-216ENST00000533078 BIN3Q9NQY0 253 aa7.19□□□□□ -1.26
CMTM1-216ENST00000533078 NCR2O95944 276 aa7.18□□□□□ -1.26
CMTM1-216ENST00000533078 ISOC2Q96AB3 205 aa7.18□□□□□ -1.26
CMTM1-216ENST00000533078 MANBALQ9NQG1 85 aa7.18□□□□□ -1.26
CMTM1-216ENST00000533078 SMLR1H3BR10 107 aa7.17□□□□□ -1.26
CMTM1-216ENST00000533078 H2AFB1P0C5Y9 115 aa7.17□□□□□ -1.26
CMTM1-216ENST00000533078 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
CMTM1-216ENST00000533078 NTF3P20783 257 aa7.17□□□□□ -1.26
CMTM1-216ENST00000533078 XCL1P47992 114 aa7.17□□□□□ -1.26
CMTM1-216ENST00000533078 GNG4P50150 75 aa7.17□□□□□ -1.26
CMTM1-216ENST00000533078 TWIST1Q15672 202 aa7.17□□□□□ -1.26
CMTM1-216ENST00000533078 CENPWQ5EE01 88 aa7.17□□□□□ -1.26
CMTM1-216ENST00000533078 TEX261Q6UWH6 196 aa7.17□□□□□ -1.26
CMTM1-216ENST00000533078 ZNF664Q8N3J9 261 aa7.17□□□□□ -1.26
CMTM1-216ENST00000533078 SMIM12Q96EX1 92 aa7.17□□□□□ -1.26
CMTM1-216ENST00000533078 CYTL1Q9NRR1 136 aa7.17□□□□□ -1.26
CMTM1-216ENST00000533078 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CMTM1-216ENST00000533078 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CMTM1-216ENST00000533078 TEX46H3BTG2 121 aa7.16□□□□□ -1.26
CMTM1-216ENST00000533078 FGF6P10767 208 aa7.16□□□□□ -1.26
CMTM1-216ENST00000533078 FOXI1Q12951 378 aa7.16□□□□□ -1.26
CMTM1-216ENST00000533078 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP7.16□□□□□ -1.26
CMTM1-216ENST00000533078 ZNF345Q14585 488 aa7.16□□□□□ -1.26
CMTM1-216ENST00000533078 LYZL1Q6UWQ5 148 aa7.16□□□□□ -1.26
CMTM1-216ENST00000533078 OR5A1Q8NGJ0 315 aa7.16□□□□□ -1.26
CMTM1-216ENST00000533078 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa7.15□□□□□ -1.26
CMTM1-216ENST00000533078 MT-ND6P03923 174 aa7.15□□□□□ -1.26
CMTM1-216ENST00000533078 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
CMTM1-216ENST00000533078 SYCNQ0VAF6 134 aa7.15□□□□□ -1.26
CMTM1-216ENST00000533078 GAGE2BQ13066 116 aa7.15□□□□□ -1.26
CMTM1-216ENST00000533078 SS18Q15532 418 aa7.15□□□□□ -1.26
CMTM1-216ENST00000533078 C11orf52Q96A22 123 aa7.15□□□□□ -1.26
CMTM1-216ENST00000533078 GNG13Q9P2W3 67 aa7.15□□□□□ -1.26
CMTM1-216ENST00000533078 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa7.14□□□□□ -1.27
CMTM1-216ENST00000533078 C19orf71A6NCJ1 209 aa7.14□□□□□ -1.27
CMTM1-216ENST00000533078 CCL25O15444 150 aa7.14□□□□□ -1.27
CMTM1-216ENST00000533078 MALP21145 153 aa7.14□□□□□ -1.27
CMTM1-216ENST00000533078 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CMTM1-216ENST00000533078 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa7.14□□□□□ -1.27
CMTM1-216ENST00000533078 A0A0U1RQV1 116 aa7.13□□□□□ -1.27
CMTM1-216ENST00000533078 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa7.13□□□□□ -1.27
CMTM1-216ENST00000533078 LINC00862A6NCI5 91 aa7.13□□□□□ -1.27
CMTM1-216ENST00000533078 PMCHP20382 165 aa7.13□□□□□ -1.27
CMTM1-216ENST00000533078 CTRLP40313 264 aa7.13□□□□□ -1.27
CMTM1-216ENST00000533078 CAMPP49913 170 aa7.13□□□□□ -1.27
CMTM1-216ENST00000533078 PTTG1IPP53801 180 aa7.13□□□□□ -1.27
CMTM1-216ENST00000533078 CCL20P78556 96 aa7.13□□□□□ -1.27
CMTM1-216ENST00000533078 CLLU1Q5K131 121 aa7.13□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49 ms