RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530727.5

PTPRC-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 1,962 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-214ENST00000530727 C4orf3Q8WVX3 66 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-214ENST00000530727 FAM104AQ969W3 186 aa2.87□□□□□ -1.95
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PTPRC-214ENST00000530727 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-214ENST00000530727 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-214ENST00000530727 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-214ENST00000530727 CD28P10747 220 aa2.87□□□□□ -1.95
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PTPRC-214ENST00000530727 C2orf70A6NJV1 201 aa2.86□□□□□ -1.95
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PTPRC-214ENST00000530727 Q8TAT8 98 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRC-214ENST00000530727 GTSF1LQ9H1H1 148 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRC-214ENST00000530727 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRC-214ENST00000530727 A0A0J9YX75 114 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRC-214ENST00000530727 IZUMO1RA6ND01 250 aa2.82□□□□□ -1.96
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