RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498428.5

ROBO1-211, Transcript of roundabout guidance receptor 1, humanhuman

TSL 2

Gene ROBO1, Length 3,566 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROBO1-211ENST00000498428 CFC1BP0CG36 223 aa5.46□□□□□ -1.53
ROBO1-211ENST00000498428 CFC1P0CG37 223 aa5.46□□□□□ -1.53
ROBO1-211ENST00000498428 FAM19A4Q96LR4 140 aa5.46□□□□□ -1.53
ROBO1-211ENST00000498428 Q9H3A6 140 aa5.46□□□□□ -1.53
ROBO1-211ENST00000498428 VPS13CQ709C8 3753 aa5.46□□□□□ -1.54
ROBO1-211ENST00000498428 VPREB1P12018 145 aa5.46□□□□□ -1.54
ROBO1-211ENST00000498428 CRIP1P50238 77 aa5.46□□□□□ -1.54
ROBO1-211ENST00000498428 Q6YL49 198 aa5.46□□□□□ -1.54
ROBO1-211ENST00000498428 RNF5Q99942 180 aa5.46□□□□□ -1.54
ROBO1-211ENST00000498428 A6NDX4 124 aa5.46□□□□□ -1.54
ROBO1-211ENST00000498428 COL6A5A8TX70 2615 aa5.46□□□□□ -1.54
ROBO1-211ENST00000498428 CD164Q04900 197 aa5.46□□□□□ -1.54
ROBO1-211ENST00000498428 SCGB1D4Q6XE38 83 aa5.46□□□□□ -1.54
ROBO1-211ENST00000498428 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa5.45□□□□□ -1.54
ROBO1-211ENST00000498428 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
ROBO1-211ENST00000498428 RBM3P98179 157 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
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ROBO1-211ENST00000498428 H3BMM0 161 aa5.45□□□□□ -1.54
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ROBO1-211ENST00000498428 UBE2WQ96B02 151 aa5.45□□□□□ -1.54
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ROBO1-211ENST00000498428 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
ROBO1-211ENST00000498428 C17orf77Q96MU5 243 aa5.45□□□□□ -1.54
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ROBO1-211ENST00000498428 STAB1Q9NY15 2570 aa5.44□□□□□ -1.54
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ROBO1-211ENST00000498428 SYNJ2BPP57105 145 aa5.44□□□□□ -1.54
ROBO1-211ENST00000498428 LINC01546A6NGU7 62 aa5.44□□□□□ -1.54
ROBO1-211ENST00000498428 H7C2G1 150 aa5.44□□□□□ -1.54
ROBO1-211ENST00000498428 NPBQ8NG41 125 aa5.44□□□□□ -1.54
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ROBO1-211ENST00000498428 PRO1854Q9UHT4 67 aa5.44□□□□□ -1.54
ROBO1-211ENST00000498428 OTOGQ6ZRI0 2925 aa5.43□□□□□ -1.54
ROBO1-211ENST00000498428 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa5.43□□□□□ -1.54
ROBO1-211ENST00000498428 C2orf83Q53S99 150 aa5.43□□□□□ -1.54
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ROBO1-211ENST00000498428 Q8N8P6 123 aa5.43□□□□□ -1.54
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ROBO1-211ENST00000498428 GP9P14770 177 aa5.42□□□□□ -1.54
ROBO1-211ENST00000498428 HLA-DMBP28068 263 aa5.42□□□□□ -1.54
ROBO1-211ENST00000498428 APOC4P55056 127 aa5.42□□□□□ -1.54
ROBO1-211ENST00000498428 C18orf65Q6ZTR6 163 aa5.42□□□□□ -1.54
ROBO1-211ENST00000498428 MYOZ3Q8TDC0 251 aa5.42□□□□□ -1.54
ROBO1-211ENST00000498428 MXRA5Q9NR99 2828 aa5.42□□□□□ -1.54
ROBO1-211ENST00000498428 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
ROBO1-211ENST00000498428 SS18Q15532 418 aa5.42□□□□□ -1.54
ROBO1-211ENST00000498428 C8orf49Q96NF6 230 aa5.42□□□□□ -1.54
ROBO1-211ENST00000498428 F6UB75 175 aa5.42□□□□□ -1.54
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ROBO1-211ENST00000498428 F8VRH5 84 aa5.41□□□□□ -1.54
ROBO1-211ENST00000498428 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
ROBO1-211ENST00000498428 CR1P17927 2039 aa5.41□□□□□ -1.54
ROBO1-211ENST00000498428 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa5.41□□□□□ -1.54
ROBO1-211ENST00000498428 IGHV3-30P01768 117 aa5.41□□□□□ -1.54
ROBO1-211ENST00000498428 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa5.41□□□□□ -1.54
ROBO1-211ENST00000498428 SLURP1P55000 103 aa5.41□□□□□ -1.54
ROBO1-211ENST00000498428 KRTAP1-1Q07627 177 aa5.41□□□□□ -1.54
ROBO1-211ENST00000498428 LINC01559Q495D7 138 aa5.41□□□□□ -1.54
ROBO1-211ENST00000498428 RNF182Q8N6D2 247 aa5.41□□□□□ -1.54
ROBO1-211ENST00000498428 MPLKIPQ8TAP9 179 aa5.41□□□□□ -1.54
ROBO1-211ENST00000498428 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
ROBO1-211ENST00000498428 PDZD2O15018 2839 aa5.41□□□□□ -1.54
ROBO1-211ENST00000498428 A0A0J9YY99 117 aa5.41□□□□□ -1.54
ROBO1-211ENST00000498428 K7EIM0 57 aa5.41□□□□□ -1.54
ROBO1-211ENST00000498428 HTN1P15515 57 aa5.41□□□□□ -1.54
ROBO1-211ENST00000498428 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
ROBO1-211ENST00000498428 C2orf82Q6UX34 121 aa5.41□□□□□ -1.54
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ROBO1-211ENST00000498428 Q8N6K4 173 aa5.41□□□□□ -1.54
ROBO1-211ENST00000498428 FANCD2OSQ96PS1 177 aa5.41□□□□□ -1.54
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ROBO1-211ENST00000498428 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa5.4□□□□□ -1.54
ROBO1-211ENST00000498428 IGHV3-33P01772 117 aa5.4□□□□□ -1.54
ROBO1-211ENST00000498428 HILS1P60008 231 aa5.4□□□□□ -1.54
ROBO1-211ENST00000498428 ATXN8Q156A1 80 aa5.4□□□□□ -1.54
ROBO1-211ENST00000498428 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa5.4□□□□□ -1.54
ROBO1-211ENST00000498428 LINC01006Q8NI28 216 aa5.4□□□□□ -1.54
ROBO1-211ENST00000498428 SMCR5Q8TEV8 140 aa5.4□□□□□ -1.54
ROBO1-211ENST00000498428 IMUPQ9GZP8 106 aa5.4□□□□□ -1.54
ROBO1-211ENST00000498428 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
ROBO1-211ENST00000498428 RBMY1CP0DJD4 496 aa5.4□□□□□ -1.55
ROBO1-211ENST00000498428 ZNF702PQ9H963 129 aa5.4□□□□□ -1.55
ROBO1-211ENST00000498428 TMEM258P61165 79 aa5.4□□□□□ -1.55
ROBO1-211ENST00000498428 ORMDL2Q53FV1 153 aa5.4□□□□□ -1.55
ROBO1-211ENST00000498428 UBE2E2Q96LR5 201 aa5.4□□□□□ -1.55
ROBO1-211ENST00000498428 PRR25Q96S07 402 aa5.4□□□□□ -1.55
ROBO1-211ENST00000498428 H7C423 109 aa5.39□□□□□ -1.55
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