RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486480.1

PTPRN-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRN, Length 563 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-216ENST00000486480 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
PTPRN-216ENST00000486480 PKHD1P08F94 4074 aa12.79□□□□□ -0.36
PTPRN-216ENST00000486480 I3L3M4 83 aa12.79□□□□□ -0.36
PTPRN-216ENST00000486480 PSCAO43653 123 aa12.79□□□□□ -0.36
PTPRN-216ENST00000486480 PPP1R17O96001 155 aa12.79□□□□□ -0.36
PTPRN-216ENST00000486480 RBX1P62877 108 aa12.79□□□□□ -0.36
PTPRN-216ENST00000486480 UBE2WQ96B02 151 aa12.79□□□□□ -0.36
PTPRN-216ENST00000486480 CTDSP1Q9GZU7 261 aa12.79□□□□□ -0.36
PTPRN-216ENST00000486480 APCSP02743 223 aa12.78□□□□□ -0.36
PTPRN-216ENST00000486480 ANGP03950 147 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
PTPRN-216ENST00000486480 PMCHP20382 165 aa12.78□□□□□ -0.36
PTPRN-216ENST00000486480 BTF3L4Q96K17 158 aa12.78□□□□□ -0.36
PTPRN-216ENST00000486480 IMMP2LQ96T52 175 aa12.78□□□□□ -0.36
PTPRN-216ENST00000486480 TM2D2Q9BX73 214 aa12.78□□□□□ -0.36
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PTPRN-216ENST00000486480 UBE2L6O14933 153 aa12.77□□□□□ -0.37
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PTPRN-216ENST00000486480 BIRC6Q9NR09 4857 aa12.77□□□□□ -0.37
PTPRN-216ENST00000486480 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa12.76□□□□□ -0.37
PTPRN-216ENST00000486480 TSHBP01222 138 aa12.76□□□□□ -0.37
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PTPRN-216ENST00000486480 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
PTPRN-216ENST00000486480 SPATA12Q7Z6I5 190 aa12.76□□□□□ -0.37
PTPRN-216ENST00000486480 RMI2Q96E14 147 aa12.76□□□□□ -0.37
PTPRN-216ENST00000486480 TMEM242Q9NWH2 141 aa12.76□□□□□ -0.37
PTPRN-216ENST00000486480 EREGO14944 169 aa12.75□□□□□ -0.37
PTPRN-216ENST00000486480 ENHOQ6UWT2 76 aa12.75□□□□□ -0.37
PTPRN-216ENST00000486480 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa12.74□□□□□ -0.37
PTPRN-216ENST00000486480 A0A1B0GUV1 79 aa12.74□□□□□ -0.37
PTPRN-216ENST00000486480 C7orf77A4D0Y5 90 aa12.74□□□□□ -0.37
PTPRN-216ENST00000486480 LRCOL1A6NCL2 159 aa12.74□□□□□ -0.37
PTPRN-216ENST00000486480 D6R8Y8 96 aa12.74□□□□□ -0.37
PTPRN-216ENST00000486480 Q0VG73 95 aa12.74□□□□□ -0.37
PTPRN-216ENST00000486480 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRN-216ENST00000486480 VCYO14598 125 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRN-216ENST00000486480 PPBPP02775 128 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRN-216ENST00000486480 KRTAP10-2P60368 255 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRN-216ENST00000486480 RHEBQ15382 184 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRN-216ENST00000486480 CLPSL2Q6UWE3 100 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRN-216ENST00000486480 C20orf203Q8NBC4 194 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRN-216ENST00000486480 CLRN3Q8NCR9 226 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRN-216ENST00000486480 C20orf78Q9BR46 151 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRN-216ENST00000486480 PRR34Q9NV39 138 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRN-216ENST00000486480 COX11Q9Y6N1 276 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRN-216ENST00000486480 DNAH11Q96DT5 4516 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRN-216ENST00000486480 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRN-216ENST00000486480 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
PTPRN-216ENST00000486480 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRN-216ENST00000486480 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
PTPRN-216ENST00000486480 H7C423 109 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRN-216ENST00000486480 TNFRSF6BO95407 300 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRN-216ENST00000486480 LINC00269Q8N2A0 174 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRN-216ENST00000486480 C16orf90A8MZG2 172 aa12.71□□□□□ -0.37
PTPRN-216ENST00000486480 NPYP01303 97 aa12.71□□□□□ -0.37
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PTPRN-216ENST00000486480 ORMDL3Q8N138 153 aa12.71□□□□□ -0.37
PTPRN-216ENST00000486480 C1orf43Q9BWL3 253 aa12.71□□□□□ -0.37
PTPRN-216ENST00000486480 PHOX2AO14813 284 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRN-216ENST00000486480 S100PP25815 95 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRN-216ENST00000486480 RPL32P62910 135 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
PTPRN-216ENST00000486480 REG3AQ06141 175 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRN-216ENST00000486480 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRN-216ENST00000486480 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRN-216ENST00000486480 KIR2DL4Q99706 377 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRN-216ENST00000486480 RPS10P5Q9NQ39 176 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRN-216ENST00000486480 APOC3P02656 99 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-216ENST00000486480 FGF6P10767 208 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-216ENST00000486480 FCER1GP30273 86 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-216ENST00000486480 NDUFA5Q16718 116 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-216ENST00000486480 TMEM136Q6ZRR5 245 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-216ENST00000486480 PRELID3AQ96N28 172 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-216ENST00000486480 SMIM2Q9BVW6 85 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRN-216ENST00000486480 WFDC2Q14508 124 aa12.68□□□□□ -0.38
PTPRN-216ENST00000486480 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
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PTPRN-216ENST00000486480 Q8N814 137 aa12.67□□□□□ -0.38
PTPRN-216ENST00000486480 LECT2O14960 151 aa12.66□□□□□ -0.38
PTPRN-216ENST00000486480 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
PTPRN-216ENST00000486480 CDPF1Q6NVV7 123 aa12.66□□□□□ -0.38
PTPRN-216ENST00000486480 SVBPQ8N300 66 aa12.66□□□□□ -0.38
PTPRN-216ENST00000486480 BAALCQ8WXS3 180 aa12.66□□□□□ -0.38
PTPRN-216ENST00000486480 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa12.66□□□□□ -0.38
PTPRN-216ENST00000486480 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa12.66□□□□□ -0.38
PTPRN-216ENST00000486480 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
PTPRN-216ENST00000486480 SNAPINO95295 136 aa12.65□□□□□ -0.38
PTPRN-216ENST00000486480 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa12.64□□□□□ -0.39
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PTPRN-216ENST00000486480 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
PTPRN-216ENST00000486480 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa12.63□□□□□ -0.39
PTPRN-216ENST00000486480 HLA-DQA1P01909 254 aa12.63□□□□□ -0.39
PTPRN-216ENST00000486480 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa12.63□□□□□ -0.39
PTPRN-216ENST00000486480 OR5A1Q8NGJ0 315 aa12.63□□□□□ -0.39
PTPRN-216ENST00000486480 TMEM101Q96IK0 257 aa12.63□□□□□ -0.39
PTPRN-216ENST00000486480 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP12.62□□□□□ -0.39
PTPRN-216ENST00000486480 MAP1LC3AQ9H492 121 aa12.62□□□□□ -0.39
PTPRN-216ENST00000486480 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa12.61□□□□□ -0.39
PTPRN-216ENST00000486480 GNB1LQ9BYB4 327 aa12.61□□□□□ -0.39
PTPRN-216ENST00000486480 PRSS47A8MTI9 375 aa12.6□□□□□ -0.39
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