RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531494.1

TMEM25-222, Transcript of transmembrane protein 25, human

TSL 4

Gene TMEM25, Length 1,280 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM25-222	ENST00000531494		M0QY20	66 aa		10.37	□□□□□ -0.75
TMEM25-222	ENST00000531494	RBX1	P62877	108 aa		10.37	□□□□□ -0.75
TMEM25-222	ENST00000531494	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		10.37	□□□□□ -0.75
TMEM25-222	ENST00000531494	APOB	P04114	4563 aa	Known RBP	10.36	□□□□□ -0.75
TMEM25-222	ENST00000531494		A0A1B0GUV1	79 aa		10.36	□□□□□ -0.75
TMEM25-222	ENST00000531494	NTF3	P20783	257 aa		10.36	□□□□□ -0.75
TMEM25-222	ENST00000531494	GAGE6	Q13070	117 aa		10.36	□□□□□ -0.75
TMEM25-222	ENST00000531494	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		10.36	□□□□□ -0.75
TMEM25-222	ENST00000531494	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		10.36	□□□□□ -0.75
TMEM25-222	ENST00000531494	LINC00528	Q8N1L1	170 aa		10.36	□□□□□ -0.75
TMEM25-222	ENST00000531494	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		10.36	□□□□□ -0.75
TMEM25-222	ENST00000531494	PRR34	Q9NV39	138 aa		10.36	□□□□□ -0.75
TMEM25-222	ENST00000531494	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		10.36	□□□□□ -0.75
TMEM25-222	ENST00000531494		A8MWL6	223 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TMEM25-222	ENST00000531494	CTRL	P40313	264 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TMEM25-222	ENST00000531494	AMT	P48728	403 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TMEM25-222	ENST00000531494	REG3A	Q06141	175 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TMEM25-222	ENST00000531494	WFDC2	Q14508	124 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TMEM25-222	ENST00000531494	CFAP161	Q6P656	301 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TMEM25-222	ENST00000531494	ENHO	Q6UWT2	76 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TMEM25-222	ENST00000531494	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
TMEM25-222	ENST00000531494	USP17L23	D6RBM5	183 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TMEM25-222	ENST00000531494	NCR2	O95944	276 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TMEM25-222	ENST00000531494	AMMECR1L	Q6DCA0	310 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TMEM25-222	ENST00000531494	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TMEM25-222	ENST00000531494	IGLV2-8	P01709	118 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TMEM25-222	ENST00000531494	NUDT10	Q8NFP7	164 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TMEM25-222	ENST00000531494	NUDT11	Q96G61	164 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TMEM25-222	ENST00000531494	CNFN	Q9BYD5	112 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TMEM25-222	ENST00000531494	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
TMEM25-222	ENST00000531494		H7C423	109 aa		10.32	□□□□□ -0.76
TMEM25-222	ENST00000531494	HAMP	P81172	84 aa		10.32	□□□□□ -0.76
TMEM25-222	ENST00000531494	SMAGP	Q0VAQ4	97 aa		10.32	□□□□□ -0.76
TMEM25-222	ENST00000531494	RHEB	Q15382	184 aa		10.32	□□□□□ -0.76
TMEM25-222	ENST00000531494	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		10.32	□□□□□ -0.76
TMEM25-222	ENST00000531494	GATC	O43716	136 aa	Known RBP	10.31	□□□□□ -0.76
TMEM25-222	ENST00000531494	CT83	Q5H943	113 aa		10.31	□□□□□ -0.76
TMEM25-222	ENST00000531494	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		10.31	□□□□□ -0.76
TMEM25-222	ENST00000531494	SCX	Q7RTU7	201 aa		10.31	□□□□□ -0.76
TMEM25-222	ENST00000531494	CBLN2	Q8IUK8	224 aa		10.31	□□□□□ -0.76
TMEM25-222	ENST00000531494	BTF3L4	Q96K17	158 aa		10.31	□□□□□ -0.76
TMEM25-222	ENST00000531494	TRBV20OR9-2	A0A075B6H5	130 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TMEM25-222	ENST00000531494	C7orf77	A4D0Y5	90 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TMEM25-222	ENST00000531494	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TMEM25-222	ENST00000531494	TMEM101	Q96IK0	257 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TMEM25-222	ENST00000531494	SMCO4	Q9NRQ5	59 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TMEM25-222	ENST00000531494	LOC105371267	A0A1B0GV96	52 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TMEM25-222	ENST00000531494	hDV102S1	A0JD36	115 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TMEM25-222	ENST00000531494	PPP1R17	O96001	155 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TMEM25-222	ENST00000531494	APCS	P02743	223 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TMEM25-222	ENST00000531494	CEBPG	P53567	150 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TMEM25-222	ENST00000531494	FAM231D	Q6ZW35	169 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TMEM25-222	ENST00000531494	OCC1	Q8TAD7	63 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TMEM25-222	ENST00000531494	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76
TMEM25-222	ENST00000531494	ZNF25	P17030	456 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
TMEM25-222	ENST00000531494	DPH3	Q96FX2	82 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TMEM25-222	ENST00000531494	YPEL4	Q96NS1	127 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TMEM25-222	ENST00000531494	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TMEM25-222	ENST00000531494	FAM231B	A6NCW3	169 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TMEM25-222	ENST00000531494	COLCA2	A8K830	154 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TMEM25-222	ENST00000531494	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
TMEM25-222	ENST00000531494	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TMEM25-222	ENST00000531494	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TMEM25-222	ENST00000531494	SMIM7	Q9BQ49	75 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TMEM25-222	ENST00000531494	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TMEM25-222	ENST00000531494	IGLV10-54	A0A075B6I4	117 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TMEM25-222	ENST00000531494	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
TMEM25-222	ENST00000531494	LINC01620	Q4KN68	170 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TMEM25-222	ENST00000531494	RNASEK	Q6P5S7	137 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
TMEM25-222	ENST00000531494	RPS10P5	Q9NQ39	176 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TMEM25-222	ENST00000531494		I3L3M4	83 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TMEM25-222	ENST00000531494	PRSS1	P07477	247 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TMEM25-222	ENST00000531494	PMCH	P20382	165 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TMEM25-222	ENST00000531494	RNF185	Q96GF1	192 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TMEM25-222	ENST00000531494		A0A1B0GUT8	65 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TMEM25-222	ENST00000531494	ZNF727	A8MUV8	499 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TMEM25-222	ENST00000531494	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
TMEM25-222	ENST00000531494	C20orf203	Q8NBC4	194 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TMEM25-222	ENST00000531494	ST20	Q9HBF5	79 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TMEM25-222	ENST00000531494	SDHAF1	A6NFY7	115 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TMEM25-222	ENST00000531494		K7EN84	100 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TMEM25-222	ENST00000531494	GATD1	Q8NB37	220 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TMEM25-222	ENST00000531494	TSKU	Q8WUA8	353 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TMEM25-222	ENST00000531494	MRAP2	Q96G30	205 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TMEM25-222	ENST00000531494	TMEM242	Q9NWH2	141 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TMEM25-222	ENST00000531494	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
TMEM25-222	ENST00000531494	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
TMEM25-222	ENST00000531494	OXT	P01178	125 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TMEM25-222	ENST00000531494	MT-ND4L	P03901	98 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TMEM25-222	ENST00000531494	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
TMEM25-222	ENST00000531494	RIG	Q13278	110 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TMEM25-222	ENST00000531494	NAT8	Q9UHE5	227 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TMEM25-222	ENST00000531494	IGLV4-60	A0A075B6I1	120 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TMEM25-222	ENST00000531494	TCAP	O15273	167 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TMEM25-222	ENST00000531494	OR5A1	Q8NGJ0	315 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TMEM25-222	ENST00000531494	OSTC	Q9NRP0	149 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TMEM25-222	ENST00000531494	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TMEM25-222	ENST00000531494	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TMEM25-222	ENST00000531494	IGKV3OR2-268	A0A0C4DH90	116 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TMEM25-222	ENST00000531494	TRBV6-5	A0A0K0K1A5	114 aa		10.2	□□□□□ -0.78

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