RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489961.1

VPS13D-210, Transcript of vacuolar protein sorting 13 homolog D, humanhuman

TSL 5

Gene VPS13D, Length 443 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS13D-210ENST00000489961 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa7.37□□□□□ -1.23
VPS13D-210ENST00000489961 C20orf78Q9BR46 151 aa7.37□□□□□ -1.23
VPS13D-210ENST00000489961 DNAH6Q9C0G6 4158 aa7.36□□□□□ -1.23
VPS13D-210ENST00000489961 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa7.36□□□□□ -1.23
VPS13D-210ENST00000489961 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa7.36□□□□□ -1.23
VPS13D-210ENST00000489961 UBE2L6O14933 153 aa7.36□□□□□ -1.23
VPS13D-210ENST00000489961 HLA-DQA1P01909 254 aa7.36□□□□□ -1.23
VPS13D-210ENST00000489961 LINC00336Q6ZUF6 198 aa7.36□□□□□ -1.23
VPS13D-210ENST00000489961 NFE4Q86UQ8 179 aa7.36□□□□□ -1.23
VPS13D-210ENST00000489961 PRELID3AQ96N28 172 aa7.36□□□□□ -1.23
VPS13D-210ENST00000489961 KIR2DL4Q99706 377 aa7.36□□□□□ -1.23
VPS13D-210ENST00000489961 GNB1LQ9BYB4 327 aa7.36□□□□□ -1.23
VPS13D-210ENST00000489961 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa7.36□□□□□ -1.23
VPS13D-210ENST00000489961 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa7.35□□□□□ -1.23
VPS13D-210ENST00000489961 NPYP01303 97 aa7.35□□□□□ -1.23
VPS13D-210ENST00000489961 MT-ND6P03923 174 aa7.35□□□□□ -1.23
VPS13D-210ENST00000489961 FCER1GP30273 86 aa7.35□□□□□ -1.23
VPS13D-210ENST00000489961 RPL32P62910 135 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
VPS13D-210ENST00000489961 GAGE6Q13070 117 aa7.35□□□□□ -1.23
VPS13D-210ENST00000489961 LAGE3Q14657 143 aa7.35□□□□□ -1.23
VPS13D-210ENST00000489961 Q8N3U1 123 aa7.35□□□□□ -1.23
VPS13D-210ENST00000489961 KMT2AQ03164 3969 aa7.35□□□□□ -1.23
VPS13D-210ENST00000489961 RYR2Q92736 4967 aa7.35□□□□□ -1.23
VPS13D-210ENST00000489961 RTL8CO15255 209 aa7.34□□□□□ -1.23
VPS13D-210ENST00000489961 TCAPO15273 167 aa7.34□□□□□ -1.23
VPS13D-210ENST00000489961 TSHBP01222 138 aa7.34□□□□□ -1.23
VPS13D-210ENST00000489961 MPV17L2Q567V2 206 aa7.34□□□□□ -1.23
VPS13D-210ENST00000489961 ATRAIDQ6UW56 229 aa7.34□□□□□ -1.23
VPS13D-210ENST00000489961 SMIM2Q9BVW6 85 aa7.34□□□□□ -1.23
VPS13D-210ENST00000489961 KLK12Q9UKR0 248 aa7.34□□□□□ -1.23
VPS13D-210ENST00000489961 HYDINQ4G0P3 5121 aa7.34□□□□□ -1.23
VPS13D-210ENST00000489961 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa7.33□□□□□ -1.24
VPS13D-210ENST00000489961 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa7.33□□□□□ -1.24
VPS13D-210ENST00000489961 H7C423 109 aa7.33□□□□□ -1.24
VPS13D-210ENST00000489961 ANGP03950 147 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
VPS13D-210ENST00000489961 MAP1LC3AQ9H492 121 aa7.33□□□□□ -1.24
VPS13D-210ENST00000489961 Q9HAA7 133 aa7.33□□□□□ -1.24
VPS13D-210ENST00000489961 SMCO4Q9NRQ5 59 aa7.33□□□□□ -1.24
VPS13D-210ENST00000489961 A0A1B0GUV1 79 aa7.32□□□□□ -1.24
VPS13D-210ENST00000489961 PRSS29PA6NIE9 313 aa7.32□□□□□ -1.24
VPS13D-210ENST00000489961 CRPP02741 224 aa7.32□□□□□ -1.24
VPS13D-210ENST00000489961 RBX1P62877 108 aa7.32□□□□□ -1.24
VPS13D-210ENST00000489961 KIAA1644Q3SXP7 199 aa7.32□□□□□ -1.24
VPS13D-210ENST00000489961 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa7.32□□□□□ -1.24
VPS13D-210ENST00000489961 Q8N976 141 aa7.32□□□□□ -1.24
VPS13D-210ENST00000489961 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
VPS13D-210ENST00000489961 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
VPS13D-210ENST00000489961 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
VPS13D-210ENST00000489961 PRSS47A8MTI9 375 aa7.31□□□□□ -1.24
VPS13D-210ENST00000489961 ESDP10768 282 aa7.31□□□□□ -1.24
VPS13D-210ENST00000489961 RAB5AP20339 215 aa7.31□□□□□ -1.24
VPS13D-210ENST00000489961 Q0VG73 95 aa7.31□□□□□ -1.24
VPS13D-210ENST00000489961 FABP9Q0Z7S8 132 aa7.31□□□□□ -1.24
VPS13D-210ENST00000489961 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
VPS13D-210ENST00000489961 UBE2WQ96B02 151 aa7.31□□□□□ -1.24
VPS13D-210ENST00000489961 RMI2Q96E14 147 aa7.31□□□□□ -1.24
VPS13D-210ENST00000489961 TM2D2Q9BX73 214 aa7.31□□□□□ -1.24
VPS13D-210ENST00000489961 RYR3Q15413 4870 aa7.3□□□□□ -1.24
VPS13D-210ENST00000489961 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa7.3□□□□□ -1.24
VPS13D-210ENST00000489961 PSCAO43653 123 aa7.3□□□□□ -1.24
VPS13D-210ENST00000489961 FGF6P10767 208 aa7.3□□□□□ -1.24
VPS13D-210ENST00000489961 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
VPS13D-210ENST00000489961 SMAGPQ0VAQ4 97 aa7.3□□□□□ -1.24
VPS13D-210ENST00000489961 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
VPS13D-210ENST00000489961 CBLN2Q8IUK8 224 aa7.3□□□□□ -1.24
VPS13D-210ENST00000489961 TMEM18Q96B42 140 aa7.3□□□□□ -1.24
VPS13D-210ENST00000489961 TMEM101Q96IK0 257 aa7.3□□□□□ -1.24
VPS13D-210ENST00000489961 YPEL4Q96NS1 127 aa7.3□□□□□ -1.24
VPS13D-210ENST00000489961 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa7.3□□□□□ -1.24
VPS13D-210ENST00000489961 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa7.29□□□□□ -1.24
VPS13D-210ENST00000489961 TNP2Q05952 138 aa7.29□□□□□ -1.24
VPS13D-210ENST00000489961 LINC00269Q8N2A0 174 aa7.29□□□□□ -1.24
VPS13D-210ENST00000489961 Q8N8P6 123 aa7.29□□□□□ -1.24
VPS13D-210ENST00000489961 C20orf203Q8NBC4 194 aa7.29□□□□□ -1.24
VPS13D-210ENST00000489961 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
VPS13D-210ENST00000489961 COX11Q9Y6N1 276 aa7.29□□□□□ -1.24
VPS13D-210ENST00000489961 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa7.28□□□□□ -1.24
VPS13D-210ENST00000489961 REG3AQ06141 175 aa7.28□□□□□ -1.24
VPS13D-210ENST00000489961 MIAQ16674 131 aa7.28□□□□□ -1.24
VPS13D-210ENST00000489961 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa7.28□□□□□ -1.24
VPS13D-210ENST00000489961 CLPSL2Q6UWE3 100 aa7.28□□□□□ -1.24
VPS13D-210ENST00000489961 ENHOQ6UWT2 76 aa7.28□□□□□ -1.24
VPS13D-210ENST00000489961 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
VPS13D-210ENST00000489961 OR5A1Q8NGJ0 315 aa7.28□□□□□ -1.24
VPS13D-210ENST00000489961 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
VPS13D-210ENST00000489961 C1orf43Q9BWL3 253 aa7.28□□□□□ -1.24
VPS13D-210ENST00000489961 PRR34Q9NV39 138 aa7.28□□□□□ -1.24
VPS13D-210ENST00000489961 K7EMI3 77 aa7.27□□□□□ -1.25
VPS13D-210ENST00000489961 EREGO14944 169 aa7.27□□□□□ -1.25
VPS13D-210ENST00000489961 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa7.27□□□□□ -1.25
VPS13D-210ENST00000489961 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
VPS13D-210ENST00000489961 ORMDL2Q53FV1 153 aa7.26□□□□□ -1.25
VPS13D-210ENST00000489961 TIMM21Q9BVV7 248 aa7.26□□□□□ -1.25
VPS13D-210ENST00000489961 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
VPS13D-210ENST00000489961 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa7.25□□□□□ -1.25
VPS13D-210ENST00000489961 G0S2P27469 103 aa7.25□□□□□ -1.25
VPS13D-210ENST00000489961 SPANXA1Q9NS26 97 aa7.25□□□□□ -1.25
VPS13D-210ENST00000489961 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa7.25□□□□□ -1.25
VPS13D-210ENST00000489961 A0A087WTM6 91 aa7.24□□□□□ -1.25
VPS13D-210ENST00000489961 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms