RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
PRAME-213ENST00000492657 C2CD3Q4AC94 2353 aa9.43□□□□□ -0.9
PRAME-213ENST00000492657 H7C2G1 150 aa9.43□□□□□ -0.9
PRAME-213ENST00000492657 CFAP126Q5VTH2 177 aa9.43□□□□□ -0.9
PRAME-213ENST00000492657 Q6ZUT4 128 aa9.43□□□□□ -0.9
PRAME-213ENST00000492657 C4orf3Q8WVX3 66 aa9.43□□□□□ -0.9
PRAME-213ENST00000492657 CARD19Q96LW7 228 aa9.43□□□□□ -0.9
PRAME-213ENST00000492657 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa9.43□□□□□ -0.9
PRAME-213ENST00000492657 NOTCH2Q04721 2471 aa9.43□□□□□ -0.9
PRAME-213ENST00000492657 TSPAN13O95857 204 aa9.42□□□□□ -0.9
PRAME-213ENST00000492657 P0DMU3 169 aa9.42□□□□□ -0.9
PRAME-213ENST00000492657 FAM231AP0DMU4 169 aa9.42□□□□□ -0.9
PRAME-213ENST00000492657 FAM231CP0DMU5 169 aa9.42□□□□□ -0.9
PRAME-213ENST00000492657 RPL32P62910 135 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
PRAME-213ENST00000492657 ESM1Q9NQ30 184 aa9.42□□□□□ -0.9
PRAME-213ENST00000492657 FASNP49327 2511 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
PRAME-213ENST00000492657 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa9.42□□□□□ -0.9
PRAME-213ENST00000492657 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa9.42□□□□□ -0.9
PRAME-213ENST00000492657 C11orf86A6NJI1 115 aa9.42□□□□□ -0.9
PRAME-213ENST00000492657 DYNLRB2Q8TF09 96 aa9.42□□□□□ -0.9
PRAME-213ENST00000492657 Q9UF83 564 aa9.41□□□□□ -0.9
PRAME-213ENST00000492657 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa9.41□□□□□ -0.9
PRAME-213ENST00000492657 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa9.41□□□□□ -0.9
PRAME-213ENST00000492657 DEFB114Q30KQ6 69 aa9.41□□□□□ -0.9
PRAME-213ENST00000492657 MAP6D1Q9H9H5 199 aa9.41□□□□□ -0.9
PRAME-213ENST00000492657 PEMTQ9UBM1 199 aa9.41□□□□□ -0.9
PRAME-213ENST00000492657 TRGV11A0A075B6L2 103 aa9.41□□□□□ -0.9
PRAME-213ENST00000492657 TCL1BO95988 128 aa9.4□□□□□ -0.9
PRAME-213ENST00000492657 RAX2Q96IS3 184 aa9.4□□□□□ -0.9
PRAME-213ENST00000492657 TMEM170BQ5T4T1 132 aa9.4□□□□□ -0.91
PRAME-213ENST00000492657 HECTD1Q9ULT8 2610 aa9.39□□□□□ -0.91
PRAME-213ENST00000492657 PMVKQ15126 192 aa9.39□□□□□ -0.91
PRAME-213ENST00000492657 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa9.39□□□□□ -0.91
PRAME-213ENST00000492657 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
PRAME-213ENST00000492657 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa9.38□□□□□ -0.91
PRAME-213ENST00000492657 CD28P10747 220 aa9.38□□□□□ -0.91
PRAME-213ENST00000492657 Q6ZSN1 163 aa9.38□□□□□ -0.91
PRAME-213ENST00000492657 A8MTW9 85 aa9.38□□□□□ -0.91
PRAME-213ENST00000492657 B5MCH6 92 aa9.38□□□□□ -0.91
PRAME-213ENST00000492657 HERVK_113P61574 105 aa9.38□□□□□ -0.91
PRAME-213ENST00000492657 ZNRF2Q8NHG8 242 aa9.38□□□□□ -0.91
PRAME-213ENST00000492657 LINC01587Q99440 93 aa9.37□□□□□ -0.91
PRAME-213ENST00000492657 TMEM141Q96I45 108 aa9.37□□□□□ -0.91
PRAME-213ENST00000492657 TIMM17AQ99595 171 aa9.37□□□□□ -0.91
PRAME-213ENST00000492657 SCGB1C2P0DMR2 95 aa9.37□□□□□ -0.91
PRAME-213ENST00000492657 ANKRD29Q8N6D5 301 aa9.37□□□□□ -0.91
PRAME-213ENST00000492657 ANAPC13Q9BS18 74 aa9.37□□□□□ -0.91
PRAME-213ENST00000492657 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
PRAME-213ENST00000492657 TSPEAR-AS2P59090 65 aa9.36□□□□□ -0.91
PRAME-213ENST00000492657 KRTAP1-1Q07627 177 aa9.36□□□□□ -0.91
PRAME-213ENST00000492657 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa9.36□□□□□ -0.91
PRAME-213ENST00000492657 TMEM86BQ8N661 226 aa9.36□□□□□ -0.91
PRAME-213ENST00000492657 XCL2Q9UBD3 114 aa9.36□□□□□ -0.91
PRAME-213ENST00000492657 ODF3L2Q3SX64 289 aa9.36□□□□□ -0.91
PRAME-213ENST00000492657 TRAV2A0A0B4J234 112 aa9.35□□□□□ -0.91
PRAME-213ENST00000492657 A0A0J9YY99 117 aa9.35□□□□□ -0.91
PRAME-213ENST00000492657 I3L3M4 83 aa9.35□□□□□ -0.91
PRAME-213ENST00000492657 C20orf203Q8NBC4 194 aa9.35□□□□□ -0.91
PRAME-213ENST00000492657 YAE1D1Q9NRH1 226 aa9.35□□□□□ -0.91
PRAME-213ENST00000492657 FN1P02751 2386 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
PRAME-213ENST00000492657 M0R2P5 195 aa9.35□□□□□ -0.91
PRAME-213ENST00000492657 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa9.35□□□□□ -0.91
PRAME-213ENST00000492657 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
PRAME-213ENST00000492657 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
PRAME-213ENST00000492657 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa9.34□□□□□ -0.91
PRAME-213ENST00000492657 CCL24O00175 119 aa9.34□□□□□ -0.91
PRAME-213ENST00000492657 CRLF1O75462 422 aa9.34□□□□□ -0.91
PRAME-213ENST00000492657 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
PRAME-213ENST00000492657 UBE2D1P51668 147 aa9.34□□□□□ -0.91
PRAME-213ENST00000492657 RHOHQ15669 191 aa9.34□□□□□ -0.91
PRAME-213ENST00000492657 C3orf56Q8N813 242 aa9.34□□□□□ -0.91
PRAME-213ENST00000492657 NDUFA11Q86Y39 141 aa9.33□□□□□ -0.92
PRAME-213ENST00000492657 C11orf72Q8NBR9 251 aa9.33□□□□□ -0.92
PRAME-213ENST00000492657 CFC1BP0CG36 223 aa9.33□□□□□ -0.92
PRAME-213ENST00000492657 CFC1P0CG37 223 aa9.33□□□□□ -0.92
PRAME-213ENST00000492657 TEN1Q86WV5 123 aa9.33□□□□□ -0.92
PRAME-213ENST00000492657 HIVEP2P31629 2446 aa9.33□□□□□ -0.92
PRAME-213ENST00000492657 C9JAW5 83 aa9.32□□□□□ -0.92
PRAME-213ENST00000492657 ZNF415Q09FC8 603 aa9.32□□□□□ -0.92
PRAME-213ENST00000492657 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
PRAME-213ENST00000492657 ERG28Q9UKR5 140 aa9.32□□□□□ -0.92
PRAME-213ENST00000492657 J3QQQ9 107 aa9.32□□□□□ -0.92
PRAME-213ENST00000492657 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
PRAME-213ENST00000492657 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa9.32□□□□□ -0.92
PRAME-213ENST00000492657 TRAV4A0A0B4J268 109 aa9.32□□□□□ -0.92
PRAME-213ENST00000492657 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa9.32□□□□□ -0.92
PRAME-213ENST00000492657 A0A0J9YXV3 536 aa9.32□□□□□ -0.92
PRAME-213ENST00000492657 PPDPFLQ8WWR9 84 aa9.32□□□□□ -0.92
PRAME-213ENST00000492657 FAM104AQ969W3 186 aa9.32□□□□□ -0.92
PRAME-213ENST00000492657 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa9.32□□□□□ -0.92
PRAME-213ENST00000492657 A8MWV9 139 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-213ENST00000492657 INSP01308 110 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-213ENST00000492657 UBE2D3P61077 147 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-213ENST00000492657 UBE2D2P62837 147 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-213ENST00000492657 LINC01006Q8NI28 216 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-213ENST00000492657 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
PRAME-213ENST00000492657 SLC25A29Q8N8R3 303 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-213ENST00000492657 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa9.3□□□□□ -0.92
PRAME-213ENST00000492657 IGHV3-30P01768 117 aa9.3□□□□□ -0.92
PRAME-213ENST00000492657 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa9.3□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.6 ms