RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489100.5

FAM107B-223, Transcript of family with sequence similarity 107 member B, human

TSL 4

Gene FAM107B, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM107B-223	ENST00000489100	CTRL	P40313	264 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM107B-223	ENST00000489100	RBX1	P62877	108 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM107B-223	ENST00000489100	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM107B-223	ENST00000489100	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM107B-223	ENST00000489100	REG3G	Q6UW15	175 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM107B-223	ENST00000489100	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM107B-223	ENST00000489100	PRR34	Q9NV39	138 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM107B-223	ENST00000489100	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
FAM107B-223	ENST00000489100	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM107B-223	ENST00000489100	GAGE6	Q13070	117 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM107B-223	ENST00000489100	WDR73	Q6P4I2	378 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM107B-223	ENST00000489100	RASL11A	Q6T310	242 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM107B-223	ENST00000489100	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM107B-223	ENST00000489100	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM107B-223	ENST00000489100	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM107B-223	ENST00000489100	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM107B-223	ENST00000489100		A0A0U1RQV1	116 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM107B-223	ENST00000489100	PRSS1	P07477	247 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM107B-223	ENST00000489100	NTF3	P20783	257 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM107B-223	ENST00000489100	NKX2-5	P52952	324 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
FAM107B-223	ENST00000489100	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM107B-223	ENST00000489100	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM107B-223	ENST00000489100	C9orf62	Q8N4C0	152 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM107B-223	ENST00000489100	RNF185	Q96GF1	192 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM107B-223	ENST00000489100	TMEM243	Q9BU79	118 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM107B-223	ENST00000489100	CNFN	Q9BYD5	112 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM107B-223	ENST00000489100	RPP21	Q9H633	154 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
FAM107B-223	ENST00000489100	NIT2	Q9NQR4	276 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM107B-223	ENST00000489100	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM107B-223	ENST00000489100		A0A1B0GUV1	79 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM107B-223	ENST00000489100	TMEM250	H0YL14	139 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM107B-223	ENST00000489100	PHOX2A	O14813	284 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM107B-223	ENST00000489100	UBE2L6	O14933	153 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM107B-223	ENST00000489100	BLOC1S1	P78537	153 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM107B-223	ENST00000489100	REG3A	Q06141	175 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM107B-223	ENST00000489100	COTL1	Q14019	142 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM107B-223	ENST00000489100	SMIM15	Q7Z3B0	74 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM107B-223	ENST00000489100	AKAP14	Q86UN6	197 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM107B-223	ENST00000489100	NUDT10	Q8NFP7	164 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM107B-223	ENST00000489100	NUDT11	Q96G61	164 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM107B-223	ENST00000489100		A0A087WYN8	130 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM107B-223	ENST00000489100		K7EN84	100 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM107B-223	ENST00000489100	AMT	P48728	403 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM107B-223	ENST00000489100	TWIST1	Q15672	202 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM107B-223	ENST00000489100	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM107B-223	ENST00000489100		Q6ZNX1	250 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM107B-223	ENST00000489100	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM107B-223	ENST00000489100	C20orf203	Q8NBC4	194 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM107B-223	ENST00000489100	LINC01600	Q96MT4	127 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM107B-223	ENST00000489100	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
FAM107B-223	ENST00000489100	LRP2	P98164	4655 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM107B-223	ENST00000489100	IGLV10-54	A0A075B6I4	117 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM107B-223	ENST00000489100	GATC	O43716	136 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FAM107B-223	ENST00000489100	NCR2	O95944	276 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM107B-223	ENST00000489100	CHTF8	P0CG12	524 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM107B-223	ENST00000489100	MAJIN	Q3KP22	176 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM107B-223	ENST00000489100	CT83	Q5H943	113 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM107B-223	ENST00000489100	TEX261	Q6UWH6	196 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM107B-223	ENST00000489100	ALKAL2	Q6UX46	152 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM107B-223	ENST00000489100	FAM231D	Q6ZW35	169 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM107B-223	ENST00000489100	LYPD6B	Q8NI32	183 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM107B-223	ENST00000489100	OCC1	Q8TAD7	63 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM107B-223	ENST00000489100	KRTAP4-8	Q9BYQ9	185 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM107B-223	ENST00000489100	FAT3	Q8TDW7	4589 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM107B-223	ENST00000489100	IGLV4-60	A0A075B6I1	120 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM107B-223	ENST00000489100	IGKV2-24	A0A0C4DH68	120 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM107B-223	ENST00000489100		A0A0J9YXV3	536 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM107B-223	ENST00000489100		A8MWL6	223 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM107B-223	ENST00000489100	PANO1	I0J062	215 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM107B-223	ENST00000489100	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FAM107B-223	ENST00000489100	APCS	P02743	223 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM107B-223	ENST00000489100	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FAM107B-223	ENST00000489100	CFAP161	Q6P656	301 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM107B-223	ENST00000489100	GATD1	Q8NB37	220 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM107B-223	ENST00000489100	BORCS7	Q96B45	105 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM107B-223	ENST00000489100	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM107B-223	ENST00000489100	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM107B-223	ENST00000489100	FAM231B	A6NCW3	169 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM107B-223	ENST00000489100	SDHAF1	A6NFY7	115 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM107B-223	ENST00000489100		H7C423	109 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM107B-223	ENST00000489100	CEBPG	P53567	150 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM107B-223	ENST00000489100	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
FAM107B-223	ENST00000489100	AMMECR1L	Q6DCA0	310 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM107B-223	ENST00000489100	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM107B-223	ENST00000489100	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM107B-223	ENST00000489100	FAM210A	Q96ND0	272 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM107B-223	ENST00000489100	SMIM7	Q9BQ49	75 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM107B-223	ENST00000489100	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAM107B-223	ENST00000489100	hCG_2014768	A0A024R1R8	64 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FAM107B-223	ENST00000489100	ZNF25	P17030	456 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
FAM107B-223	ENST00000489100	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
FAM107B-223	ENST00000489100	STPG4	Q8N801	248 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FAM107B-223	ENST00000489100	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
FAM107B-223	ENST00000489100	EIF5A2	Q9GZV4	153 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
FAM107B-223	ENST00000489100	PLAC8	Q9NZF1	115 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FAM107B-223	ENST00000489100	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FAM107B-223	ENST00000489100	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
FAM107B-223	ENST00000489100	TRBV6-5	A0A0K0K1A5	114 aa		4.52	□□□□□ -1.69
FAM107B-223	ENST00000489100		A0A1B0GUT8	65 aa		4.52	□□□□□ -1.69
FAM107B-223	ENST00000489100	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms