RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446904.5

SH3BP4-206, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 829 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-206ENST00000446904 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa6.61□□□□□ -1.35
SH3BP4-206ENST00000446904 LYZL1Q6UWQ5 148 aa6.61□□□□□ -1.35
SH3BP4-206ENST00000446904 SDIM1Q6ZPB5 146 aa6.61□□□□□ -1.35
SH3BP4-206ENST00000446904 AKAP14Q86UN6 197 aa6.61□□□□□ -1.35
SH3BP4-206ENST00000446904 CLRN3Q8NCR9 226 aa6.61□□□□□ -1.35
SH3BP4-206ENST00000446904 MED9Q9NWA0 146 aa6.61□□□□□ -1.35
SH3BP4-206ENST00000446904 XKRY2A2RUG3 117 aa6.6□□□□□ -1.35
SH3BP4-206ENST00000446904 F2Z2F3 143 aa6.6□□□□□ -1.35
SH3BP4-206ENST00000446904 TEX46H3BTG2 121 aa6.6□□□□□ -1.35
SH3BP4-206ENST00000446904 PDE6DO43924 150 aa6.6□□□□□ -1.35
SH3BP4-206ENST00000446904 TRGC1P0CF51 173 aa6.6□□□□□ -1.35
SH3BP4-206ENST00000446904 CNBPP62633 177 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SH3BP4-206ENST00000446904 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SH3BP4-206ENST00000446904 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa6.59□□□□□ -1.35
SH3BP4-206ENST00000446904 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa6.59□□□□□ -1.35
SH3BP4-206ENST00000446904 A0A1B0GUV1 79 aa6.59□□□□□ -1.35
SH3BP4-206ENST00000446904 UBE2L6O14933 153 aa6.59□□□□□ -1.35
SH3BP4-206ENST00000446904 NTF3P20783 257 aa6.59□□□□□ -1.35
SH3BP4-206ENST00000446904 AMTP48728 403 aa6.59□□□□□ -1.35
SH3BP4-206ENST00000446904 SMIM12Q96EX1 92 aa6.59□□□□□ -1.35
SH3BP4-206ENST00000446904 DPH3P1Q9H4G8 78 aa6.59□□□□□ -1.35
SH3BP4-206ENST00000446904 NIT2Q9NQR4 276 aa6.59□□□□□ -1.35
SH3BP4-206ENST00000446904 SLPIP03973 132 aa6.58□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 BCL2P10415 239 aa6.58□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 CTRLP40313 264 aa6.58□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 SULT1A2P50226 295 aa6.58□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 COTL1Q14019 142 aa6.58□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 TWIST1Q15672 202 aa6.58□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC51BQ86UW2 128 aa6.58□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 C9orf62Q8N4C0 152 aa6.58□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 NUDT10Q8NFP7 164 aa6.58□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 DPH3Q96FX2 82 aa6.58□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 NUDT11Q96G61 164 aa6.58□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 PGLYRP4Q96LB8 373 aa6.58□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 BIN3Q9NQY0 253 aa6.58□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 AP5S1Q9NUS5 200 aa6.58□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa6.57□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa6.57□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa6.57□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 CHTF8P0CG12 524 aa6.57□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 GATD1Q8NB37 220 aa6.57□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.57□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 TNXBP22105 4242 aa6.56□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 GAGE12HA6NDE8 117 aa6.56□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 WDR73Q6P4I2 378 aa6.56□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 A0A087WYN8 130 aa6.55□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 K7EN84 100 aa6.55□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 C15orf56Q8N910 161 aa6.55□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 OCC1Q8TAD7 63 aa6.55□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 CNFNQ9BYD5 112 aa6.55□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 HIGD2BQ4VC39 106 aa6.54□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa6.54□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 CFAP161Q6P656 301 aa6.54□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 SPACA4Q8TDM5 124 aa6.54□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 GTSF1Q8WW33 167 aa6.54□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 RNF185Q96GF1 192 aa6.54□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 MT1HL1P0DM35 61 aa6.53□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 COX6A2Q02221 97 aa6.53□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 SMIM15Q7Z3B0 74 aa6.53□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
SH3BP4-206ENST00000446904 APCSP02743 223 aa6.52□□□□□ -1.37
SH3BP4-206ENST00000446904 FGF6P10767 208 aa6.52□□□□□ -1.37
SH3BP4-206ENST00000446904 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SH3BP4-206ENST00000446904 RPS10P46783 165 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SH3BP4-206ENST00000446904 Q6ZRU5 148 aa6.52□□□□□ -1.37
SH3BP4-206ENST00000446904 PLAC8Q9NZF1 115 aa6.52□□□□□ -1.37
SH3BP4-206ENST00000446904 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa6.51□□□□□ -1.37
SH3BP4-206ENST00000446904 SDHAF1A6NFY7 115 aa6.51□□□□□ -1.37
SH3BP4-206ENST00000446904 GATCO43716 136 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SH3BP4-206ENST00000446904 NCR2O95944 276 aa6.51□□□□□ -1.37
SH3BP4-206ENST00000446904 MAJINQ3KP22 176 aa6.51□□□□□ -1.37
SH3BP4-206ENST00000446904 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa6.51□□□□□ -1.37
SH3BP4-206ENST00000446904 LRP2P98164 4655 aa6.51□□□□□ -1.37
SH3BP4-206ENST00000446904 A0A1B0GVG6 124 aa6.5□□□□□ -1.37
SH3BP4-206ENST00000446904 H7C423 109 aa6.5□□□□□ -1.37
SH3BP4-206ENST00000446904 PHOX2AO14813 284 aa6.5□□□□□ -1.37
SH3BP4-206ENST00000446904 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SH3BP4-206ENST00000446904 PMCHP20382 165 aa6.5□□□□□ -1.37
SH3BP4-206ENST00000446904 XCL1P47992 114 aa6.5□□□□□ -1.37
SH3BP4-206ENST00000446904 CEBPGP53567 150 aa6.5□□□□□ -1.37
SH3BP4-206ENST00000446904 TEX261Q6UWH6 196 aa6.5□□□□□ -1.37
SH3BP4-206ENST00000446904 C7orf33Q8WU49 177 aa6.5□□□□□ -1.37
SH3BP4-206ENST00000446904 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SH3BP4-206ENST00000446904 FAM231BA6NCW3 169 aa6.49□□□□□ -1.37
SH3BP4-206ENST00000446904 A8MWL6 223 aa6.49□□□□□ -1.37
SH3BP4-206ENST00000446904 TMEM250H0YL14 139 aa6.49□□□□□ -1.37
SH3BP4-206ENST00000446904 I3L3M4 83 aa6.49□□□□□ -1.37
SH3BP4-206ENST00000446904 GAS8-AS1O95177 125 aa6.49□□□□□ -1.37
SH3BP4-206ENST00000446904 BLOC1S1P78537 153 aa6.49□□□□□ -1.37
SH3BP4-206ENST00000446904 FOXI1Q12951 378 aa6.49□□□□□ -1.37
SH3BP4-206ENST00000446904 LYPD6BQ8NI32 183 aa6.49□□□□□ -1.37
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