RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362899.2

SNORD3E-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 3E, humanhuman

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Gene SNORD3E, Length 217 nt, Biotype snoRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD3E-201ENST00000362899 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP0.18□□□□□ -2.38
SNORD3E-201ENST00000362899 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP0.18□□□□□ -2.38
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SNORD3E-201ENST00000362899 LOC400499M0QZD8 3231 aa0.17□□□□□ -2.38
SNORD3E-201ENST00000362899 NPFFO15130 113 aa0.17□□□□□ -2.38
SNORD3E-201ENST00000362899 SOGA1O94964 1423 aa0.17□□□□□ -2.38
SNORD3E-201ENST00000362899 COX6A2Q02221 97 aa0.17□□□□□ -2.38
SNORD3E-201ENST00000362899 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP0.17□□□□□ -2.38
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SNORD3E-201ENST00000362899 DNAH12Q6ZR08 3092 aa0.16□□□□□ -2.38
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SNORD3E-201ENST00000362899 SLC48A1Q6P1K1 146 aa0.16□□□□□ -2.38
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SNORD3E-201ENST00000362899 CUBNO60494 3623 aa0.13□□□□□ -2.39
SNORD3E-201ENST00000362899 CHD9Q3L8U1 2897 aa0.13□□□□□ -2.39
SNORD3E-201ENST00000362899 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa0.13□□□□□ -2.39
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SNORD3E-201ENST00000362899 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa0.13□□□□□ -2.39
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SNORD3E-201ENST00000362899 V9GYV3 84 aa0.13□□□□□ -2.39
SNORD3E-201ENST00000362899 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa0.13□□□□□ -2.39
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SNORD3E-201ENST00000362899 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP0.13□□□□□ -2.39
SNORD3E-201ENST00000362899 F8P00451 2351 aa0.12□□□□□ -2.39
SNORD3E-201ENST00000362899 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa0.12□□□□□ -2.39
SNORD3E-201ENST00000362899 CSMD2Q7Z408 3487 aa0.12□□□□□ -2.39
SNORD3E-201ENST00000362899 GRIN2AQ12879 1464 aa0.12□□□□□ -2.39
SNORD3E-201ENST00000362899 CDH23Q9H251 3354 aa0.12□□□□□ -2.39
SNORD3E-201ENST00000362899 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP0.12□□□□□ -2.39
SNORD3E-201ENST00000362899 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa0.12□□□□□ -2.39
SNORD3E-201ENST00000362899 A6NIN4 97 aa0.12□□□□□ -2.39
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