RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469034.1

SUMO1-210, Transcript of small ubiquitin-like modifier 1, human

TSL 3

Gene SUMO1, Length 511 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SUMO1-210	ENST00000469034	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	SPANXC	Q9NY87	97 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	COL6A3	P12111	3177 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	PKDREJ	Q9NTG1	2253 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	IGHV1OR15-1	A0A075B7D0	117 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034		A8MTW9	85 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034		H3BUX3	64 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034		H7C2G1	150 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	TIMM17B	O60830	172 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	IGHV4-39	P01824	125 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	RBMY1A1	P0DJD3	496 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	RBMY1C	P0DJD4	496 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	NDUFV3	P56181	108 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	GAGE2B	Q13066	116 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	RBMY1F	Q15415	496 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	ZNF56	Q15929	161 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	MRPL23	Q16540	153 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	LY6E	Q16553	131 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	GAGE2E	Q4V326	116 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	UBTD1	Q9HAC8	227 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	SS18L2	Q9UHA2	77 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	CELSR3	Q9NYQ7	3312 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	POLE	Q07864	2286 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	ZNF318	Q5VUA4	2279 aa		3.39	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	IGHV4-61	A0A0C4DH41	118 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	TEX49	A0A1B0GTD5	131 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	TINCR	A0A1B0GVN0	87 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034		H3BMM0	161 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034		H3BT86	120 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	CCDC179	H3BU77	68 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	C19orf84	I3L1E1	186 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	PRY	O14603	147 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	PRSS2	P07478	247 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	MIA	Q16674	131 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034		Q6ZSV7	163 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	UBE2W	Q96B02	151 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	OTOGL	Q3ZCN5	2332 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	APC2	O95996	2303 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	ROS1	P08922	2347 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	TMEM89	A2RUT3	159 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	RBMY1B	A6NDE4	496 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	RBMY1E	A6NEQ0	496 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034		A8MZ25	164 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	LST1	O00453	97 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	RBMY1D	P0C7P1	496 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	CD28	P10747	220 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	IFITM1	P13164	125 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	PSMB8	P28062	276 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	CEMP1	Q6PRD7	247 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	C2orf82	Q6UX34	121 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	TMEM61	Q8N0U2	210 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	C10orf105	Q8TEF2	133 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	CLEC2B	Q92478	149 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	SPX	Q9BT56	116 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	SPANXA1	Q9NS26	97 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	BEX4	Q9NWD9	120 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034		Q9UF83	564 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	NACA	E9PAV3	2078 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	PCNX1	Q96RV3	2341 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	VPS13A	Q96RL7	3174 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	TRBV7-7	A0A0K0K1E9	115 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	FAM240A	A0A1B0GVK7	77 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	GAGE12J	A6NER3	117 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	NDUFA1	O15239	70 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	SNCG	O76070	127 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	GAGE7	O76087	117 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	GAGE12F	P0CL80	117 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	GAGE12G	P0CL81	117 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	GAGE12I	P0CL82	117 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	GAGE4	Q13068	117 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034		Q1RN00	199 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	C10orf99	Q6UWK7	81 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	FAM19A3	Q7Z5A8	133 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	LINC00467	Q9BRT7	94 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	YAE1D1	Q9NRH1	226 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SUMO1-210	ENST00000469034	FRY	Q5TBA9	3013 aa		3.36	□□□□□ -1.87

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