RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496024.1

CALD1-223, Transcript of caldesmon 1, human

TSL 4

Gene CALD1, Length 557 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CALD1-223	ENST00000496024	ST20	Q9HBF5	79 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CALD1-223	ENST00000496024	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CALD1-223	ENST00000496024		A0A1B0GW15	77 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CALD1-223	ENST00000496024	UBE2L6	O14933	153 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CALD1-223	ENST00000496024	EREG	O14944	169 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CALD1-223	ENST00000496024	S100A8	P05109	93 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CALD1-223	ENST00000496024	RBX1	P62877	108 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CALD1-223	ENST00000496024	FAM104B	Q5XKR9	115 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CALD1-223	ENST00000496024	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CALD1-223	ENST00000496024	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CALD1-223	ENST00000496024	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CALD1-223	ENST00000496024		A0A087WTM6	91 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CALD1-223	ENST00000496024	TRBV6-5	A0A0K0K1A5	114 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CALD1-223	ENST00000496024		A0A1B0GXF2	115 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CALD1-223	ENST00000496024	C16orf90	A8MZG2	172 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CALD1-223	ENST00000496024		I3L3M4	83 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CALD1-223	ENST00000496024	CRP	P02741	224 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CALD1-223	ENST00000496024	CKS2	P33552	79 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CALD1-223	ENST00000496024	KRTAP10-2	P60368	255 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CALD1-223	ENST00000496024	PKIA	P61925	76 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CALD1-223	ENST00000496024	TM2D2	Q9BX73	214 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CALD1-223	ENST00000496024	SEC11C	Q9BY50	192 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CALD1-223	ENST00000496024	TMEM242	Q9NWH2	141 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CALD1-223	ENST00000496024	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
CALD1-223	ENST00000496024	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
CALD1-223	ENST00000496024	LECT2	O14960	151 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CALD1-223	ENST00000496024	APCS	P02743	223 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CALD1-223	ENST00000496024	ENHO	Q6UWT2	76 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CALD1-223	ENST00000496024	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CALD1-223	ENST00000496024	NRAC	Q8N912	160 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CALD1-223	ENST00000496024	RMI2	Q96E14	147 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CALD1-223	ENST00000496024	TMEM70	Q9BUB7	260 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CALD1-223	ENST00000496024	IGLV4-60	A0A075B6I1	120 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CALD1-223	ENST00000496024		D6R8Y8	96 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CALD1-223	ENST00000496024	TSHB	P01222	138 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CALD1-223	ENST00000496024	POLR2K	P53803	58 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
CALD1-223	ENST00000496024	RNASEK	Q6P5S7	137 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
CALD1-223	ENST00000496024	ATP5L2	Q7Z4Y8	100 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CALD1-223	ENST00000496024	BTF3L4	Q96K17	158 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CALD1-223	ENST00000496024	LRP1B	Q9NZR2	4599 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CALD1-223	ENST00000496024	IGKV3OR2-268	A0A0C4DH90	116 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CALD1-223	ENST00000496024	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CALD1-223	ENST00000496024	PPP1R17	O96001	155 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CALD1-223	ENST00000496024	FCER1G	P30273	86 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CALD1-223	ENST00000496024	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
CALD1-223	ENST00000496024		Q0VG73	95 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CALD1-223	ENST00000496024	WFDC2	Q14508	124 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CALD1-223	ENST00000496024	AMMECR1L	Q6DCA0	310 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CALD1-223	ENST00000496024	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CALD1-223	ENST00000496024	C20orf203	Q8NBC4	194 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CALD1-223	ENST00000496024	BAALC	Q8WXS3	180 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CALD1-223	ENST00000496024	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CALD1-223	ENST00000496024	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CALD1-223	ENST00000496024	KIAA1109	Q2LD37	5005 aa		6.52	□□□□□ -1.37
CALD1-223	ENST00000496024	IGLV10-54	A0A075B6I4	117 aa		6.52	□□□□□ -1.37
CALD1-223	ENST00000496024	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		6.52	□□□□□ -1.37
CALD1-223	ENST00000496024	C7orf77	A4D0Y5	90 aa		6.52	□□□□□ -1.37
CALD1-223	ENST00000496024	VCY	O14598	125 aa		6.52	□□□□□ -1.37
CALD1-223	ENST00000496024	TNFRSF6B	O95407	300 aa		6.52	□□□□□ -1.37
CALD1-223	ENST00000496024	NPY	P01303	97 aa		6.52	□□□□□ -1.37
CALD1-223	ENST00000496024	REG3A	Q06141	175 aa		6.52	□□□□□ -1.37
CALD1-223	ENST00000496024	C10orf91	Q5T1B1	145 aa		6.52	□□□□□ -1.37
CALD1-223	ENST00000496024	TMEM136	Q6ZRR5	245 aa		6.52	□□□□□ -1.37
CALD1-223	ENST00000496024	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		6.52	□□□□□ -1.37
CALD1-223	ENST00000496024	RPS10P5	Q9NQ39	176 aa		6.52	□□□□□ -1.37
CALD1-223	ENST00000496024	CARHSP1	Q9Y2V2	147 aa	Known RBP	6.52	□□□□□ -1.37
CALD1-223	ENST00000496024	COX11	Q9Y6N1	276 aa		6.52	□□□□□ -1.37
CALD1-223	ENST00000496024		A0A1B0GUV1	79 aa		6.51	□□□□□ -1.37
CALD1-223	ENST00000496024	APOC3	P02656	99 aa		6.51	□□□□□ -1.37
CALD1-223	ENST00000496024	FGF6	P10767	208 aa		6.51	□□□□□ -1.37
CALD1-223	ENST00000496024	S100P	P25815	95 aa		6.51	□□□□□ -1.37
CALD1-223	ENST00000496024	MIA	Q16674	131 aa		6.51	□□□□□ -1.37
CALD1-223	ENST00000496024	ORMDL3	Q8N138	153 aa		6.51	□□□□□ -1.37
CALD1-223	ENST00000496024	PRELID3A	Q96N28	172 aa		6.51	□□□□□ -1.37
CALD1-223	ENST00000496024	IMMP2L	Q96T52	175 aa		6.51	□□□□□ -1.37
CALD1-223	ENST00000496024	KIR2DL4	Q99706	377 aa		6.51	□□□□□ -1.37
CALD1-223	ENST00000496024	PRR34	Q9NV39	138 aa		6.51	□□□□□ -1.37
CALD1-223	ENST00000496024	RYR1	P21817	5038 aa		6.5	□□□□□ -1.37
CALD1-223	ENST00000496024	IGLV2-33	A0A075B6J2	118 aa	Predicted RBP	6.5	□□□□□ -1.37
CALD1-223	ENST00000496024	TRBV24-1	A0A075B6N3	115 aa		6.5	□□□□□ -1.37
CALD1-223	ENST00000496024	HLA-DQA1	P01909	254 aa		6.5	□□□□□ -1.37
CALD1-223	ENST00000496024	PPBP	P02775	128 aa		6.5	□□□□□ -1.37
CALD1-223	ENST00000496024	ESD	P10768	282 aa		6.5	□□□□□ -1.37
CALD1-223	ENST00000496024		Q8N814	137 aa		6.5	□□□□□ -1.37
CALD1-223	ENST00000496024	C20orf78	Q9BR46	151 aa		6.5	□□□□□ -1.37
CALD1-223	ENST00000496024	SMIM2	Q9BVW6	85 aa		6.5	□□□□□ -1.37
CALD1-223	ENST00000496024	PGPEP1	Q9NXJ5	209 aa		6.5	□□□□□ -1.37
CALD1-223	ENST00000496024	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		6.49	□□□□□ -1.37
CALD1-223	ENST00000496024	LOC389332	A0A1B0GUA5	103 aa		6.49	□□□□□ -1.37
CALD1-223	ENST00000496024		H7C423	109 aa		6.49	□□□□□ -1.37
CALD1-223	ENST00000496024	RHEB	Q15382	184 aa		6.49	□□□□□ -1.37
CALD1-223	ENST00000496024	NDUFA5	Q16718	116 aa		6.49	□□□□□ -1.37
CALD1-223	ENST00000496024	OR5A1	Q8NGJ0	315 aa		6.49	□□□□□ -1.37
CALD1-223	ENST00000496024	TMEM101	Q96IK0	257 aa		6.49	□□□□□ -1.37
CALD1-223	ENST00000496024	HERC2	O95714	4834 aa		6.48	□□□□□ -1.37
CALD1-223	ENST00000496024	TCAP	O15273	167 aa		6.48	□□□□□ -1.37
CALD1-223	ENST00000496024	KIAA1644	Q3SXP7	199 aa		6.48	□□□□□ -1.37
CALD1-223	ENST00000496024	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		6.48	□□□□□ -1.37
CALD1-223	ENST00000496024	TRAV9-1	A0A075B6T8	112 aa		6.47	□□□□□ -1.37
CALD1-223	ENST00000496024	PHOX2A	O14813	284 aa		6.47	□□□□□ -1.37

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