RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478087.5

HPS1-211, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene HPS1, Length 971 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-211ENST00000478087 CHCHD7Q9BUK0 85 aa8.64□□□□□ -1.03
HPS1-211ENST00000478087 TMEM242Q9NWH2 141 aa8.64□□□□□ -1.03
HPS1-211ENST00000478087 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa8.63□□□□□ -1.03
HPS1-211ENST00000478087 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa8.63□□□□□ -1.03
HPS1-211ENST00000478087 RHEBQ15382 184 aa8.63□□□□□ -1.03
HPS1-211ENST00000478087 Q8N814 137 aa8.63□□□□□ -1.03
HPS1-211ENST00000478087 BTF3L4Q96K17 158 aa8.63□□□□□ -1.03
HPS1-211ENST00000478087 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa8.62□□□□□ -1.03
HPS1-211ENST00000478087 A0A1B0GXF2 115 aa8.62□□□□□ -1.03
HPS1-211ENST00000478087 RAB4AP20338 218 aa8.62□□□□□ -1.03
HPS1-211ENST00000478087 NIT1Q86X76 327 aa8.62□□□□□ -1.03
HPS1-211ENST00000478087 GATD1Q8NB37 220 aa8.62□□□□□ -1.03
HPS1-211ENST00000478087 FAM30AQ9NZY2 134 aa8.62□□□□□ -1.03
HPS1-211ENST00000478087 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
HPS1-211ENST00000478087 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa8.61□□□□□ -1.03
HPS1-211ENST00000478087 EPM2AB3EWF7 344 aa8.61□□□□□ -1.03
HPS1-211ENST00000478087 S100PP25815 95 aa8.61□□□□□ -1.03
HPS1-211ENST00000478087 LAGE3Q14657 143 aa8.61□□□□□ -1.03
HPS1-211ENST00000478087 ELOBQ15370 118 aa8.61□□□□□ -1.03
HPS1-211ENST00000478087 FAM104BQ5XKR9 115 aa8.61□□□□□ -1.03
HPS1-211ENST00000478087 BAALCQ8WXS3 180 aa8.61□□□□□ -1.03
HPS1-211ENST00000478087 KLK12Q9UKR0 248 aa8.61□□□□□ -1.03
HPS1-211ENST00000478087 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa8.61□□□□□ -1.03
HPS1-211ENST00000478087 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
HPS1-211ENST00000478087 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa8.6□□□□□ -1.03
HPS1-211ENST00000478087 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa8.6□□□□□ -1.03
HPS1-211ENST00000478087 SNAPINO95295 136 aa8.6□□□□□ -1.03
HPS1-211ENST00000478087 NCR2O95944 276 aa8.6□□□□□ -1.03
HPS1-211ENST00000478087 PPBPP02775 128 aa8.6□□□□□ -1.03
HPS1-211ENST00000478087 CAMPP49913 170 aa8.6□□□□□ -1.03
HPS1-211ENST00000478087 COTL1Q14019 142 aa8.6□□□□□ -1.03
HPS1-211ENST00000478087 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
HPS1-211ENST00000478087 AMN1Q8IY45 258 aa8.6□□□□□ -1.03
HPS1-211ENST00000478087 SVBPQ8N300 66 aa8.6□□□□□ -1.03
HPS1-211ENST00000478087 RNF185Q96GF1 192 aa8.6□□□□□ -1.03
HPS1-211ENST00000478087 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa8.59□□□□□ -1.03
HPS1-211ENST00000478087 IQCJQ1A5X6 159 aa8.59□□□□□ -1.03
HPS1-211ENST00000478087 COX19Q49B96 90 aa8.59□□□□□ -1.03
HPS1-211ENST00000478087 LINC01620Q4KN68 170 aa8.59□□□□□ -1.03
HPS1-211ENST00000478087 CLRN3Q8NCR9 226 aa8.59□□□□□ -1.03
HPS1-211ENST00000478087 TM2D2Q9BX73 214 aa8.59□□□□□ -1.03
HPS1-211ENST00000478087 ST20Q9HBF5 79 aa8.59□□□□□ -1.03
HPS1-211ENST00000478087 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
HPS1-211ENST00000478087 A0A087WX48 190 aa8.58□□□□□ -1.04
HPS1-211ENST00000478087 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa8.58□□□□□ -1.04
HPS1-211ENST00000478087 C7orf77A4D0Y5 90 aa8.58□□□□□ -1.04
HPS1-211ENST00000478087 PHOX2AO14813 284 aa8.58□□□□□ -1.04
HPS1-211ENST00000478087 TCAPO15273 167 aa8.58□□□□□ -1.04
HPS1-211ENST00000478087 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
HPS1-211ENST00000478087 UBE2WQ96B02 151 aa8.58□□□□□ -1.04
HPS1-211ENST00000478087 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa8.57□□□□□ -1.04
HPS1-211ENST00000478087 SDHAF1A6NFY7 115 aa8.57□□□□□ -1.04
HPS1-211ENST00000478087 TMEM262E9PQX1 116 aa8.57□□□□□ -1.04
HPS1-211ENST00000478087 I3L3M4 83 aa8.57□□□□□ -1.04
HPS1-211ENST00000478087 APOC3P02656 99 aa8.57□□□□□ -1.04
HPS1-211ENST00000478087 CKS2P33552 79 aa8.57□□□□□ -1.04
HPS1-211ENST00000478087 Q5VSD8 79 aa8.57□□□□□ -1.04
HPS1-211ENST00000478087 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa8.57□□□□□ -1.04
HPS1-211ENST00000478087 C20orf78Q9BR46 151 aa8.57□□□□□ -1.04
HPS1-211ENST00000478087 CHCHD5Q9BSY4 110 aa8.57□□□□□ -1.04
HPS1-211ENST00000478087 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa8.56□□□□□ -1.04
HPS1-211ENST00000478087 H7C423 109 aa8.56□□□□□ -1.04
HPS1-211ENST00000478087 PMCHP20382 165 aa8.56□□□□□ -1.04
HPS1-211ENST00000478087 RPL32P62910 135 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
HPS1-211ENST00000478087 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
HPS1-211ENST00000478087 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
HPS1-211ENST00000478087 TMEM243Q9BU79 118 aa8.56□□□□□ -1.04
HPS1-211ENST00000478087 RPS10P5Q9NQ39 176 aa8.56□□□□□ -1.04
HPS1-211ENST00000478087 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa8.56□□□□□ -1.04
HPS1-211ENST00000478087 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa8.55□□□□□ -1.04
HPS1-211ENST00000478087 VCYO14598 125 aa8.55□□□□□ -1.04
HPS1-211ENST00000478087 AMTP48728 403 aa8.55□□□□□ -1.04
HPS1-211ENST00000478087 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
HPS1-211ENST00000478087 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
HPS1-211ENST00000478087 SMAGPQ0VAQ4 97 aa8.55□□□□□ -1.04
HPS1-211ENST00000478087 MPV17L2Q567V2 206 aa8.55□□□□□ -1.04
HPS1-211ENST00000478087 ENHOQ6UWT2 76 aa8.55□□□□□ -1.04
HPS1-211ENST00000478087 ORMDL3Q8N138 153 aa8.55□□□□□ -1.04
HPS1-211ENST00000478087 Q8N976 141 aa8.55□□□□□ -1.04
HPS1-211ENST00000478087 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa8.55□□□□□ -1.04
HPS1-211ENST00000478087 RMI2Q96E14 147 aa8.55□□□□□ -1.04
HPS1-211ENST00000478087 TMEM70Q9BUB7 260 aa8.55□□□□□ -1.04
HPS1-211ENST00000478087 COX11Q9Y6N1 276 aa8.55□□□□□ -1.04
HPS1-211ENST00000478087 HERC1Q15751 4861 aa8.55□□□□□ -1.04
HPS1-211ENST00000478087 MYCBP2O75592 4640 aa8.54□□□□□ -1.04
HPS1-211ENST00000478087 UBE2L6O14933 153 aa8.54□□□□□ -1.04
HPS1-211ENST00000478087 APCSP02743 223 aa8.54□□□□□ -1.04
HPS1-211ENST00000478087 INAFM2P0DMQ5 153 aa8.54□□□□□ -1.04
HPS1-211ENST00000478087 Q0VG73 95 aa8.54□□□□□ -1.04
HPS1-211ENST00000478087 KIR2DL4Q99706 377 aa8.54□□□□□ -1.04
HPS1-211ENST00000478087 A0A1B0GUV1 79 aa8.53□□□□□ -1.04
HPS1-211ENST00000478087 HLA-DQA1P01909 254 aa8.53□□□□□ -1.04
HPS1-211ENST00000478087 MT-ND6P03923 174 aa8.53□□□□□ -1.04
HPS1-211ENST00000478087 ATRAIDQ6UW56 229 aa8.53□□□□□ -1.04
HPS1-211ENST00000478087 NRACQ8N912 160 aa8.53□□□□□ -1.04
HPS1-211ENST00000478087 D6R8Y8 96 aa8.52□□□□□ -1.05
HPS1-211ENST00000478087 TNFRSF6BO95407 300 aa8.52□□□□□ -1.05
HPS1-211ENST00000478087 RPS10P46783 165 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
HPS1-211ENST00000478087 GAGE6Q13070 117 aa8.52□□□□□ -1.05
HPS1-211ENST00000478087 TMEM136Q6ZRR5 245 aa8.52□□□□□ -1.05
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