RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455953.1

NCBP2-208, Transcript of nuclear cap binding protein subunit 2, human

TSL 5

Gene NCBP2, Length 548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NCBP2-208	ENST00000455953	MED9	Q9NWA0	146 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NCBP2-208	ENST00000455953	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
NCBP2-208	ENST00000455953	SULT1A2	P50226	295 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NCBP2-208	ENST00000455953	GAGE6	Q13070	117 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NCBP2-208	ENST00000455953	COTL1	Q14019	142 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NCBP2-208	ENST00000455953	MPV17L2	Q567V2	206 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NCBP2-208	ENST00000455953	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NCBP2-208	ENST00000455953	TMEM243	Q9BU79	118 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NCBP2-208	ENST00000455953	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NCBP2-208	ENST00000455953	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
NCBP2-208	ENST00000455953	SNAI2	O43623	268 aa		4.7	□□□□□ -1.66
NCBP2-208	ENST00000455953	CCL20	P78556	96 aa		4.7	□□□□□ -1.66
NCBP2-208	ENST00000455953	TWIST1	Q15672	202 aa		4.7	□□□□□ -1.66
NCBP2-208	ENST00000455953	CFAP161	Q6P656	301 aa		4.7	□□□□□ -1.66
NCBP2-208	ENST00000455953	RASL11A	Q6T310	242 aa		4.7	□□□□□ -1.66
NCBP2-208	ENST00000455953	ATRAID	Q6UW56	229 aa		4.7	□□□□□ -1.66
NCBP2-208	ENST00000455953	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		4.7	□□□□□ -1.66
NCBP2-208	ENST00000455953	VAX2	Q9UIW0	290 aa		4.7	□□□□□ -1.66
NCBP2-208	ENST00000455953	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		4.7	□□□□□ -1.66
NCBP2-208	ENST00000455953	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NCBP2-208	ENST00000455953	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NCBP2-208	ENST00000455953	hDV102S1	A0JD36	115 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NCBP2-208	ENST00000455953	USP17L23	D6RBM5	183 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NCBP2-208	ENST00000455953	GZMB	P10144	247 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NCBP2-208	ENST00000455953	AMT	P48728	403 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NCBP2-208	ENST00000455953	NKX2-5	P52952	324 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
NCBP2-208	ENST00000455953	CEBPG	P53567	150 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NCBP2-208	ENST00000455953	REG3A	Q06141	175 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NCBP2-208	ENST00000455953	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NCBP2-208	ENST00000455953	TEX261	Q6UWH6	196 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NCBP2-208	ENST00000455953	SLC51B	Q86UW2	128 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NCBP2-208	ENST00000455953	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NCBP2-208	ENST00000455953		Q8N9P0	234 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
NCBP2-208	ENST00000455953	BTF3L4	Q96K17	158 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NCBP2-208	ENST00000455953	FAM210A	Q96ND0	272 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NCBP2-208	ENST00000455953	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NCBP2-208	ENST00000455953	TRAV1-1	A0A0B4J248	108 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NCBP2-208	ENST00000455953	APCS	P02743	223 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NCBP2-208	ENST00000455953	BCL2	P10415	239 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NCBP2-208	ENST00000455953	RBX1	P62877	108 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NCBP2-208	ENST00000455953	SMAGP	Q0VAQ4	97 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NCBP2-208	ENST00000455953	LINC01620	Q4KN68	170 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NCBP2-208	ENST00000455953	RNASEK	Q6P5S7	137 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
NCBP2-208	ENST00000455953	SCX	Q7RTU7	201 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NCBP2-208	ENST00000455953	C11orf52	Q96A22	123 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NCBP2-208	ENST00000455953	TMEM101	Q96IK0	257 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NCBP2-208	ENST00000455953	RPP21	Q9H633	154 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
NCBP2-208	ENST00000455953	NIT2	Q9NQR4	276 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NCBP2-208	ENST00000455953		Q9UF83	564 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NCBP2-208	ENST00000455953	LRP1B	Q9NZR2	4599 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NCBP2-208	ENST00000455953	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
NCBP2-208	ENST00000455953	HSPG2	P98160	4391 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NCBP2-208	ENST00000455953	IGLV10-54	A0A075B6I4	117 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NCBP2-208	ENST00000455953	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NCBP2-208	ENST00000455953	IGKV3OR2-268	A0A0C4DH90	116 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NCBP2-208	ENST00000455953	RAB19	A4D1S5	217 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NCBP2-208	ENST00000455953		G3V3Q6	166 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NCBP2-208	ENST00000455953	IGLV2-8	P01709	118 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NCBP2-208	ENST00000455953	NTF3	P20783	257 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NCBP2-208	ENST00000455953	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
NCBP2-208	ENST00000455953	WFDC2	Q14508	124 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NCBP2-208	ENST00000455953	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NCBP2-208	ENST00000455953	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NCBP2-208	ENST00000455953	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NCBP2-208	ENST00000455953	AKAP14	Q86UN6	197 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NCBP2-208	ENST00000455953	APOB	P04114	4563 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
NCBP2-208	ENST00000455953		A8MWL6	223 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NCBP2-208	ENST00000455953	GATC	O43716	136 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
NCBP2-208	ENST00000455953	ENHO	Q6UWT2	76 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NCBP2-208	ENST00000455953	C7orf33	Q8WU49	177 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NCBP2-208	ENST00000455953	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NCBP2-208	ENST00000455953	EIF5A2	Q9GZV4	153 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
NCBP2-208	ENST00000455953		A0A1B0GUV1	79 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NCBP2-208	ENST00000455953		M0QY20	66 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NCBP2-208	ENST00000455953	NCR2	O95944	276 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NCBP2-208	ENST00000455953	IGLC6	P0CF74	106 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NCBP2-208	ENST00000455953	PMCH	P20382	165 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NCBP2-208	ENST00000455953	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
NCBP2-208	ENST00000455953		Q6ZSA8	131 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NCBP2-208	ENST00000455953	TCTE3	Q8IZS6	198 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NCBP2-208	ENST00000455953	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NCBP2-208	ENST00000455953	C19orf71	A6NCJ1	209 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NCBP2-208	ENST00000455953		H7C423	109 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NCBP2-208	ENST00000455953	CTRL	P40313	264 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NCBP2-208	ENST00000455953	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NCBP2-208	ENST00000455953	C9orf62	Q8N4C0	152 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NCBP2-208	ENST00000455953	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NCBP2-208	ENST00000455953	PRR34	Q9NV39	138 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NCBP2-208	ENST00000455953	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NCBP2-208	ENST00000455953	TMEM250	H0YL14	139 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NCBP2-208	ENST00000455953		I3L3M4	83 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NCBP2-208	ENST00000455953	PPP1R17	O96001	155 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NCBP2-208	ENST00000455953	OXT	P01178	125 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NCBP2-208	ENST00000455953	PRSS1	P07477	247 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NCBP2-208	ENST00000455953	ZNF25	P17030	456 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
NCBP2-208	ENST00000455953	FCER1G	P30273	86 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NCBP2-208	ENST00000455953	SS18	Q15532	418 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NCBP2-208	ENST00000455953	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NCBP2-208	ENST00000455953	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NCBP2-208	ENST00000455953	OR5A1	Q8NGJ0	315 aa		4.63	□□□□□ -1.67

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