RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 PMVKQ15126 192 aa12.76□□□□□ -0.37
ACTB-201ENST00000331789 C2orf91Q6ZV80 131 aa12.76□□□□□ -0.37
ACTB-201ENST00000331789 ZNRF2Q8NHG8 242 aa12.76□□□□□ -0.37
ACTB-201ENST00000331789 CST9LQ9H4G1 147 aa12.76□□□□□ -0.37
ACTB-201ENST00000331789 CHCHD7Q9BUK0 85 aa12.75□□□□□ -0.37
ACTB-201ENST00000331789 TTTY13Q9BZ97 58 aa12.75□□□□□ -0.37
ACTB-201ENST00000331789 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
ACTB-201ENST00000331789 X6R8D5 127 aa12.75□□□□□ -0.37
ACTB-201ENST00000331789 K7EQD1 137 aa12.74□□□□□ -0.37
ACTB-201ENST00000331789 SLC25A29Q8N8R3 303 aa12.74□□□□□ -0.37
ACTB-201ENST00000331789 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa12.74□□□□□ -0.37
ACTB-201ENST00000331789 WIPF1O43516 503 aa12.74□□□□□ -0.37
ACTB-201ENST00000331789 MPV17L2Q567V2 206 aa12.73□□□□□ -0.37
ACTB-201ENST00000331789 PRIMA1Q86XR5 153 aa12.73□□□□□ -0.37
ACTB-201ENST00000331789 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa12.72□□□□□ -0.37
ACTB-201ENST00000331789 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
ACTB-201ENST00000331789 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa12.72□□□□□ -0.37
ACTB-201ENST00000331789 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa12.72□□□□□ -0.37
ACTB-201ENST00000331789 DLEU1O43261 78 aa12.72□□□□□ -0.37
ACTB-201ENST00000331789 COTL1Q14019 142 aa12.72□□□□□ -0.37
ACTB-201ENST00000331789 C3orf56Q8N813 242 aa12.72□□□□□ -0.37
ACTB-201ENST00000331789 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
ACTB-201ENST00000331789 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa12.71□□□□□ -0.37
ACTB-201ENST00000331789 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
ACTB-201ENST00000331789 GAGE12JA6NER3 117 aa12.71□□□□□ -0.37
ACTB-201ENST00000331789 C11orf86A6NJI1 115 aa12.71□□□□□ -0.37
ACTB-201ENST00000331789 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
ACTB-201ENST00000331789 GAGE1Q13065 139 aa12.71□□□□□ -0.37
ACTB-201ENST00000331789 GAGE4Q13068 117 aa12.71□□□□□ -0.37
ACTB-201ENST00000331789 GAGE5Q13069 117 aa12.71□□□□□ -0.37
ACTB-201ENST00000331789 DEFB135Q30KP9 77 aa12.71□□□□□ -0.37
ACTB-201ENST00000331789 GAGE13Q4V321 117 aa12.71□□□□□ -0.37
ACTB-201ENST00000331789 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
ACTB-201ENST00000331789 FAM104AQ969W3 186 aa12.71□□□□□ -0.37
ACTB-201ENST00000331789 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa12.7□□□□□ -0.38
ACTB-201ENST00000331789 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa12.7□□□□□ -0.38
ACTB-201ENST00000331789 SMIM9A6NGZ8 99 aa12.7□□□□□ -0.38
ACTB-201ENST00000331789 DEFB130BP0DP73 79 aa12.7□□□□□ -0.38
ACTB-201ENST00000331789 DEFB130AP0DP74 79 aa12.7□□□□□ -0.38
ACTB-201ENST00000331789 APOC4P55056 127 aa12.7□□□□□ -0.38
ACTB-201ENST00000331789 OXLD1Q5BKU9 147 aa12.7□□□□□ -0.38
ACTB-201ENST00000331789 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa12.7□□□□□ -0.38
ACTB-201ENST00000331789 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa12.7□□□□□ -0.38
ACTB-201ENST00000331789 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa12.69□□□□□ -0.38
ACTB-201ENST00000331789 FHL2Q14192 279 aa12.69□□□□□ -0.38
ACTB-201ENST00000331789 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa12.69□□□□□ -0.38
ACTB-201ENST00000331789 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa12.68□□□□□ -0.38
ACTB-201ENST00000331789 UBE2D3P61077 147 aa12.68□□□□□ -0.38
ACTB-201ENST00000331789 UBE2D2P62837 147 aa12.68□□□□□ -0.38
ACTB-201ENST00000331789 VCX2Q9H322 139 aa12.68□□□□□ -0.38
ACTB-201ENST00000331789 SIVA1O15304 175 aa12.68□□□□□ -0.38
ACTB-201ENST00000331789 CIDEAO60543 219 aa12.68□□□□□ -0.38
ACTB-201ENST00000331789 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa12.68□□□□□ -0.38
ACTB-201ENST00000331789 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa12.68□□□□□ -0.38
ACTB-201ENST00000331789 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa12.67□□□□□ -0.38
ACTB-201ENST00000331789 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa12.67□□□□□ -0.38
ACTB-201ENST00000331789 LINC00612Q8N6U2 182 aa12.67□□□□□ -0.38
ACTB-201ENST00000331789 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
ACTB-201ENST00000331789 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa12.66□□□□□ -0.38
ACTB-201ENST00000331789 TMEM97Q5BJF2 176 aa12.66□□□□□ -0.38
ACTB-201ENST00000331789 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
ACTB-201ENST00000331789 SHISA2Q6UWI4 295 aa12.66□□□□□ -0.38
ACTB-201ENST00000331789 C12orf54Q6X4T0 127 aa12.66□□□□□ -0.38
ACTB-201ENST00000331789 DEFB4AO15263 64 aa12.66□□□□□ -0.38
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP10-11P60412 298 aa12.66□□□□□ -0.38
ACTB-201ENST00000331789 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa12.66□□□□□ -0.38
ACTB-201ENST00000331789 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
ACTB-201ENST00000331789 OR11H2Q8NH07 326 aa12.66□□□□□ -0.38
ACTB-201ENST00000331789 AMELXQ99217 191 aa12.66□□□□□ -0.38
ACTB-201ENST00000331789 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
ACTB-201ENST00000331789 SPANXA1Q9NS26 97 aa12.65□□□□□ -0.38
ACTB-201ENST00000331789 A0A0J9YXV3 536 aa12.64□□□□□ -0.39
ACTB-201ENST00000331789 E9PLD3 99 aa12.64□□□□□ -0.39
ACTB-201ENST00000331789 TMEM170BQ5T4T1 132 aa12.64□□□□□ -0.39
ACTB-201ENST00000331789 PRADC1Q9BSG0 188 aa12.64□□□□□ -0.39
ACTB-201ENST00000331789 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa12.64□□□□□ -0.39
ACTB-201ENST00000331789 FAM222AQ5U5X8 452 aa12.64□□□□□ -0.39
ACTB-201ENST00000331789 NFE4Q86UQ8 179 aa12.64□□□□□ -0.39
ACTB-201ENST00000331789 CHAC1Q9BUX1 264 aa12.64□□□□□ -0.39
ACTB-201ENST00000331789 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa12.63□□□□□ -0.39
ACTB-201ENST00000331789 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa12.62□□□□□ -0.39
ACTB-201ENST00000331789 Q6ZUT4 128 aa12.62□□□□□ -0.39
ACTB-201ENST00000331789 STAB1Q9NY15 2570 aa12.62□□□□□ -0.39
ACTB-201ENST00000331789 NPSP0C0P6 89 aa12.62□□□□□ -0.39
ACTB-201ENST00000331789 LINC00694P0DN24 101 aa12.62□□□□□ -0.39
ACTB-201ENST00000331789 HIGD1BQ9P298 99 aa12.62□□□□□ -0.39
ACTB-201ENST00000331789 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP12.61□□□□□ -0.39
ACTB-201ENST00000331789 CRYBA4P53673 196 aa12.61□□□□□ -0.39
ACTB-201ENST00000331789 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa12.6□□□□□ -0.39
ACTB-201ENST00000331789 HSD52Q0P140 79 aa12.6□□□□□ -0.39
ACTB-201ENST00000331789 Q6ZVH6 145 aa12.6□□□□□ -0.39
ACTB-201ENST00000331789 SBSPONQ8IVN8 264 aa12.6□□□□□ -0.39
ACTB-201ENST00000331789 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP12.6□□□□□ -0.39
ACTB-201ENST00000331789 HERVK_113P61574 105 aa12.6□□□□□ -0.39
ACTB-201ENST00000331789 RNF183Q96D59 192 aa12.6□□□□□ -0.39
ACTB-201ENST00000331789 LYRM9A8MSI8 78 aa12.59□□□□□ -0.39
ACTB-201ENST00000331789 TIMM21Q9BVV7 248 aa12.59□□□□□ -0.39
ACTB-201ENST00000331789 GTSF1LQ9H1H1 148 aa12.59□□□□□ -0.39
ACTB-201ENST00000331789 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa12.58□□□□□ -0.39
ACTB-201ENST00000331789 Q8NAQ8 132 aa12.58□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 103.9 ms