RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486889.1

CTPS1-210, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 2

Gene CTPS1, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-210ENST00000486889 KIAA1644Q3SXP7 199 aa6.77□□□□□ -1.33
CTPS1-210ENST00000486889 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa6.77□□□□□ -1.33
CTPS1-210ENST00000486889 C10orf126Q8N4M7 172 aa6.77□□□□□ -1.33
CTPS1-210ENST00000486889 TMEM101Q96IK0 257 aa6.77□□□□□ -1.33
CTPS1-210ENST00000486889 YPEL4Q96NS1 127 aa6.77□□□□□ -1.33
CTPS1-210ENST00000486889 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
CTPS1-210ENST00000486889 TMEM243Q9BU79 118 aa6.77□□□□□ -1.33
CTPS1-210ENST00000486889 CHCHD7Q9BUK0 85 aa6.77□□□□□ -1.33
CTPS1-210ENST00000486889 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
CTPS1-210ENST00000486889 COL7A1Q02388 2944 aa6.77□□□□□ -1.33
CTPS1-210ENST00000486889 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-210ENST00000486889 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-210ENST00000486889 PRSS47A8MTI9 375 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-210ENST00000486889 NPYP01303 97 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-210ENST00000486889 TTC32Q5I0X7 151 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-210ENST00000486889 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-210ENST00000486889 BAGE3Q86Y29 109 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-210ENST00000486889 Q8N8P6 123 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-210ENST00000486889 NRACQ8N912 160 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-210ENST00000486889 NACAE9PAV3 2078 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-210ENST00000486889 SIVA1O15304 175 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-210ENST00000486889 LY6G6CO95867 125 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-210ENST00000486889 TRGC2P03986 189 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-210ENST00000486889 LINC00694P0DN24 101 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-210ENST00000486889 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-210ENST00000486889 LAGE3Q14657 143 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-210ENST00000486889 IQCJQ1A5X6 159 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-210ENST00000486889 ESRGQ1W209 222 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-210ENST00000486889 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-210ENST00000486889 UPK3BQ9BT76 320 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-210ENST00000486889 Q9H8V8 135 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-210ENST00000486889 AP5S1Q9NUS5 200 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-210ENST00000486889 LINC00614P0C842 121 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-210ENST00000486889 BTF3P20290 206 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-210ENST00000486889 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-210ENST00000486889 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-210ENST00000486889 CYSLTR1Q9Y271 337 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-210ENST00000486889 LINC00588Q9Y4M8 146 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-210ENST00000486889 HSBP1O75506 76 aa6.72□□□□□ -1.33
CTPS1-210ENST00000486889 CRPP02741 224 aa6.72□□□□□ -1.33
CTPS1-210ENST00000486889 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
CTPS1-210ENST00000486889 Q0VG73 95 aa6.72□□□□□ -1.33
CTPS1-210ENST00000486889 Q6ZN92 141 aa6.72□□□□□ -1.33
CTPS1-210ENST00000486889 RMI2Q96E14 147 aa6.72□□□□□ -1.33
CTPS1-210ENST00000486889 TSHBP01222 138 aa6.71□□□□□ -1.34
CTPS1-210ENST00000486889 S100A6P06703 90 aa6.71□□□□□ -1.34
CTPS1-210ENST00000486889 LINC01556Q5JQF7 62 aa6.71□□□□□ -1.34
CTPS1-210ENST00000486889 OR5A1Q8NGJ0 315 aa6.71□□□□□ -1.34
CTPS1-210ENST00000486889 C18orf32Q8TCD1 76 aa6.71□□□□□ -1.34
CTPS1-210ENST00000486889 LINC00476Q8WZB0 136 aa6.71□□□□□ -1.34
CTPS1-210ENST00000486889 Q9UF83 564 aa6.71□□□□□ -1.34
CTPS1-210ENST00000486889 A0A1B0GUV1 79 aa6.7□□□□□ -1.34
CTPS1-210ENST00000486889 GAS8-AS1O95177 125 aa6.7□□□□□ -1.34
CTPS1-210ENST00000486889 NPSP0C0P6 89 aa6.7□□□□□ -1.34
CTPS1-210ENST00000486889 DNAH10OSP0CZ25 163 aa6.7□□□□□ -1.34
CTPS1-210ENST00000486889 GAGE6Q13070 117 aa6.7□□□□□ -1.34
CTPS1-210ENST00000486889 NFE4Q86UQ8 179 aa6.7□□□□□ -1.34
CTPS1-210ENST00000486889 NIT1Q86X76 327 aa6.7□□□□□ -1.34
CTPS1-210ENST00000486889 C20orf203Q8NBC4 194 aa6.7□□□□□ -1.34
CTPS1-210ENST00000486889 SPANXA1Q9NS26 97 aa6.7□□□□□ -1.34
CTPS1-210ENST00000486889 COX11Q9Y6N1 276 aa6.7□□□□□ -1.34
CTPS1-210ENST00000486889 DNAH9Q9NYC9 4486 aa6.7□□□□□ -1.34
CTPS1-210ENST00000486889 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-210ENST00000486889 LCE6AA0A183 80 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-210ENST00000486889 ANGP03950 147 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-210ENST00000486889 FGF6P10767 208 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-210ENST00000486889 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-210ENST00000486889 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-210ENST00000486889 C2orf88Q9BSF0 95 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-210ENST00000486889 TIMM21Q9BVV7 248 aa6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-210ENST00000486889 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CTPS1-210ENST00000486889 CCL25O15444 150 aa6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-210ENST00000486889 ATP5LO75964 103 aa6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-210ENST00000486889 IGHV3-30P01768 117 aa6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-210ENST00000486889 IGHV3-33P01772 117 aa6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-210ENST00000486889 HBDP02042 147 aa6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-210ENST00000486889 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-210ENST00000486889 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-210ENST00000486889 ESDP10768 282 aa6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-210ENST00000486889 C2orf66Q6UXQ4 117 aa6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-210ENST00000486889 WFDC10BQ8IUB3 73 aa6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-210ENST00000486889 TMEM141Q96I45 108 aa6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-210ENST00000486889 SCGB3A1Q96QR1 104 aa6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-210ENST00000486889 TM2D2Q9BX73 214 aa6.68□□□□□ -1.34
CTPS1-210ENST00000486889 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-210ENST00000486889 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-210ENST00000486889 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-210ENST00000486889 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-210ENST00000486889 LINC01546A6NGU7 62 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-210ENST00000486889 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-210ENST00000486889 ERASQ7Z444 233 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-210ENST00000486889 VCX2Q9H322 139 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-210ENST00000486889 HSPB8Q9UJY1 196 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-210ENST00000486889 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-210ENST00000486889 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa6.66□□□□□ -1.34
CTPS1-210ENST00000486889 PSCAO43653 123 aa6.66□□□□□ -1.34
CTPS1-210ENST00000486889 HIST1H2BKO60814 126 aa6.66□□□□□ -1.34
CTPS1-210ENST00000486889 HIST1H2BJP06899 126 aa6.66□□□□□ -1.34
CTPS1-210ENST00000486889 HIST1H2BOP23527 126 aa6.66□□□□□ -1.34
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