RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425989.5

HDLBP-211, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-211ENST00000425989 C20orf203Q8NBC4 194 aa6.79□□□□□ -1.32
HDLBP-211ENST00000425989 SCGB3A1Q96QR1 104 aa6.79□□□□□ -1.32
HDLBP-211ENST00000425989 TIMM17AQ99595 171 aa6.79□□□□□ -1.32
HDLBP-211ENST00000425989 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa6.79□□□□□ -1.32
HDLBP-211ENST00000425989 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa6.78□□□□□ -1.32
HDLBP-211ENST00000425989 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa6.78□□□□□ -1.32
HDLBP-211ENST00000425989 PRSS1P07477 247 aa6.78□□□□□ -1.32
HDLBP-211ENST00000425989 PYY3Q5JQD4 70 aa6.78□□□□□ -1.32
HDLBP-211ENST00000425989 LGALS9CQ6DKI2 356 aa6.78□□□□□ -1.32
HDLBP-211ENST00000425989 Q6ZN92 141 aa6.78□□□□□ -1.32
HDLBP-211ENST00000425989 B9D2Q9BPU9 175 aa6.78□□□□□ -1.32
HDLBP-211ENST00000425989 TIMM21Q9BVV7 248 aa6.78□□□□□ -1.32
HDLBP-211ENST00000425989 P0DMU3 169 aa6.77□□□□□ -1.33
HDLBP-211ENST00000425989 FAM231AP0DMU4 169 aa6.77□□□□□ -1.33
HDLBP-211ENST00000425989 FAM231CP0DMU5 169 aa6.77□□□□□ -1.33
HDLBP-211ENST00000425989 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
HDLBP-211ENST00000425989 C12orf74Q32Q52 190 aa6.77□□□□□ -1.33
HDLBP-211ENST00000425989 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa6.77□□□□□ -1.33
HDLBP-211ENST00000425989 C11orf45Q8TAV5 145 aa6.77□□□□□ -1.33
HDLBP-211ENST00000425989 C12orf57Q99622 126 aa6.77□□□□□ -1.33
HDLBP-211ENST00000425989 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
HDLBP-211ENST00000425989 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa6.77□□□□□ -1.33
HDLBP-211ENST00000425989 ANK2Q01484 3957 aa6.76□□□□□ -1.33
HDLBP-211ENST00000425989 GAGE12JA6NER3 117 aa6.76□□□□□ -1.33
HDLBP-211ENST00000425989 IGIPA6NJ69 53 aa6.76□□□□□ -1.33
HDLBP-211ENST00000425989 F5H768 121 aa6.76□□□□□ -1.33
HDLBP-211ENST00000425989 DEFB4AO15263 64 aa6.76□□□□□ -1.33
HDLBP-211ENST00000425989 GYPEP15421 78 aa6.76□□□□□ -1.33
HDLBP-211ENST00000425989 PKIAP61925 76 aa6.76□□□□□ -1.33
HDLBP-211ENST00000425989 GAGE1Q13065 139 aa6.76□□□□□ -1.33
HDLBP-211ENST00000425989 GAGE4Q13068 117 aa6.76□□□□□ -1.33
HDLBP-211ENST00000425989 GAGE5Q13069 117 aa6.76□□□□□ -1.33
HDLBP-211ENST00000425989 GAGE13Q4V321 117 aa6.76□□□□□ -1.33
HDLBP-211ENST00000425989 LINC01545Q5VT33 79 aa6.76□□□□□ -1.33
HDLBP-211ENST00000425989 MRAPQ8TCY5 172 aa6.76□□□□□ -1.33
HDLBP-211ENST00000425989 SPANXA1Q9NS26 97 aa6.76□□□□□ -1.33
HDLBP-211ENST00000425989 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa6.75□□□□□ -1.33
HDLBP-211ENST00000425989 LINC00694P0DN24 101 aa6.75□□□□□ -1.33
HDLBP-211ENST00000425989 A0A087WX48 190 aa6.74□□□□□ -1.33
HDLBP-211ENST00000425989 A0A0J9YWU9 116 aa6.74□□□□□ -1.33
HDLBP-211ENST00000425989 HSBP1L1C9JCN9 74 aa6.74□□□□□ -1.33
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
HDLBP-211ENST00000425989 TIRAPP58753 221 aa6.74□□□□□ -1.33
HDLBP-211ENST00000425989 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
HDLBP-211ENST00000425989 PMVKQ15126 192 aa6.74□□□□□ -1.33
HDLBP-211ENST00000425989 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa6.74□□□□□ -1.33
HDLBP-211ENST00000425989 NEGR1Q7Z3B1 354 aa6.74□□□□□ -1.33
HDLBP-211ENST00000425989 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
HDLBP-211ENST00000425989 TMEM243Q9BU79 118 aa6.74□□□□□ -1.33
HDLBP-211ENST00000425989 CHCHD7Q9BUK0 85 aa6.74□□□□□ -1.33
HDLBP-211ENST00000425989 VCX2Q9H322 139 aa6.74□□□□□ -1.33
HDLBP-211ENST00000425989 Q9UF83 564 aa6.74□□□□□ -1.33
HDLBP-211ENST00000425989 CELA1Q9UNI1 258 aa6.74□□□□□ -1.33
HDLBP-211ENST00000425989 ICOSQ9Y6W8 199 aa6.74□□□□□ -1.33
HDLBP-211ENST00000425989 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa6.74□□□□□ -1.33
HDLBP-211ENST00000425989 DNAH3Q8TD57 4116 aa6.74□□□□□ -1.33
HDLBP-211ENST00000425989 MGAM2Q2M2H8 2515 aa6.73□□□□□ -1.33
HDLBP-211ENST00000425989 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa6.73□□□□□ -1.33
HDLBP-211ENST00000425989 UBE2L6O14933 153 aa6.73□□□□□ -1.33
HDLBP-211ENST00000425989 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
HDLBP-211ENST00000425989 PLNP26678 52 aa6.73□□□□□ -1.33
HDLBP-211ENST00000425989 TEX43Q6ZNM6 134 aa6.73□□□□□ -1.33
HDLBP-211ENST00000425989 LINC00173Q6ZV60 143 aa6.73□□□□□ -1.33
HDLBP-211ENST00000425989 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
HDLBP-211ENST00000425989 TMEM101Q96IK0 257 aa6.73□□□□□ -1.33
HDLBP-211ENST00000425989 VSIG2Q96IQ7 327 aa6.73□□□□□ -1.33
HDLBP-211ENST00000425989 RETNQ9HD89 108 aa6.73□□□□□ -1.33
HDLBP-211ENST00000425989 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa6.72□□□□□ -1.33
HDLBP-211ENST00000425989 TRAV10A0A0B4J240 114 aa6.72□□□□□ -1.33
HDLBP-211ENST00000425989 SEC11AP67812 179 aa6.72□□□□□ -1.33
HDLBP-211ENST00000425989 Q8N976 141 aa6.72□□□□□ -1.33
HDLBP-211ENST00000425989 NOTCH1P46531 2555 aa6.72□□□□□ -1.33
HDLBP-211ENST00000425989 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa6.71□□□□□ -1.34
HDLBP-211ENST00000425989 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa6.71□□□□□ -1.34
HDLBP-211ENST00000425989 A0A1B0GUV1 79 aa6.71□□□□□ -1.34
HDLBP-211ENST00000425989 PRSS29PA6NIE9 313 aa6.71□□□□□ -1.34
HDLBP-211ENST00000425989 F8VRH5 84 aa6.71□□□□□ -1.34
HDLBP-211ENST00000425989 CCL25O15444 150 aa6.71□□□□□ -1.34
HDLBP-211ENST00000425989 DPM2O94777 84 aa6.71□□□□□ -1.34
HDLBP-211ENST00000425989 RPL39P62891 51 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
HDLBP-211ENST00000425989 ODF1Q14990 250 aa6.71□□□□□ -1.34
HDLBP-211ENST00000425989 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa6.71□□□□□ -1.34
HDLBP-211ENST00000425989 C15orf53Q8NAA6 179 aa6.71□□□□□ -1.34
HDLBP-211ENST00000425989 BAALCQ8WXS3 180 aa6.71□□□□□ -1.34
HDLBP-211ENST00000425989 AMELXQ99217 191 aa6.71□□□□□ -1.34
HDLBP-211ENST00000425989 VAMP8Q9BV40 100 aa6.71□□□□□ -1.34
HDLBP-211ENST00000425989 CST9LQ9H4G1 147 aa6.71□□□□□ -1.34
HDLBP-211ENST00000425989 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa6.71□□□□□ -1.34
HDLBP-211ENST00000425989 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
HDLBP-211ENST00000425989 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-211ENST00000425989 IGKCP01834 107 aa6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-211ENST00000425989 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-211ENST00000425989 C2orf88Q9BSF0 95 aa6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-211ENST00000425989 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-211ENST00000425989 A0A0J9YY99 117 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-211ENST00000425989 TSTD3H0UI37 97 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-211ENST00000425989 H0Y8G0 127 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-211ENST00000425989 FGF6P10767 208 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-211ENST00000425989 HTN3P15516 51 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-211ENST00000425989 LELP1Q5T871 98 aa6.69□□□□□ -1.34
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