RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453727.6

LMO3-210, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 5

Gene LMO3, Length 2,403 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-210ENST00000453727 Q8N8P6 123 aa6.39□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 AGRNO00468 2067 aa6.39□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 TRGV11A0A075B6L2 103 aa6.39□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 M0R3E3 92 aa6.39□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 EDN2P20800 178 aa6.39□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 LAGE3Q14657 143 aa6.39□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 PMVKQ15126 192 aa6.39□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 ATXN8Q156A1 80 aa6.39□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa6.39□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa6.38□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 CFC1BP0CG36 223 aa6.38□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 CFC1P0CG37 223 aa6.38□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 DEFB136Q30KP8 78 aa6.38□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 IGFL4Q6B9Z1 124 aa6.38□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 GAGE2AQ6NT46 116 aa6.38□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 MRAPQ8TCY5 172 aa6.38□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 LINC00526Q96FQ7 95 aa6.38□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa6.38□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa6.38□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 IMUPQ9GZP8 106 aa6.38□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 RBAKDNA6NC62 111 aa6.37□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 K7EMT4 169 aa6.37□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 CD28P10747 220 aa6.37□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 SYNJ2BPP57105 145 aa6.37□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 PROK1P58294 105 aa6.37□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 LINC01620Q4KN68 170 aa6.37□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 PLEKHB2Q96CS7 222 aa6.37□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 RNF185Q96GF1 192 aa6.37□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa6.37□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 SH2D1AO60880 128 aa6.37□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa6.37□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 C4orf3Q8WVX3 66 aa6.37□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 C8orf49Q96NF6 230 aa6.37□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa6.36□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 SLURP1P55000 103 aa6.36□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 HERVK_113P61574 105 aa6.36□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 Q1RN00 199 aa6.36□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 RNF182Q8N6D2 247 aa6.36□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 DUX3Q96PT4 197 aa6.36□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 ATRQ13535 2644 aa6.36□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa6.36□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 A0A1W2PRX2 142 aa6.36□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 H7C2G1 150 aa6.36□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 GAS8-AS1O95177 125 aa6.36□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 C2orf82Q6UX34 121 aa6.36□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 ATP5G1P05496 136 aa6.35□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 P0DMU3 169 aa6.35□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 FAM231AP0DMU4 169 aa6.35□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 FAM231CP0DMU5 169 aa6.35□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 ZNRF2Q8NHG8 242 aa6.35□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 SCGB3A1Q96QR1 104 aa6.35□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 PRR25Q96S07 402 aa6.35□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 SLC50A1Q9BRV3 221 aa6.35□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 MSRB1Q9NZV6 116 aa6.35□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa6.35□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 RPL11P62913 178 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 WNK1Q9H4A3 2382 aa6.35□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 A0A0J9YY99 117 aa6.34□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 PRAC2D3DTV9 90 aa6.34□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 IGHV3-30P01768 117 aa6.34□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa6.34□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 C16orf92Q96LL3 132 aa6.34□□□□□ -1.39
LMO3-210ENST00000453727 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa6.34□□□□□ -1.4
LMO3-210ENST00000453727 SOCS3O14543 225 aa6.34□□□□□ -1.4
LMO3-210ENST00000453727 TRACP01848 142 aa6.34□□□□□ -1.4
LMO3-210ENST00000453727 POM121L12Q8N7R1 296 aa6.34□□□□□ -1.4
LMO3-210ENST00000453727 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa6.34□□□□□ -1.4
LMO3-210ENST00000453727 ORM1P02763 201 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-210ENST00000453727 COX7CP15954 63 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-210ENST00000453727 KRTAP10-3P60369 221 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-210ENST00000453727 TMEM170BQ5T4T1 132 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-210ENST00000453727 C20orf173Q96LM9 149 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-210ENST00000453727 LINC01600Q96MT4 127 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-210ENST00000453727 F8WDY8 70 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-210ENST00000453727 IGHV3-33P01772 117 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-210ENST00000453727 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
LMO3-210ENST00000453727 TENM1Q9UKZ4 2725 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-210ENST00000453727 ACYP1P07311 99 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-210ENST00000453727 CRYGAP11844 174 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-210ENST00000453727 ERCC8Q13216 396 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-210ENST00000453727 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-210ENST00000453727 HRCT1Q6UXD1 115 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-210ENST00000453727 SLC25A29Q8N8R3 303 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-210ENST00000453727 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-210ENST00000453727 Q8TAT8 98 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-210ENST00000453727 H3BT86 120 aa6.31□□□□□ -1.4
LMO3-210ENST00000453727 CCL24O00175 119 aa6.31□□□□□ -1.4
LMO3-210ENST00000453727 C4orf26Q17RF5 130 aa6.31□□□□□ -1.4
LMO3-210ENST00000453727 ORMDL2Q53FV1 153 aa6.31□□□□□ -1.4
LMO3-210ENST00000453727 DCANP1Q8TF63 244 aa6.31□□□□□ -1.4
LMO3-210ENST00000453727 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
LMO3-210ENST00000453727 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa6.31□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.8 ms