RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, human

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4A-208	ENST00000489247	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	ERAS	Q7Z444	233 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	ATOH7	Q8N100	152 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM141	Q96I45	108 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	DNAJC30	Q96LL9	226 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	LINC01587	Q99440	93 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	TIMM17A	Q99595	171 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	SNHG12	Q9BXW3	62 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	HIVEP1	P15822	2718 aa		3.98	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	hDV102S1	A0JD36	115 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	PLAC8L1	A1L4L8	177 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247		F8VRH5	84 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	BORCS8-MEF2B	H3BNR1	382 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	SIVA1	O15304	175 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	DPM2	O94777	84 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	FGF6	P10767	208 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	PLN	P26678	52 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	CRYBA4	P53673	196 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC25A34	Q6PIV7	304 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	C2orf66	Q6UXQ4	117 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	C18orf15	Q96N68	181 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	KIR2DL4	Q99706	377 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	MCRIP2	Q9BUT9	160 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	XCL2	Q9UBD3	114 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	HHLA3	Q9XRX5	114 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	CYSLTR1	Q9Y271	337 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	MUC4	Q99102	2169 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	NF1	P21359	2839 aa		3.97	□□□□□ -1.77
ATG4A-208	ENST00000489247	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		3.96	□□□□□ -1.78
ATG4A-208	ENST00000489247	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		3.96	□□□□□ -1.78
ATG4A-208	ENST00000489247		I3L3M4	83 aa		3.96	□□□□□ -1.78
ATG4A-208	ENST00000489247	TSHB	P01222	138 aa		3.96	□□□□□ -1.78
ATG4A-208	ENST00000489247	IGKC	P01834	107 aa		3.96	□□□□□ -1.78
ATG4A-208	ENST00000489247	AZU1	P20160	251 aa		3.96	□□□□□ -1.78
ATG4A-208	ENST00000489247	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF56	Q15929	161 aa		3.96	□□□□□ -1.78
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		3.96	□□□□□ -1.78
ATG4A-208	ENST00000489247		Q6ZN92	141 aa		3.96	□□□□□ -1.78
ATG4A-208	ENST00000489247	BOD1L2	Q8IYS8	172 aa		3.96	□□□□□ -1.78
ATG4A-208	ENST00000489247	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		3.96	□□□□□ -1.78
ATG4A-208	ENST00000489247	C20orf203	Q8NBC4	194 aa		3.96	□□□□□ -1.78
ATG4A-208	ENST00000489247	KIR2DL5B	Q8NHK3	375 aa		3.96	□□□□□ -1.78
ATG4A-208	ENST00000489247	BAALC	Q8WXS3	180 aa		3.96	□□□□□ -1.78
ATG4A-208	ENST00000489247	C16orf74	Q96GX8	76 aa		3.96	□□□□□ -1.78
ATG4A-208	ENST00000489247	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		3.96	□□□□□ -1.78
ATG4A-208	ENST00000489247	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		3.96	□□□□□ -1.78
ATG4A-208	ENST00000489247	DNAH3	Q8TD57	4116 aa		3.96	□□□□□ -1.78
ATG4A-208	ENST00000489247	SETX	Q7Z333	2677 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
ATG4A-208	ENST00000489247	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		3.95	□□□□□ -1.78
ATG4A-208	ENST00000489247	PRSS1	P07477	247 aa		3.95	□□□□□ -1.78
ATG4A-208	ENST00000489247		P0DMU3	169 aa		3.95	□□□□□ -1.78
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM231A	P0DMU4	169 aa		3.95	□□□□□ -1.78
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM231C	P0DMU5	169 aa		3.95	□□□□□ -1.78
ATG4A-208	ENST00000489247	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		3.95	□□□□□ -1.78
ATG4A-208	ENST00000489247	C2orf91	Q6ZV80	131 aa		3.95	□□□□□ -1.78
ATG4A-208	ENST00000489247	MRPL35	Q9NZE8	188 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
ATG4A-208	ENST00000489247	WNK1	Q9H4A3	2382 aa		3.95	□□□□□ -1.78
ATG4A-208	ENST00000489247	CMYA5	Q8N3K9	4069 aa		3.94	□□□□□ -1.78
ATG4A-208	ENST00000489247		H0Y8G0	127 aa		3.94	□□□□□ -1.78
ATG4A-208	ENST00000489247	LINC00694	P0DN24	101 aa		3.94	□□□□□ -1.78
ATG4A-208	ENST00000489247	PMVK	Q15126	192 aa		3.94	□□□□□ -1.78
ATG4A-208	ENST00000489247	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		3.94	□□□□□ -1.78
ATG4A-208	ENST00000489247	GTSCR1	Q86UQ5	136 aa		3.94	□□□□□ -1.78
ATG4A-208	ENST00000489247	NFE4	Q86UQ8	179 aa		3.94	□□□□□ -1.78
ATG4A-208	ENST00000489247	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	3.94	□□□□□ -1.78
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM208	Q9BTX3	173 aa		3.94	□□□□□ -1.78
ATG4A-208	ENST00000489247	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		3.94	□□□□□ -1.78
ATG4A-208	ENST00000489247	WFDC10A	Q9H1F0	79 aa		3.94	□□□□□ -1.78
ATG4A-208	ENST00000489247	CST9L	Q9H4G1	147 aa		3.94	□□□□□ -1.78
ATG4A-208	ENST00000489247	MRPL16	Q9NX20	251 aa	Known RBP	3.94	□□□□□ -1.78
ATG4A-208	ENST00000489247	HIGD1B	Q9P298	99 aa		3.94	□□□□□ -1.78
ATG4A-208	ENST00000489247	TP53TG1	Q9Y2A0	90 aa		3.94	□□□□□ -1.78
ATG4A-208	ENST00000489247	CHTOP	Q9Y3Y2	248 aa	Known RBP	3.94	□□□□□ -1.78
ATG4A-208	ENST00000489247	SETD2	Q9BYW2	2564 aa	Predicted RBP	3.94	□□□□□ -1.78
ATG4A-208	ENST00000489247	SORL1	Q92673	2214 aa		3.93	□□□□□ -1.78
ATG4A-208	ENST00000489247	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		3.93	□□□□□ -1.78
ATG4A-208	ENST00000489247	TRGV1	A0A0A0MS02	117 aa		3.93	□□□□□ -1.78
ATG4A-208	ENST00000489247	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		3.93	□□□□□ -1.78
ATG4A-208	ENST00000489247	PRM2	P04554	102 aa		3.93	□□□□□ -1.78
ATG4A-208	ENST00000489247	KRTAP10-11	P60412	298 aa		3.93	□□□□□ -1.78
ATG4A-208	ENST00000489247	MRPS36	P82909	103 aa	Known RBP	3.93	□□□□□ -1.78
ATG4A-208	ENST00000489247	RRN3P1	Q2M238	152 aa		3.93	□□□□□ -1.78
ATG4A-208	ENST00000489247	COL5A1-AS1	Q5SY13	56 aa		3.93	□□□□□ -1.78
ATG4A-208	ENST00000489247	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		3.93	□□□□□ -1.78
ATG4A-208	ENST00000489247	C12orf54	Q6X4T0	127 aa		3.93	□□□□□ -1.78
ATG4A-208	ENST00000489247		Q6ZTI0	123 aa		3.93	□□□□□ -1.78
ATG4A-208	ENST00000489247	STPG4	Q8N801	248 aa		3.93	□□□□□ -1.78
ATG4A-208	ENST00000489247	OR4C5	Q8NGB2	326 aa		3.93	□□□□□ -1.78
ATG4A-208	ENST00000489247	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		3.93	□□□□□ -1.78
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM104A	Q969W3	186 aa		3.93	□□□□□ -1.78
ATG4A-208	ENST00000489247	AMELX	Q99217	191 aa		3.93	□□□□□ -1.78
ATG4A-208	ENST00000489247	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		3.93	□□□□□ -1.78
ATG4A-208	ENST00000489247	SPANXA1	Q9NS26	97 aa		3.93	□□□□□ -1.78
ATG4A-208	ENST00000489247	ANK2	Q01484	3957 aa		3.93	□□□□□ -1.78
ATG4A-208	ENST00000489247	AGRN	O00468	2067 aa		3.93	□□□□□ -1.78
ATG4A-208	ENST00000489247	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		3.92	□□□□□ -1.78

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