RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468576.1

PTPRG-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type G, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRG, Length 854 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Dendrite, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRG-202ENST00000468576 NAV2Q8IVL1 2488 aa0.45□□□□□ -2.34
PTPRG-202ENST00000468576 IFITM1P13164 125 aa0.45□□□□□ -2.34
PTPRG-202ENST00000468576 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
PTPRG-202ENST00000468576 Q8N8P6 123 aa0.45□□□□□ -2.34
PTPRG-202ENST00000468576 DYNLRB1Q9NP97 96 aa0.45□□□□□ -2.34
PTPRG-202ENST00000468576 SCN3BQ9NY72 215 aa0.45□□□□□ -2.34
PTPRG-202ENST00000468576 SPCS1Q9Y6A9 102 aa0.45□□□□□ -2.34
PTPRG-202ENST00000468576 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
PTPRG-202ENST00000468576 BICRAQ9NZM4 1560 aa0.45□□□□□ -2.34
PTPRG-202ENST00000468576 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
PTPRG-202ENST00000468576 ZNF815PA8K554 130 aa0.44□□□□□ -2.34
PTPRG-202ENST00000468576 TNFP01375 233 aa0.44□□□□□ -2.34
PTPRG-202ENST00000468576 CCL18P55774 89 aa0.44□□□□□ -2.34
PTPRG-202ENST00000468576 TMEM170BQ5T4T1 132 aa0.44□□□□□ -2.34
PTPRG-202ENST00000468576 SVBPQ8N300 66 aa0.44□□□□□ -2.34
PTPRG-202ENST00000468576 UQCR10Q9UDW1 63 aa0.44□□□□□ -2.34
PTPRG-202ENST00000468576 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP0.43□□□□□ -2.34
PTPRG-202ENST00000468576 F6UZH7 168 aa0.43□□□□□ -2.34
PTPRG-202ENST00000468576 M0R135 149 aa0.43□□□□□ -2.34
PTPRG-202ENST00000468576 GNG4P50150 75 aa0.43□□□□□ -2.34
PTPRG-202ENST00000468576 C9orf153Q5TBE3 101 aa0.43□□□□□ -2.34
PTPRG-202ENST00000468576 COMMD6Q7Z4G1 85 aa0.43□□□□□ -2.34
PTPRG-202ENST00000468576 C5orf38Q86SI9 138 aa0.43□□□□□ -2.34
PTPRG-202ENST00000468576 BAGE2Q86Y30 109 aa0.43□□□□□ -2.34
PTPRG-202ENST00000468576 CNFNQ9BYD5 112 aa0.43□□□□□ -2.34
PTPRG-202ENST00000468576 GNG8Q9UK08 70 aa0.43□□□□□ -2.34
PTPRG-202ENST00000468576 COL6A3P12111 3177 aa0.43□□□□□ -2.34
PTPRG-202ENST00000468576 UBR4Q5T4S7 5183 aa0.43□□□□□ -2.34
PTPRG-202ENST00000468576 ABCA12Q86UK0 2595 aa0.43□□□□□ -2.34
PTPRG-202ENST00000468576 TPRP12270 2363 aaKnown RBP0.42□□□□□ -2.34
PTPRG-202ENST00000468576 TNCP24821 2201 aa0.42□□□□□ -2.34
PTPRG-202ENST00000468576 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa0.42□□□□□ -2.34
PTPRG-202ENST00000468576 WDR7Q9Y4E6 1490 aa0.42□□□□□ -2.34
PTPRG-202ENST00000468576 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP0.42□□□□□ -2.34
PTPRG-202ENST00000468576 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa0.42□□□□□ -2.34
PTPRG-202ENST00000468576 CLPSL1A2RUU4 121 aa0.42□□□□□ -2.34
PTPRG-202ENST00000468576 UQCR11O14957 56 aa0.42□□□□□ -2.34
PTPRG-202ENST00000468576 CFDP00746 253 aaPredicted RBP0.42□□□□□ -2.34
PTPRG-202ENST00000468576 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP0.42□□□□□ -2.34
PTPRG-202ENST00000468576 HAMPP81172 84 aa0.42□□□□□ -2.34
PTPRG-202ENST00000468576 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa0.42□□□□□ -2.34
PTPRG-202ENST00000468576 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa0.42□□□□□ -2.34
PTPRG-202ENST00000468576 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP0.42□□□□□ -2.34
PTPRG-202ENST00000468576 AMELXQ99217 191 aa0.42□□□□□ -2.34
PTPRG-202ENST00000468576 FAIMQ9NVQ4 179 aa0.42□□□□□ -2.34
PTPRG-202ENST00000468576 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP0.42□□□□□ -2.34
PTPRG-202ENST00000468576 TTC28Q96AY4 2481 aa0.42□□□□□ -2.34
PTPRG-202ENST00000468576 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP0.42□□□□□ -2.34
PTPRG-202ENST00000468576 CACNA1HO95180 2353 aa0.41□□□□□ -2.34
PTPRG-202ENST00000468576 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP0.41□□□□□ -2.34
PTPRG-202ENST00000468576 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa0.41□□□□□ -2.34
PTPRG-202ENST00000468576 TRAV22A0A0B4J277 110 aa0.41□□□□□ -2.34
PTPRG-202ENST00000468576 F8VRH5 84 aa0.41□□□□□ -2.34
PTPRG-202ENST00000468576 DLEU1O43261 78 aa0.41□□□□□ -2.34
PTPRG-202ENST00000468576 PPP3R1P63098 170 aa0.41□□□□□ -2.34
PTPRG-202ENST00000468576 DCDP81605 110 aaKnown RBP0.41□□□□□ -2.34
PTPRG-202ENST00000468576 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa0.41□□□□□ -2.34
PTPRG-202ENST00000468576 PI4KAP42356 2102 aa0.41□□□□□ -2.34
PTPRG-202ENST00000468576 MDN1Q9NU22 5596 aa0.41□□□□□ -2.34
PTPRG-202ENST00000468576 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP0.4□□□□□ -2.34
PTPRG-202ENST00000468576 MYH7P12883 1935 aa0.4□□□□□ -2.34
PTPRG-202ENST00000468576 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa0.4□□□□□ -2.35
PTPRG-202ENST00000468576 PHGR1C9JFL3 82 aa0.4□□□□□ -2.35
PTPRG-202ENST00000468576 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa0.4□□□□□ -2.35
PTPRG-202ENST00000468576 PRO0255Q9UI72 69 aa0.4□□□□□ -2.35
PTPRG-202ENST00000468576 FRAS1Q86XX4 4008 aa0.4□□□□□ -2.35
PTPRG-202ENST00000468576 GOLGA3Q08378 1498 aa0.4□□□□□ -2.35
PTPRG-202ENST00000468576 SHANK2Q9UPX8 1470 aa0.4□□□□□ -2.35
PTPRG-202ENST00000468576 SSC5DA1L4H1 1573 aa0.4□□□□□ -2.35
PTPRG-202ENST00000468576 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa0.39□□□□□ -2.35
PTPRG-202ENST00000468576 MUC2Q02817 5179 aa0.39□□□□□ -2.35
PTPRG-202ENST00000468576 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa0.39□□□□□ -2.35
PTPRG-202ENST00000468576 MYH8P13535 1937 aa0.39□□□□□ -2.35
PTPRG-202ENST00000468576 S100A1P23297 94 aa0.39□□□□□ -2.35
PTPRG-202ENST00000468576 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa0.39□□□□□ -2.35
PTPRG-202ENST00000468576 PCLOQ9Y6V0 5065 aa0.39□□□□□ -2.35
PTPRG-202ENST00000468576 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa0.38□□□□□ -2.35
PTPRG-202ENST00000468576 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa0.38□□□□□ -2.35
PTPRG-202ENST00000468576 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP0.38□□□□□ -2.35
PTPRG-202ENST00000468576 A2ML1A8K2U0 1454 aa0.38□□□□□ -2.35
PTPRG-202ENST00000468576 MRC1P22897 1456 aa0.38□□□□□ -2.35
PTPRG-202ENST00000468576 BCL9LQ86UU0 1499 aa0.38□□□□□ -2.35
PTPRG-202ENST00000468576 G3V318 75 aa0.38□□□□□ -2.35
PTPRG-202ENST00000468576 CORTO00230 105 aa0.38□□□□□ -2.35
PTPRG-202ENST00000468576 MGPP08493 103 aa0.38□□□□□ -2.35
PTPRG-202ENST00000468576 KRTDAPP60985 99 aa0.38□□□□□ -2.35
PTPRG-202ENST00000468576 GNG11P61952 73 aa0.38□□□□□ -2.35
PTPRG-202ENST00000468576 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa0.38□□□□□ -2.35
PTPRG-202ENST00000468576 U3KQA8 63 aa0.38□□□□□ -2.35
PTPRG-202ENST00000468576 PIEZO1Q92508 2521 aa0.37□□□□□ -2.35
PTPRG-202ENST00000468576 ERCC6L2Q5T890 1561 aa0.37□□□□□ -2.35
PTPRG-202ENST00000468576 MBD5Q9P267 1494 aa0.37□□□□□ -2.35
PTPRG-202ENST00000468576 NAP1L6A6NFF2 107 aa0.37□□□□□ -2.35
PTPRG-202ENST00000468576 M0R3E3 92 aa0.37□□□□□ -2.35
PTPRG-202ENST00000468576 COX6CP09669 75 aa0.37□□□□□ -2.35
PTPRG-202ENST00000468576 PIGYQ3MUY2 71 aa0.37□□□□□ -2.35
PTPRG-202ENST00000468576 LRRC37A2A6NM11 1700 aa0.37□□□□□ -2.35
PTPRG-202ENST00000468576 ARAP2Q8WZ64 1704 aa0.37□□□□□ -2.35
PTPRG-202ENST00000468576 IFT172Q9UG01 1749 aa0.37□□□□□ -2.35
PTPRG-202ENST00000468576 F8P00451 2351 aa0.37□□□□□ -2.35
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