RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SPATA12Q7Z6I5 190 aa12.53□□□□□ -0.4
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ATP5G1P05496 136 aa12.52□□□□□ -0.4
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HIGD1BQ9P298 99 aa12.52□□□□□ -0.41
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HHLA3Q9XRX5 114 aa12.52□□□□□ -0.41
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa12.52□□□□□ -0.41
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PTH2Q96A98 100 aa12.52□□□□□ -0.41
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZFAND3Q9H8U3 227 aa12.51□□□□□ -0.41
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa12.51□□□□□ -0.41
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C9orf66Q5T8R8 295 aa12.51□□□□□ -0.41
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 WFDC11Q8NEX6 87 aa12.51□□□□□ -0.41
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SPART-AS1P0CW21 52 aa12.51□□□□□ -0.41
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MED14OSP0DP75 135 aa12.51□□□□□ -0.41
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 VSIG2Q96IQ7 327 aa12.51□□□□□ -0.41
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MAP6D1Q9H9H5 199 aa12.51□□□□□ -0.41
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP12.51□□□□□ -0.41
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HERV-K104P63124 156 aa12.5□□□□□ -0.41
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa12.5□□□□□ -0.41
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 Q6ZTI0 123 aa12.5□□□□□ -0.41
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 Q6ZUT4 128 aa12.49□□□□□ -0.41
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DEFB105AQ8NG35 78 aa12.49□□□□□ -0.41
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 COX7A2LO14548 114 aa12.49□□□□□ -0.41
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ACYP1P07311 99 aa12.49□□□□□ -0.41
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LINC01620Q4KN68 170 aa12.49□□□□□ -0.41
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ICOSQ9Y6W8 199 aa12.49□□□□□ -0.41
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EBI3Q14213 229 aa12.49□□□□□ -0.41
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MYCNOSP40205 109 aa12.48□□□□□ -0.41
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 K7EQG2 157 aa12.48□□□□□ -0.41
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CAMK2N2Q96S95 79 aa12.48□□□□□ -0.41
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa12.48□□□□□ -0.41
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 COX7B2Q8TF08 81 aa12.48□□□□□ -0.41
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C4orf3Q8WVX3 66 aa12.48□□□□□ -0.41
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMEM89A2RUT3 159 aa12.47□□□□□ -0.41
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C11orf71Q6IPW1 123 aa12.47□□□□□ -0.41
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGLV2-11P01706 119 aa12.47□□□□□ -0.41
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CLEC2BQ92478 149 aa12.47□□□□□ -0.41
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa12.47□□□□□ -0.41
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TEN1Q86WV5 123 aa12.47□□□□□ -0.41
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CHD9Q3L8U1 2897 aa12.46□□□□□ -0.41
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KLK12Q9UKR0 248 aa12.46□□□□□ -0.41
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 Q6ZS46 218 aa12.46□□□□□ -0.41
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa12.45□□□□□ -0.42
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CLPSL1A2RUU4 121 aa12.45□□□□□ -0.42
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 hADV29S1A0JD25 119 aa12.44□□□□□ -0.42
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa12.44□□□□□ -0.42
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ORMDL1Q9P0S3 153 aa12.44□□□□□ -0.42
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GAS8-AS1O95177 125 aa12.43□□□□□ -0.42
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C5orf47Q569G3 176 aa12.43□□□□□ -0.42
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGHV4-31P0DP07 118 aa12.43□□□□□ -0.42
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C11orf21Q9P2W6 132 aa12.43□□□□□ -0.42
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRM2P04554 102 aa12.43□□□□□ -0.42
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PROK1P58294 105 aa12.43□□□□□ -0.42
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LECT2O14960 151 aa12.42□□□□□ -0.42
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ADAMTS20P59510 1910 aa12.42□□□□□ -0.42
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NDUFC2O95298 119 aa12.42□□□□□ -0.42
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa12.42□□□□□ -0.42
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C5orf42Q9H799 3197 aa12.41□□□□□ -0.42
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ATOX1O00244 68 aa12.41□□□□□ -0.42
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 UBE2BP63146 152 aa12.41□□□□□ -0.42
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DEFB114Q30KQ6 69 aa12.41□□□□□ -0.42
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RNF185Q96GF1 192 aa12.41□□□□□ -0.42
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZMAT4Q9H898 229 aa12.41□□□□□ -0.42
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 J3KT08 172 aa12.41□□□□□ -0.42
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa12.41□□□□□ -0.42
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 Q6YL49 198 aa12.41□□□□□ -0.42
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RMI2Q96E14 147 aa12.4□□□□□ -0.42
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRR9Q5T870 116 aa12.4□□□□□ -0.42
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NDUFA11Q86Y39 141 aa12.4□□□□□ -0.42
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa12.4□□□□□ -0.42
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRO0255Q9UI72 69 aa12.4□□□□□ -0.42
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LINC00467Q9BRT7 94 aa12.4□□□□□ -0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa12.39□□□□□ -0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa12.39□□□□□ -0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa12.39□□□□□ -0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 A0A1B0GX51 115 aa12.39□□□□□ -0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FOXI1Q12951 378 aa12.39□□□□□ -0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LGALS9O00182 355 aa12.39□□□□□ -0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SPAG11BQ08648 103 aa12.39□□□□□ -0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 Q8N6K4 173 aa12.39□□□□□ -0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa12.38□□□□□ -0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 H0YGX0 51 aa12.38□□□□□ -0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NCR3O14931 201 aa12.38□□□□□ -0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa12.38□□□□□ -0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 Q6ZSV7 163 aa12.38□□□□□ -0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NFE4Q86UQ8 179 aa12.38□□□□□ -0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa12.37□□□□□ -0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 A0A0J9YXY3 114 aa12.37□□□□□ -0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 A0A0B4J2C4 111 aa12.36□□□□□ -0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 M0QY20 66 aa12.36□□□□□ -0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 USP24Q9UPU5 2620 aa12.35□□□□□ -0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TCL1BO95988 128 aa12.35□□□□□ -0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCL18P55774 89 aa12.35□□□□□ -0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa12.35□□□□□ -0.43
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM222AQ5U5X8 452 aa12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 125.8 ms