RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311659.4

UBQLN3-201, Transcript of ubiquilin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBQLN3, Length 2,407 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN3-201ENST00000311659 IGLV1-40P01703 118 aa6.25□□□□□ -1.41
UBQLN3-201ENST00000311659 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa6.25□□□□□ -1.41
UBQLN3-201ENST00000311659 GAGE2BQ13066 116 aa6.25□□□□□ -1.41
UBQLN3-201ENST00000311659 GAGE2EQ4V326 116 aa6.25□□□□□ -1.41
UBQLN3-201ENST00000311659 BRD3OSQ6XYD6 125 aa6.25□□□□□ -1.41
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UBQLN3-201ENST00000311659 GAGE2DQ9UEU5 116 aa6.25□□□□□ -1.41
UBQLN3-201ENST00000311659 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
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UBQLN3-201ENST00000311659 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.23□□□□□ -1.41
UBQLN3-201ENST00000311659 ICOSQ9Y6W8 199 aa6.23□□□□□ -1.41
UBQLN3-201ENST00000311659 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
UBQLN3-201ENST00000311659 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa6.23□□□□□ -1.41
UBQLN3-201ENST00000311659 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa6.23□□□□□ -1.41
UBQLN3-201ENST00000311659 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa6.23□□□□□ -1.41
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UBQLN3-201ENST00000311659 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
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UBQLN3-201ENST00000311659 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa6.22□□□□□ -1.41
UBQLN3-201ENST00000311659 H3BT86 120 aa6.22□□□□□ -1.41
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UBQLN3-201ENST00000311659 DSCR9P59020 149 aa6.22□□□□□ -1.41
UBQLN3-201ENST00000311659 C15orf53Q8NAA6 179 aa6.22□□□□□ -1.41
UBQLN3-201ENST00000311659 CCDC179H3BU77 68 aa6.21□□□□□ -1.41
UBQLN3-201ENST00000311659 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa6.21□□□□□ -1.41
UBQLN3-201ENST00000311659 CD28P10747 220 aa6.21□□□□□ -1.41
UBQLN3-201ENST00000311659 MIAQ16674 131 aa6.21□□□□□ -1.41
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UBQLN3-201ENST00000311659 SPINK13Q1W4C9 94 aa6.21□□□□□ -1.42
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UBQLN3-201ENST00000311659 DEFB113Q30KQ7 82 aa6.2□□□□□ -1.42
UBQLN3-201ENST00000311659 TTC32Q5I0X7 151 aa6.2□□□□□ -1.42
UBQLN3-201ENST00000311659 TMEM61Q8N0U2 210 aa6.2□□□□□ -1.42
UBQLN3-201ENST00000311659 CENPEQ02224 2701 aa6.2□□□□□ -1.42
UBQLN3-201ENST00000311659 VPS13CQ709C8 3753 aa6.2□□□□□ -1.42
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UBQLN3-201ENST00000311659 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
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UBQLN3-201ENST00000311659 TRGV11A0A075B6L2 103 aa6.19□□□□□ -1.42
UBQLN3-201ENST00000311659 A8MZ25 164 aa6.19□□□□□ -1.42
UBQLN3-201ENST00000311659 PSMB8P28062 276 aa6.19□□□□□ -1.42
UBQLN3-201ENST00000311659 PROK1P58294 105 aa6.19□□□□□ -1.42
UBQLN3-201ENST00000311659 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
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UBQLN3-201ENST00000311659 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa6.19□□□□□ -1.42
UBQLN3-201ENST00000311659 SPANXA1Q9NS26 97 aa6.19□□□□□ -1.42
UBQLN3-201ENST00000311659 ABCA12Q86UK0 2595 aa6.19□□□□□ -1.42
UBQLN3-201ENST00000311659 TIMM17BO60830 172 aa6.18□□□□□ -1.42
UBQLN3-201ENST00000311659 COX6CP09669 75 aa6.18□□□□□ -1.42
UBQLN3-201ENST00000311659 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
UBQLN3-201ENST00000311659 CHCHD7Q9BUK0 85 aa6.18□□□□□ -1.42
UBQLN3-201ENST00000311659 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa6.18□□□□□ -1.42
UBQLN3-201ENST00000311659 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa6.18□□□□□ -1.42
UBQLN3-201ENST00000311659 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
UBQLN3-201ENST00000311659 APCP25054 2843 aa6.17□□□□□ -1.42
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