RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532751.1

PTPRK-222, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRK, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-222ENST00000532751 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRK-222ENST00000532751 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRK-222ENST00000532751 F8W036 122 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRK-222ENST00000532751 PPP1R17O96001 155 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRK-222ENST00000532751 RBX1P62877 108 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRK-222ENST00000532751 HBBP68871 147 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRK-222ENST00000532751 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
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PTPRK-222ENST00000532751 I3L3M4 83 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRK-222ENST00000532751 PMCHP20382 165 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRK-222ENST00000532751 FAM104BQ5XKR9 115 aa14.63□□□□□ -0.07
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PTPRK-222ENST00000532751 GAS8-AS1O95177 125 aa14.62□□□□□ -0.07
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PTPRK-222ENST00000532751 CDPF1Q6NVV7 123 aa14.62□□□□□ -0.07
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PTPRK-222ENST00000532751 C1orf43Q9BWL3 253 aa14.61□□□□□ -0.07
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PTPRK-222ENST00000532751 ENHOQ6UWT2 76 aa14.6□□□□□ -0.07
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PTPRK-222ENST00000532751 A0A1B0GXF2 115 aa14.59□□□□□ -0.07
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PTPRK-222ENST00000532751 SEC11CQ9BY50 192 aa14.59□□□□□ -0.07
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PTPRK-222ENST00000532751 LINC00269Q8N2A0 174 aa14.58□□□□□ -0.08
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PTPRK-222ENST00000532751 PRR34Q9NV39 138 aa14.57□□□□□ -0.08
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PTPRK-222ENST00000532751 NRACQ8N912 160 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRK-222ENST00000532751 C20orf203Q8NBC4 194 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRK-222ENST00000532751 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
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PTPRK-222ENST00000532751 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRK-222ENST00000532751 BAALCQ8WXS3 180 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRK-222ENST00000532751 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
PTPRK-222ENST00000532751 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
PTPRK-222ENST00000532751 TSHBP01222 138 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRK-222ENST00000532751 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP14.54□□□□□ -0.083e-6■■■■□ 20.3
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PTPRK-222ENST00000532751 C10orf91Q5T1B1 145 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRK-222ENST00000532751 TMEM136Q6ZRR5 245 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRK-222ENST00000532751 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa14.47□□□□□ -0.09
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PTPRK-222ENST00000532751 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
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PTPRK-222ENST00000532751 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
PTPRK-222ENST00000532751 HERC2O95714 4834 aa14.45□□□□□ -0.1
PTPRK-222ENST00000532751 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa14.45□□□□□ -0.1
PTPRK-222ENST00000532751 S100PP25815 95 aa14.45□□□□□ -0.1
PTPRK-222ENST00000532751 OR5A1Q8NGJ0 315 aa14.45□□□□□ -0.1
PTPRK-222ENST00000532751 TMEM18Q96B42 140 aa14.45□□□□□ -0.1
PTPRK-222ENST00000532751 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP14.44□□□□□ -0.1
PTPRK-222ENST00000532751 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa14.44□□□□□ -0.1
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