RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454947.1

SH3BP4-207, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP4, Length 500 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-207ENST00000454947 HIST2H2BEQ16778 126 aa6.44□□□□□ -1.38
SH3BP4-207ENST00000454947 IQCJQ1A5X6 159 aa6.44□□□□□ -1.38
SH3BP4-207ENST00000454947 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
SH3BP4-207ENST00000454947 LYPD5Q6UWN5 251 aa6.44□□□□□ -1.38
SH3BP4-207ENST00000454947 Q8N8P6 123 aa6.44□□□□□ -1.38
SH3BP4-207ENST00000454947 HIST1H2BHQ93079 126 aa6.44□□□□□ -1.38
SH3BP4-207ENST00000454947 HIST1H2BNQ99877 126 aa6.44□□□□□ -1.38
SH3BP4-207ENST00000454947 HIST1H2BMQ99879 126 aa6.44□□□□□ -1.38
SH3BP4-207ENST00000454947 UPK3BQ9BT76 320 aa6.44□□□□□ -1.38
SH3BP4-207ENST00000454947 MAP1LC3AQ9H492 121 aa6.44□□□□□ -1.38
SH3BP4-207ENST00000454947 RYR2Q92736 4967 aa6.44□□□□□ -1.38
SH3BP4-207ENST00000454947 KMT2AQ03164 3969 aa6.43□□□□□ -1.38
SH3BP4-207ENST00000454947 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa6.43□□□□□ -1.38
SH3BP4-207ENST00000454947 PMCHP20382 165 aa6.43□□□□□ -1.38
SH3BP4-207ENST00000454947 ESRGQ1W209 222 aa6.43□□□□□ -1.38
SH3BP4-207ENST00000454947 TMEM97Q5BJF2 176 aa6.43□□□□□ -1.38
SH3BP4-207ENST00000454947 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
SH3BP4-207ENST00000454947 LELP1Q5T871 98 aa6.43□□□□□ -1.38
SH3BP4-207ENST00000454947 CHCHD7Q9BUK0 85 aa6.43□□□□□ -1.38
SH3BP4-207ENST00000454947 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
SH3BP4-207ENST00000454947 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
SH3BP4-207ENST00000454947 DNAH2Q9P225 4427 aa6.43□□□□□ -1.38
SH3BP4-207ENST00000454947 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa6.42□□□□□ -1.38
SH3BP4-207ENST00000454947 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa6.42□□□□□ -1.38
SH3BP4-207ENST00000454947 TCAPO15273 167 aa6.42□□□□□ -1.38
SH3BP4-207ENST00000454947 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
SH3BP4-207ENST00000454947 COTL1Q14019 142 aa6.42□□□□□ -1.38
SH3BP4-207ENST00000454947 LINC00588Q9Y4M8 146 aa6.42□□□□□ -1.38
SH3BP4-207ENST00000454947 HYDINQ4G0P3 5121 aa6.41□□□□□ -1.38
SH3BP4-207ENST00000454947 KIR2DL4Q99706 377 aa6.41□□□□□ -1.38
SH3BP4-207ENST00000454947 A0A096LNJ9 63 aa6.4□□□□□ -1.38
SH3BP4-207ENST00000454947 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa6.4□□□□□ -1.38
SH3BP4-207ENST00000454947 H7C423 109 aa6.4□□□□□ -1.38
SH3BP4-207ENST00000454947 TTC32Q5I0X7 151 aa6.4□□□□□ -1.38
SH3BP4-207ENST00000454947 C20orf203Q8NBC4 194 aa6.4□□□□□ -1.38
SH3BP4-207ENST00000454947 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
SH3BP4-207ENST00000454947 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa6.39□□□□□ -1.39
SH3BP4-207ENST00000454947 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa6.39□□□□□ -1.39
SH3BP4-207ENST00000454947 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa6.39□□□□□ -1.39
SH3BP4-207ENST00000454947 C1orf196B1AJZ1 125 aa6.39□□□□□ -1.39
SH3BP4-207ENST00000454947 SIVA1O15304 175 aa6.39□□□□□ -1.39
SH3BP4-207ENST00000454947 DNAH10OSP0CZ25 163 aa6.39□□□□□ -1.39
SH3BP4-207ENST00000454947 AMTP48728 403 aa6.39□□□□□ -1.39
SH3BP4-207ENST00000454947 PKIAP61925 76 aa6.39□□□□□ -1.39
SH3BP4-207ENST00000454947 ORMDL2Q53FV1 153 aa6.39□□□□□ -1.39
SH3BP4-207ENST00000454947 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SH3BP4-207ENST00000454947 NIT1Q86X76 327 aa6.39□□□□□ -1.39
SH3BP4-207ENST00000454947 TMEM243Q9BU79 118 aa6.39□□□□□ -1.39
SH3BP4-207ENST00000454947 AP5S1Q9NUS5 200 aa6.39□□□□□ -1.39
SH3BP4-207ENST00000454947 LINC00614P0C842 121 aa6.38□□□□□ -1.39
SH3BP4-207ENST00000454947 RAB5BP61020 215 aa6.38□□□□□ -1.39
SH3BP4-207ENST00000454947 LAGE3Q14657 143 aa6.38□□□□□ -1.39
SH3BP4-207ENST00000454947 LINC01556Q5JQF7 62 aa6.38□□□□□ -1.39
SH3BP4-207ENST00000454947 WFDC10BQ8IUB3 73 aa6.38□□□□□ -1.39
SH3BP4-207ENST00000454947 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa6.38□□□□□ -1.39
SH3BP4-207ENST00000454947 FAM104AQ969W3 186 aa6.38□□□□□ -1.39
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SH3BP4-207ENST00000454947 K7EP13 123 aa6.37□□□□□ -1.39
SH3BP4-207ENST00000454947 NUPR1O60356 82 aa6.37□□□□□ -1.39
SH3BP4-207ENST00000454947 SERF1AO75920 110 aa6.37□□□□□ -1.39
SH3BP4-207ENST00000454947 FCER1GP30273 86 aa6.37□□□□□ -1.39
SH3BP4-207ENST00000454947 FA2HQ7L5A8 372 aa6.37□□□□□ -1.39
SH3BP4-207ENST00000454947 C10orf126Q8N4M7 172 aa6.37□□□□□ -1.39
SH3BP4-207ENST00000454947 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa6.37□□□□□ -1.39
SH3BP4-207ENST00000454947 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa6.37□□□□□ -1.39
SH3BP4-207ENST00000454947 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
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SH3BP4-207ENST00000454947 DNAH10Q8IVF4 4471 aa6.36□□□□□ -1.39
SH3BP4-207ENST00000454947 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa6.36□□□□□ -1.39
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SH3BP4-207ENST00000454947 M0R2N4 97 aa6.36□□□□□ -1.39
SH3BP4-207ENST00000454947 NPSP0C0P6 89 aa6.36□□□□□ -1.39
SH3BP4-207ENST00000454947 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
SH3BP4-207ENST00000454947 PDZD11Q5EBL8 140 aa6.36□□□□□ -1.39
SH3BP4-207ENST00000454947 C2orf66Q6UXQ4 117 aa6.36□□□□□ -1.39
SH3BP4-207ENST00000454947 BAGE3Q86Y29 109 aa6.36□□□□□ -1.39
SH3BP4-207ENST00000454947 Q8N3U1 123 aa6.36□□□□□ -1.39
SH3BP4-207ENST00000454947 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa6.36□□□□□ -1.39
SH3BP4-207ENST00000454947 TOMM6Q96B49 74 aa6.36□□□□□ -1.39
SH3BP4-207ENST00000454947 SPANXA1Q9NS26 97 aa6.36□□□□□ -1.39
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SH3BP4-207ENST00000454947 A0A087WX48 190 aa6.35□□□□□ -1.39
SH3BP4-207ENST00000454947 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
SH3BP4-207ENST00000454947 LINC01549A6NIU2 74 aa6.35□□□□□ -1.39
SH3BP4-207ENST00000454947 UBE2L6O14933 153 aa6.35□□□□□ -1.39
SH3BP4-207ENST00000454947 FGF6P10767 208 aa6.35□□□□□ -1.39
SH3BP4-207ENST00000454947 RBX1P62877 108 aa6.35□□□□□ -1.39
SH3BP4-207ENST00000454947 RPL39P62891 51 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
SH3BP4-207ENST00000454947 MPV17L2Q567V2 206 aa6.35□□□□□ -1.39
SH3BP4-207ENST00000454947 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
SH3BP4-207ENST00000454947 TIMM17AQ99595 171 aa6.35□□□□□ -1.39
SH3BP4-207ENST00000454947 CHCHD5Q9BSY4 110 aa6.35□□□□□ -1.39
SH3BP4-207ENST00000454947 CYSLTR1Q9Y271 337 aa6.35□□□□□ -1.39
SH3BP4-207ENST00000454947 RYR3Q15413 4870 aa6.34□□□□□ -1.39
SH3BP4-207ENST00000454947 TMEM262E9PQX1 116 aa6.34□□□□□ -1.39
SH3BP4-207ENST00000454947 HBDP02042 147 aa6.34□□□□□ -1.39
SH3BP4-207ENST00000454947 G0S2P27469 103 aa6.34□□□□□ -1.39
SH3BP4-207ENST00000454947 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
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