RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398741.5

PRAME-201, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene PRAME, Length 2,202 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-201ENST00000398741 PEMTQ9UBM1 199 aa9.59□□□□□ -0.87
PRAME-201ENST00000398741 FSHBP01225 129 aa9.59□□□□□ -0.87
PRAME-201ENST00000398741 Q5PR19 223 aa9.59□□□□□ -0.87
PRAME-201ENST00000398741 TIMM21Q9BVV7 248 aa9.59□□□□□ -0.87
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PRAME-201ENST00000398741 IGHV4-31P0DP07 118 aa9.58□□□□□ -0.88
PRAME-201ENST00000398741 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa9.58□□□□□ -0.88
PRAME-201ENST00000398741 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa9.58□□□□□ -0.88
PRAME-201ENST00000398741 MUSTN1Q8IVN3 82 aa9.58□□□□□ -0.88
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PRAME-201ENST00000398741 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
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PRAME-201ENST00000398741 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
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PRAME-201ENST00000398741 LITAFQ99732 161 aa9.51□□□□□ -0.89
PRAME-201ENST00000398741 CDIP1Q9H305 208 aa9.51□□□□□ -0.89
PRAME-201ENST00000398741 RS1O15537 224 aa9.5□□□□□ -0.89
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PRAME-201ENST00000398741 SPANXDQ9BXN6 97 aa9.5□□□□□ -0.89
PRAME-201ENST00000398741 SPANXCQ9NY87 97 aa9.5□□□□□ -0.89
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PRAME-201ENST00000398741 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa9.48□□□□□ -0.89
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PRAME-201ENST00000398741 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
PRAME-201ENST00000398741 M0QXV9 152 aa9.47□□□□□ -0.89
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PRAME-201ENST00000398741 YAE1D1Q9NRH1 226 aa9.47□□□□□ -0.89
PRAME-201ENST00000398741 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa9.47□□□□□ -0.89
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