RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283228.6

PTPRR-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 3,529 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-201ENST00000283228 TMEM61Q8N0U2 210 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRR-201ENST00000283228 RNF152Q8N8N0 203 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRR-201ENST00000283228 C20orf203Q8NBC4 194 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRR-201ENST00000283228 ACYP1P07311 99 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRR-201ENST00000283228 EBI3Q14213 229 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRR-201ENST00000283228 PEMTQ9UBM1 199 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRR-201ENST00000283228 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRR-201ENST00000283228 CSPG4Q6UVK1 2322 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRR-201ENST00000283228 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRR-201ENST00000283228 BSNQ9UPA5 3926 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRR-201ENST00000283228 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRR-201ENST00000283228 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRR-201ENST00000283228 POM121L12Q8N7R1 296 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRR-201ENST00000283228 LENEPQ9Y5L5 61 aa8.47□□□□□ -1.05
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PTPRR-201ENST00000283228 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRR-201ENST00000283228 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRR-201ENST00000283228 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRR-201ENST00000283228 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRR-201ENST00000283228 A0A087WW49 117 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRR-201ENST00000283228 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRR-201ENST00000283228 IGHV1-69P01742 117 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRR-201ENST00000283228 LINC00315P59091 139 aa8.46□□□□□ -1.06
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PTPRR-201ENST00000283228 IMUPQ9GZP8 106 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRR-201ENST00000283228 SYNJ2BPP57105 145 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRR-201ENST00000283228 TIRAPP58753 221 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRR-201ENST00000283228 SPINK13Q1W4C9 94 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRR-201ENST00000283228 ATOX1O00244 68 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRR-201ENST00000283228 Q9H8V8 135 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRR-201ENST00000283228 C4orf26Q17RF5 130 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRR-201ENST00000283228 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRR-201ENST00000283228 DCHS2Q6V1P9 2916 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRR-201ENST00000283228 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRR-201ENST00000283228 F5H768 121 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRR-201ENST00000283228 M0QY20 66 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRR-201ENST00000283228 PROK1P58294 105 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRR-201ENST00000283228 IGFL2Q6UWQ7 119 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRR-201ENST00000283228 MINOS1Q5TGZ0 78 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRR-201ENST00000283228 C10orf105Q8TEF2 133 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRR-201ENST00000283228 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
PTPRR-201ENST00000283228 C14orf132Q9NPU4 83 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRR-201ENST00000283228 SAA4P35542 130 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRR-201ENST00000283228 PRIMA1Q86XR5 153 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRR-201ENST00000283228 VSIG2Q96IQ7 327 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRR-201ENST00000283228 LITAFQ99732 161 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRR-201ENST00000283228 COX7A2LO14548 114 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRR-201ENST00000283228 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
PTPRR-201ENST00000283228 INAFM2P0DMQ5 153 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRR-201ENST00000283228 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRR-201ENST00000283228 WNK1Q9H4A3 2382 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRR-201ENST00000283228 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRR-201ENST00000283228 MED14OSP0DP75 135 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRR-201ENST00000283228 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRR-201ENST00000283228 Q8N2B8 174 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRR-201ENST00000283228 CYSTM1Q9H1C7 97 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRR-201ENST00000283228 TRAV25A0A0B4J276 109 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRR-201ENST00000283228 GRNP28799 593 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
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PTPRR-201ENST00000283228 TOMM7Q9P0U1 55 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRR-201ENST00000283228 A0A0J9YX75 114 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRR-201ENST00000283228 ODF3BA8MYP8 253 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRR-201ENST00000283228 EDN2P20800 178 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRR-201ENST00000283228 LINC00308Q8TCZ7 52 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRR-201ENST00000283228 PRM2P04554 102 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPRR-201ENST00000283228 ATP5G1P05496 136 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPRR-201ENST00000283228 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRR-201ENST00000283228 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PTPRR-201ENST00000283228 DCANP1Q8TF63 244 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRR-201ENST00000283228 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
PTPRR-201ENST00000283228 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
PTPRR-201ENST00000283228 Q8N6K4 173 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRR-201ENST00000283228 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRR-201ENST00000283228 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRR-201ENST00000283228 BRD3OSQ6XYD6 125 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRR-201ENST00000283228 C1orf43Q9BWL3 253 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRR-201ENST00000283228 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRR-201ENST00000283228 DEFB121Q5J5C9 76 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRR-201ENST00000283228 DPH3Q96FX2 82 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRR-201ENST00000283228 U3KQE9 123 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRR-201ENST00000283228 CRPP02741 224 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRR-201ENST00000283228 LY6DQ14210 128 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRR-201ENST00000283228 WFDC9Q8NEX5 89 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRR-201ENST00000283228 Q9UF83 564 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRR-201ENST00000283228 MALP21145 153 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRR-201ENST00000283228 CRYGAP11844 174 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRR-201ENST00000283228 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
PTPRR-201ENST00000283228 FAM218AQ96MZ4 157 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRR-201ENST00000283228 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRR-201ENST00000283228 USP17L23D6RBM5 183 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRR-201ENST00000283228 NDUFA4O00483 81 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRR-201ENST00000283228 TMEM258P61165 79 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRR-201ENST00000283228 SERP2Q8N6R1 65 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRR-201ENST00000283228 SLPIP03973 132 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRR-201ENST00000283228 LINC00467Q9BRT7 94 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRR-201ENST00000283228 NCR3O14931 201 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRR-201ENST00000283228 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PTPRR-201ENST00000283228 CXCL5P42830 114 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRR-201ENST00000283228 PKIGQ9Y2B9 76 aa8.34□□□□□ -1.07
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