RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469694.5

GPC1-208, Transcript of glypican 1, humanhuman

TSL 2

Gene GPC1, Length 2,862 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1-208ENST00000469694 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa10.34□□□□□ -0.75
GPC1-208ENST00000469694 PSMB8P28062 276 aa10.34□□□□□ -0.75
GPC1-208ENST00000469694 LGALS9O00182 355 aa10.33□□□□□ -0.76
GPC1-208ENST00000469694 MGPP08493 103 aa10.33□□□□□ -0.76
GPC1-208ENST00000469694 ZNRF2Q8NHG8 242 aa10.33□□□□□ -0.76
GPC1-208ENST00000469694 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa10.33□□□□□ -0.76
GPC1-208ENST00000469694 TRAV2A0A0B4J234 112 aa10.33□□□□□ -0.76
GPC1-208ENST00000469694 PPP1R17O96001 155 aa10.33□□□□□ -0.76
GPC1-208ENST00000469694 RPL11P62913 178 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
GPC1-208ENST00000469694 U3KQE9 123 aa10.33□□□□□ -0.76
GPC1-208ENST00000469694 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
GPC1-208ENST00000469694 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
GPC1-208ENST00000469694 ZNF702PQ9H963 129 aa10.32□□□□□ -0.76
GPC1-208ENST00000469694 H3BMM0 161 aa10.32□□□□□ -0.76
GPC1-208ENST00000469694 H3BUA1 57 aa10.32□□□□□ -0.76
GPC1-208ENST00000469694 C9orf139Q6ZV77 190 aa10.32□□□□□ -0.76
GPC1-208ENST00000469694 UBE2WQ96B02 151 aa10.32□□□□□ -0.76
GPC1-208ENST00000469694 MUSTN1Q8IVN3 82 aa10.32□□□□□ -0.76
GPC1-208ENST00000469694 TMEM141Q96I45 108 aa10.32□□□□□ -0.76
GPC1-208ENST00000469694 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa10.32□□□□□ -0.76
GPC1-208ENST00000469694 SORL1Q92673 2214 aa10.32□□□□□ -0.76
GPC1-208ENST00000469694 NDUFA4O00483 81 aa10.31□□□□□ -0.76
GPC1-208ENST00000469694 ZNF876PQ49A33 203 aa10.31□□□□□ -0.76
GPC1-208ENST00000469694 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa10.31□□□□□ -0.76
GPC1-208ENST00000469694 S100A4P26447 101 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
GPC1-208ENST00000469694 Q1RN00 199 aa10.3□□□□□ -0.76
GPC1-208ENST00000469694 TIMM17AQ99595 171 aa10.3□□□□□ -0.76
GPC1-208ENST00000469694 TMEM126AQ9H061 195 aa10.3□□□□□ -0.76
GPC1-208ENST00000469694 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
GPC1-208ENST00000469694 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa10.3□□□□□ -0.76
GPC1-208ENST00000469694 RPL39P62891 51 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
GPC1-208ENST00000469694 C16orf92Q96LL3 132 aa10.3□□□□□ -0.76
GPC1-208ENST00000469694 C20orf173Q96LM9 149 aa10.3□□□□□ -0.76
GPC1-208ENST00000469694 C18orf65Q6ZTR6 163 aa10.29□□□□□ -0.76
GPC1-208ENST00000469694 POM121L12Q8N7R1 296 aa10.29□□□□□ -0.76
GPC1-208ENST00000469694 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa10.29□□□□□ -0.76
GPC1-208ENST00000469694 LENEPQ9Y5L5 61 aa10.29□□□□□ -0.76
GPC1-208ENST00000469694 CHCHD5Q9BSY4 110 aa10.29□□□□□ -0.76
GPC1-208ENST00000469694 F6UB75 175 aa10.28□□□□□ -0.76
GPC1-208ENST00000469694 C2orf82Q6UX34 121 aa10.28□□□□□ -0.76
GPC1-208ENST00000469694 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa10.28□□□□□ -0.76
GPC1-208ENST00000469694 A0A087WW49 117 aa10.28□□□□□ -0.76
GPC1-208ENST00000469694 LEPROTO15243 131 aa10.28□□□□□ -0.76
GPC1-208ENST00000469694 TRIAP1O43715 76 aa10.28□□□□□ -0.76
GPC1-208ENST00000469694 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
GPC1-208ENST00000469694 DEFB136Q30KP8 78 aa10.28□□□□□ -0.76
GPC1-208ENST00000469694 LINC01587Q99440 93 aa10.28□□□□□ -0.76
GPC1-208ENST00000469694 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP10.28□□□□□ -0.76
GPC1-208ENST00000469694 TRAV21A0A0B4J279 112 aa10.28□□□□□ -0.76
GPC1-208ENST00000469694 KRTAP1-1Q07627 177 aa10.28□□□□□ -0.76
GPC1-208ENST00000469694 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa10.28□□□□□ -0.76
GPC1-208ENST00000469694 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
GPC1-208ENST00000469694 H7C423 109 aa10.27□□□□□ -0.77
GPC1-208ENST00000469694 MED14OSP0DP75 135 aa10.27□□□□□ -0.77
GPC1-208ENST00000469694 SMR3AQ99954 134 aa10.27□□□□□ -0.77
GPC1-208ENST00000469694 OTOGQ6ZRI0 2925 aa10.27□□□□□ -0.77
GPC1-208ENST00000469694 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa10.27□□□□□ -0.77
GPC1-208ENST00000469694 TMEM223A0PJW6 202 aa10.27□□□□□ -0.77
GPC1-208ENST00000469694 LINC00315P59091 139 aa10.27□□□□□ -0.77
GPC1-208ENST00000469694 ZNF56Q15929 161 aa10.27□□□□□ -0.77
GPC1-208ENST00000469694 DUX3Q96PT4 197 aa10.27□□□□□ -0.77
GPC1-208ENST00000469694 PPDPFQ9H3Y8 114 aa10.27□□□□□ -0.77
GPC1-208ENST00000469694 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa10.26□□□□□ -0.77
GPC1-208ENST00000469694 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa10.26□□□□□ -0.77
GPC1-208ENST00000469694 VCYO14598 125 aa10.26□□□□□ -0.77
GPC1-208ENST00000469694 SYNJ2BPP57105 145 aa10.26□□□□□ -0.77
GPC1-208ENST00000469694 YAE1D1Q9NRH1 226 aa10.26□□□□□ -0.77
GPC1-208ENST00000469694 M0R2P5 195 aa10.25□□□□□ -0.77
GPC1-208ENST00000469694 LINC00477Q96M19 166 aa10.25□□□□□ -0.77
GPC1-208ENST00000469694 ESM1Q9NQ30 184 aa10.25□□□□□ -0.77
GPC1-208ENST00000469694 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
GPC1-208ENST00000469694 H3BT86 120 aa10.25□□□□□ -0.77
GPC1-208ENST00000469694 GNRH2O43555 120 aa10.25□□□□□ -0.77
GPC1-208ENST00000469694 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
GPC1-208ENST00000469694 DEFB121Q5J5C9 76 aa10.25□□□□□ -0.77
GPC1-208ENST00000469694 C3orf56Q8N813 242 aa10.25□□□□□ -0.77
GPC1-208ENST00000469694 C11orf44Q8N8P7 122 aa10.25□□□□□ -0.77
GPC1-208ENST00000469694 ZNF580Q9UK33 172 aa10.24□□□□□ -0.77
GPC1-208ENST00000469694 WNK1Q9H4A3 2382 aa10.24□□□□□ -0.77
GPC1-208ENST00000469694 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa10.24□□□□□ -0.77
GPC1-208ENST00000469694 A0A0J9YX75 114 aa10.24□□□□□ -0.77
GPC1-208ENST00000469694 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa10.24□□□□□ -0.77
GPC1-208ENST00000469694 SOCS3O14543 225 aa10.24□□□□□ -0.77
GPC1-208ENST00000469694 SDHAF1A6NFY7 115 aa10.23□□□□□ -0.77
GPC1-208ENST00000469694 ICOSQ9Y6W8 199 aa10.23□□□□□ -0.77
GPC1-208ENST00000469694 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa10.22□□□□□ -0.77
GPC1-208ENST00000469694 A0A0J9YXY3 114 aa10.22□□□□□ -0.77
GPC1-208ENST00000469694 NXPH4O95158 308 aa10.22□□□□□ -0.77
GPC1-208ENST00000469694 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
GPC1-208ENST00000469694 SUMO4Q6EEV6 95 aa10.22□□□□□ -0.77
GPC1-208ENST00000469694 HIVEP2P31629 2446 aa10.22□□□□□ -0.77
GPC1-208ENST00000469694 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
GPC1-208ENST00000469694 MUC4Q99102 2169 aa10.21□□□□□ -0.77
GPC1-208ENST00000469694 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa10.21□□□□□ -0.77
GPC1-208ENST00000469694 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
GPC1-208ENST00000469694 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
GPC1-208ENST00000469694 SLURP1P55000 103 aa10.21□□□□□ -0.77
GPC1-208ENST00000469694 Q6ZSV7 163 aa10.21□□□□□ -0.78
GPC1-208ENST00000469694 COX6CP09669 75 aa10.2□□□□□ -0.78
GPC1-208ENST00000469694 ID1P41134 155 aa10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms