RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446182.5

PTPRN-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRN, Length 606 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-208ENST00000446182 BIN3Q9NQY0 253 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRN-208ENST00000446182 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRN-208ENST00000446182 LTAP01374 205 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRN-208ENST00000446182 RAB5AP20339 215 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRN-208ENST00000446182 PKIAP61925 76 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRN-208ENST00000446182 UBE2G1P62253 170 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRN-208ENST00000446182 ZNF56Q15929 161 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRN-208ENST00000446182 C11orf52Q96A22 123 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRN-208ENST00000446182 CHCHD5Q9BSY4 110 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRN-208ENST00000446182 PRR34Q9NV39 138 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRN-208ENST00000446182 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRN-208ENST00000446182 PAGE4O60829 102 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRN-208ENST00000446182 S100A9P06702 114 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRN-208ENST00000446182 S100A6P06703 90 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRN-208ENST00000446182 CLPSL2Q6UWE3 100 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRN-208ENST00000446182 SDIM1Q6ZPB5 146 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRN-208ENST00000446182 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRN-208ENST00000446182 OR10AG1Q8NH19 301 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRN-208ENST00000446182 SMIM12Q96EX1 92 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRN-208ENST00000446182 CXCL1P09341 107 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRN-208ENST00000446182 AKR1C3P42330 323 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRN-208ENST00000446182 CEBPGP53567 150 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRN-208ENST00000446182 RBX1P62877 108 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRN-208ENST00000446182 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRN-208ENST00000446182 CST9LP1Q5W188 147 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRN-208ENST00000446182 Q6ZRU5 148 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRN-208ENST00000446182 YPEL4Q96NS1 127 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRN-208ENST00000446182 LRP2P98164 4655 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRN-208ENST00000446182 SNAI2O43623 268 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRN-208ENST00000446182 COX19Q49B96 90 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRN-208ENST00000446182 TMEM97Q5BJF2 176 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRN-208ENST00000446182 LINC00269Q8N2A0 174 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRN-208ENST00000446182 S100A8P05109 93 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRN-208ENST00000446182 CNBPP62633 177 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRN-208ENST00000446182 GAGE6Q13070 117 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRN-208ENST00000446182 DERL1Q9BUN8 251 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRN-208ENST00000446182 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRN-208ENST00000446182 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRN-208ENST00000446182 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRN-208ENST00000446182 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRN-208ENST00000446182 MUC21A0A140T8X8 626 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRN-208ENST00000446182 F5H697 171 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRN-208ENST00000446182 OR5AL1P0C617 328 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRN-208ENST00000446182 RPL23P62829 140 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRN-208ENST00000446182 ADIRFQ15847 76 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRN-208ENST00000446182 IQCJQ1A5X6 159 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRN-208ENST00000446182 SPANXN1Q5VSR9 72 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRN-208ENST00000446182 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRN-208ENST00000446182 REG3AQ06141 175 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRN-208ENST00000446182 LINC01551Q86U37 167 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRN-208ENST00000446182 C20orf203Q8NBC4 194 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRN-208ENST00000446182 MLST8Q9BVC4 326 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRN-208ENST00000446182 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRN-208ENST00000446182 A0A087WYN8 130 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRN-208ENST00000446182 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRN-208ENST00000446182 SCO2A0A1W2PP80 73 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRN-208ENST00000446182 hDV102S1A0JD36 115 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRN-208ENST00000446182 SLPIP03973 132 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRN-208ENST00000446182 CHTF8P0CG12 524 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRN-208ENST00000446182 RPS10P46783 165 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRN-208ENST00000446182 GNG4P50150 75 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRN-208ENST00000446182 SSTP61278 116 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRN-208ENST00000446182 SPACA4Q8TDM5 124 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRN-208ENST00000446182 ISOC2Q96AB3 205 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRN-208ENST00000446182 RNF185Q96GF1 192 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRN-208ENST00000446182 AP1S3Q96PC3 154 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRN-208ENST00000446182 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRN-208ENST00000446182 M0QY20 66 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRN-208ENST00000446182 P01737 135 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRN-208ENST00000446182 SMIM17P0DL12 118 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRN-208ENST00000446182 BAGE2Q86Y30 109 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRN-208ENST00000446182 GFRA4Q9GZZ7 299 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRN-208ENST00000446182 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRN-208ENST00000446182 C5orf52A6NGY3 159 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRN-208ENST00000446182 RPL35P42766 123 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRN-208ENST00000446182 RASL11AQ6T310 242 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRN-208ENST00000446182 DPH3Q96FX2 82 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRN-208ENST00000446182 OSTCQ9NRP0 149 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRN-208ENST00000446182 AP5S1Q9NUS5 200 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRN-208ENST00000446182 PLAC8Q9NZF1 115 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRN-208ENST00000446182 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRN-208ENST00000446182 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRN-208ENST00000446182 A0A1B0GUV1 79 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRN-208ENST00000446182 PHOX2AO14813 284 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRN-208ENST00000446182 MT-ND6P03923 174 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRN-208ENST00000446182 MGPP08493 103 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRN-208ENST00000446182 SUMO4Q6EEV6 95 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRN-208ENST00000446182 FAM231DQ6ZW35 169 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRN-208ENST00000446182 TMEM243Q9BU79 118 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRN-208ENST00000446182 H7C1H1 209 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRN-208ENST00000446182 SMIM6P0DI80 62 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRN-208ENST00000446182 GZMBP10144 247 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRN-208ENST00000446182 WDR73Q6P4I2 378 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRN-208ENST00000446182 FAM231BA6NCW3 169 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRN-208ENST00000446182 IGLC6P0CF74 106 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRN-208ENST00000446182 CENPWQ5EE01 88 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRN-208ENST00000446182 CT83Q5H943 113 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRN-208ENST00000446182 C15orf56Q8N910 161 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRN-208ENST00000446182 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRN-208ENST00000446182 C7orf33Q8WU49 177 aa6.6□□□□□ -1.35
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