RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 ODF3Q96PU9 254 aa13.53□□□□□ -0.24
RALGPS1-208ENST00000424082 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa13.53□□□□□ -0.24
RALGPS1-208ENST00000424082 TRIAP1O43715 76 aa13.53□□□□□ -0.24
RALGPS1-208ENST00000424082 C9orf85Q96MD7 179 aa13.53□□□□□ -0.24
RALGPS1-208ENST00000424082 C20orf203Q8NBC4 194 aa13.52□□□□□ -0.24
RALGPS1-208ENST00000424082 IFITM1P13164 125 aa13.52□□□□□ -0.25
RALGPS1-208ENST00000424082 TTC32Q5I0X7 151 aa13.52□□□□□ -0.25
RALGPS1-208ENST00000424082 Q6Q795 121 aa13.52□□□□□ -0.25
RALGPS1-208ENST00000424082 AVPP01185 164 aa13.51□□□□□ -0.25
RALGPS1-208ENST00000424082 MSMBP08118 114 aa13.51□□□□□ -0.25
RALGPS1-208ENST00000424082 KRTAP10-9P60411 292 aa13.51□□□□□ -0.25
RALGPS1-208ENST00000424082 CHD6Q8TD26 2715 aa13.51□□□□□ -0.25
RALGPS1-208ENST00000424082 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa13.51□□□□□ -0.25
RALGPS1-208ENST00000424082 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa13.51□□□□□ -0.25
RALGPS1-208ENST00000424082 H3BMM0 161 aa13.5□□□□□ -0.25
RALGPS1-208ENST00000424082 CFHR3Q02985 330 aa13.5□□□□□ -0.25
RALGPS1-208ENST00000424082 UBE2WQ96B02 151 aa13.5□□□□□ -0.25
RALGPS1-208ENST00000424082 GAGE12JA6NER3 117 aa13.5□□□□□ -0.25
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC179H3BU77 68 aa13.5□□□□□ -0.25
RALGPS1-208ENST00000424082 K7EMT4 169 aa13.5□□□□□ -0.25
RALGPS1-208ENST00000424082 GAGE7O76087 117 aa13.5□□□□□ -0.25
RALGPS1-208ENST00000424082 GAGE12FP0CL80 117 aa13.5□□□□□ -0.25
RALGPS1-208ENST00000424082 GAGE12GP0CL81 117 aa13.5□□□□□ -0.25
RALGPS1-208ENST00000424082 GAGE12IP0CL82 117 aa13.5□□□□□ -0.25
RALGPS1-208ENST00000424082 GAGE4Q13068 117 aa13.5□□□□□ -0.25
RALGPS1-208ENST00000424082 SPINK13Q1W4C9 94 aa13.5□□□□□ -0.25
RALGPS1-208ENST00000424082 C10orf99Q6UWK7 81 aa13.5□□□□□ -0.25
RALGPS1-208ENST00000424082 C15orf53Q8NAA6 179 aa13.5□□□□□ -0.25
RALGPS1-208ENST00000424082 LITAFQ99732 161 aa13.5□□□□□ -0.25
RALGPS1-208ENST00000424082 CREBBPQ92793 2442 aa13.49□□□□□ -0.25
RALGPS1-208ENST00000424082 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa13.49□□□□□ -0.25
RALGPS1-208ENST00000424082 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa13.49□□□□□ -0.25
RALGPS1-208ENST00000424082 I3L3M4 83 aa13.49□□□□□ -0.25
RALGPS1-208ENST00000424082 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa13.49□□□□□ -0.25
RALGPS1-208ENST00000424082 NAV2Q8IVL1 2488 aa13.48□□□□□ -0.25
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
RALGPS1-208ENST00000424082 C2orf82Q6UX34 121 aa13.47□□□□□ -0.25
RALGPS1-208ENST00000424082 SPXQ9BT56 116 aa13.47□□□□□ -0.25
RALGPS1-208ENST00000424082 ICOSQ9Y6W8 199 aa13.47□□□□□ -0.25
RALGPS1-208ENST00000424082 H7C423 109 aa13.47□□□□□ -0.25
RALGPS1-208ENST00000424082 TIMM21Q9BVV7 248 aa13.47□□□□□ -0.25
RALGPS1-208ENST00000424082 TENM4Q6N022 2769 aa13.47□□□□□ -0.25
RALGPS1-208ENST00000424082 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa13.46□□□□□ -0.25
RALGPS1-208ENST00000424082 PRSS2P07478 247 aa13.46□□□□□ -0.25
RALGPS1-208ENST00000424082 B4DSR2 109 aa13.45□□□□□ -0.26
RALGPS1-208ENST00000424082 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
RALGPS1-208ENST00000424082 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa13.45□□□□□ -0.26
RALGPS1-208ENST00000424082 PSMB8P28062 276 aa13.45□□□□□ -0.26
RALGPS1-208ENST00000424082 APCP25054 2843 aa13.44□□□□□ -0.26
RALGPS1-208ENST00000424082 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
RALGPS1-208ENST00000424082 A0A096LNT2 108 aa13.44□□□□□ -0.26
RALGPS1-208ENST00000424082 SPANXDQ9BXN6 97 aa13.44□□□□□ -0.26
RALGPS1-208ENST00000424082 SPANXCQ9NY87 97 aa13.44□□□□□ -0.26
RALGPS1-208ENST00000424082 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa13.44□□□□□ -0.26
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM104AQ969W3 186 aa13.44□□□□□ -0.26
RALGPS1-208ENST00000424082 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
RALGPS1-208ENST00000424082 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa13.43□□□□□ -0.26
RALGPS1-208ENST00000424082 H3BT86 120 aa13.43□□□□□ -0.26
RALGPS1-208ENST00000424082 K7EQG2 157 aa13.43□□□□□ -0.26
RALGPS1-208ENST00000424082 CD28P10747 220 aa13.43□□□□□ -0.26
RALGPS1-208ENST00000424082 HTN1P15515 57 aa13.42□□□□□ -0.26
RALGPS1-208ENST00000424082 DSCR9P59020 149 aa13.42□□□□□ -0.26
RALGPS1-208ENST00000424082 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa13.42□□□□□ -0.26
RALGPS1-208ENST00000424082 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
RALGPS1-208ENST00000424082 Q6ZSV7 163 aa13.42□□□□□ -0.26
RALGPS1-208ENST00000424082 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa13.41□□□□□ -0.26
RALGPS1-208ENST00000424082 COX6CP09669 75 aa13.41□□□□□ -0.26
RALGPS1-208ENST00000424082 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
RALGPS1-208ENST00000424082 MIAQ16674 131 aa13.41□□□□□ -0.26
RALGPS1-208ENST00000424082 CLEC2BQ92478 149 aa13.41□□□□□ -0.26
RALGPS1-208ENST00000424082 DUX5Q96PT3 197 aa13.41□□□□□ -0.26
RALGPS1-208ENST00000424082 NDUFA12Q9UI09 145 aa13.41□□□□□ -0.26
RALGPS1-208ENST00000424082 IGHV4-59P01825 116 aa13.4□□□□□ -0.26
RALGPS1-208ENST00000424082 SYNJ2BPP57105 145 aa13.4□□□□□ -0.26
RALGPS1-208ENST00000424082 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
RALGPS1-208ENST00000424082 MXRA5Q9NR99 2828 aa13.4□□□□□ -0.26
RALGPS1-208ENST00000424082 PROK1P58294 105 aa13.4□□□□□ -0.26
RALGPS1-208ENST00000424082 NPC2P61916 151 aa13.39□□□□□ -0.27
RALGPS1-208ENST00000424082 TEX15Q9BXT5 2789 aa13.39□□□□□ -0.27
RALGPS1-208ENST00000424082 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
RALGPS1-208ENST00000424082 RBMY1CP0DJD4 496 aa13.39□□□□□ -0.27
RALGPS1-208ENST00000424082 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
RALGPS1-208ENST00000424082 DEFB121Q5J5C9 76 aa13.39□□□□□ -0.27
RALGPS1-208ENST00000424082 LINC01356Q8N9X3 169 aa13.39□□□□□ -0.27
RALGPS1-208ENST00000424082 LST1O00453 97 aa13.38□□□□□ -0.27
RALGPS1-208ENST00000424082 DUX3Q96PT4 197 aa13.38□□□□□ -0.27
RALGPS1-208ENST00000424082 VSIG2Q96IQ7 327 aa13.38□□□□□ -0.27
RALGPS1-208ENST00000424082 Q9UF83 564 aa13.38□□□□□ -0.27
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa13.37□□□□□ -0.27
RALGPS1-208ENST00000424082 A8MZ25 164 aa13.37□□□□□ -0.27
RALGPS1-208ENST00000424082 PRM2P04554 102 aa13.37□□□□□ -0.27
RALGPS1-208ENST00000424082 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa13.37□□□□□ -0.27
RALGPS1-208ENST00000424082 TMEM61Q8N0U2 210 aa13.37□□□□□ -0.27
RALGPS1-208ENST00000424082 CR1P17927 2039 aa13.35□□□□□ -0.27
RALGPS1-208ENST00000424082 TRGV11A0A075B6L2 103 aa13.35□□□□□ -0.27
RALGPS1-208ENST00000424082 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa13.35□□□□□ -0.27
RALGPS1-208ENST00000424082 KNCNA6PVL3 124 aa13.35□□□□□ -0.27
RALGPS1-208ENST00000424082 DEFB112Q30KQ8 113 aa13.35□□□□□ -0.27
RALGPS1-208ENST00000424082 YAE1D1Q9NRH1 226 aa13.35□□□□□ -0.27
RALGPS1-208ENST00000424082 TLN2Q9Y4G6 2542 aa13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms