RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262460.4

GINS1-201, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS1, Length 3,249 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-201ENST00000262460 J3QQQ9 107 aa6.33□□□□□ -1.4
GINS1-201ENST00000262460 SPINK8P0C7L1 97 aa6.33□□□□□ -1.4
GINS1-201ENST00000262460 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
GINS1-201ENST00000262460 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
GINS1-201ENST00000262460 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
GINS1-201ENST00000262460 K7EMT4 169 aa6.33□□□□□ -1.4
GINS1-201ENST00000262460 GAGE13Q4V321 117 aa6.33□□□□□ -1.4
GINS1-201ENST00000262460 NXPH4O95158 308 aa6.33□□□□□ -1.4
GINS1-201ENST00000262460 CFC1BP0CG36 223 aa6.33□□□□□ -1.4
GINS1-201ENST00000262460 CFC1P0CG37 223 aa6.33□□□□□ -1.4
GINS1-201ENST00000262460 COTL1Q14019 142 aa6.33□□□□□ -1.4
GINS1-201ENST00000262460 OR5A1Q8NGJ0 315 aa6.33□□□□□ -1.4
GINS1-201ENST00000262460 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa6.32□□□□□ -1.4
GINS1-201ENST00000262460 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa6.32□□□□□ -1.4
GINS1-201ENST00000262460 A4D1N5 150 aa6.32□□□□□ -1.4
GINS1-201ENST00000262460 PF4P02776 101 aa6.32□□□□□ -1.4
GINS1-201ENST00000262460 SCGB1C2P0DMR2 95 aa6.32□□□□□ -1.4
GINS1-201ENST00000262460 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
GINS1-201ENST00000262460 Q6YL49 198 aa6.32□□□□□ -1.4
GINS1-201ENST00000262460 NFE4Q86UQ8 179 aa6.32□□□□□ -1.4
GINS1-201ENST00000262460 DYNLRB2Q8TF09 96 aa6.32□□□□□ -1.4
GINS1-201ENST00000262460 FAM104AQ969W3 186 aa6.32□□□□□ -1.4
GINS1-201ENST00000262460 VCX2Q9H322 139 aa6.32□□□□□ -1.4
GINS1-201ENST00000262460 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa6.32□□□□□ -1.4
GINS1-201ENST00000262460 H3BMM0 161 aa6.32□□□□□ -1.4
GINS1-201ENST00000262460 LGALS9O00182 355 aa6.32□□□□□ -1.4
GINS1-201ENST00000262460 AMELXQ99217 191 aa6.32□□□□□ -1.4
GINS1-201ENST00000262460 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
GINS1-201ENST00000262460 MUSTN1Q8IVN3 82 aa6.31□□□□□ -1.4
GINS1-201ENST00000262460 C10orf126Q8N4M7 172 aa6.31□□□□□ -1.4
GINS1-201ENST00000262460 C20orf203Q8NBC4 194 aa6.31□□□□□ -1.4
GINS1-201ENST00000262460 SYT8Q8NBV8 401 aa6.31□□□□□ -1.4
GINS1-201ENST00000262460 TCL1BO95988 128 aa6.31□□□□□ -1.4
GINS1-201ENST00000262460 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.31□□□□□ -1.4
GINS1-201ENST00000262460 LINC00467Q9BRT7 94 aa6.31□□□□□ -1.4
GINS1-201ENST00000262460 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
GINS1-201ENST00000262460 Q6ZUT4 128 aa6.31□□□□□ -1.4
GINS1-201ENST00000262460 NDUFA11Q86Y39 141 aa6.31□□□□□ -1.4
GINS1-201ENST00000262460 ZNF843Q8N446 348 aa6.31□□□□□ -1.4
GINS1-201ENST00000262460 PRO0461Q9UI25 63 aa6.31□□□□□ -1.4
GINS1-201ENST00000262460 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa6.31□□□□□ -1.4
GINS1-201ENST00000262460 I3L3M4 83 aa6.3□□□□□ -1.4
GINS1-201ENST00000262460 IGHV3-30P01768 117 aa6.3□□□□□ -1.4
GINS1-201ENST00000262460 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa6.3□□□□□ -1.4
GINS1-201ENST00000262460 FHL3Q13643 280 aa6.3□□□□□ -1.4
GINS1-201ENST00000262460 Q1RN00 199 aa6.3□□□□□ -1.4
GINS1-201ENST00000262460 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
GINS1-201ENST00000262460 SMR3AQ99954 134 aa6.3□□□□□ -1.4
GINS1-201ENST00000262460 MAP6D1Q9H9H5 199 aa6.3□□□□□ -1.4
GINS1-201ENST00000262460 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa6.3□□□□□ -1.4
GINS1-201ENST00000262460 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
GINS1-201ENST00000262460 ATP6V0BQ99437 205 aa6.3□□□□□ -1.4
GINS1-201ENST00000262460 ESM1Q9NQ30 184 aa6.3□□□□□ -1.4
GINS1-201ENST00000262460 RHODO00212 210 aa6.29□□□□□ -1.4
GINS1-201ENST00000262460 HERVK_113P61574 105 aa6.29□□□□□ -1.4
GINS1-201ENST00000262460 POM121L12Q8N7R1 296 aa6.29□□□□□ -1.4
GINS1-201ENST00000262460 BRI3O95415 125 aa6.29□□□□□ -1.4
GINS1-201ENST00000262460 LINC00694P0DN24 101 aa6.29□□□□□ -1.4
GINS1-201ENST00000262460 MED14OSP0DP75 135 aa6.29□□□□□ -1.4
GINS1-201ENST00000262460 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa6.29□□□□□ -1.4
GINS1-201ENST00000262460 LINC01619G3V211 115 aa6.29□□□□□ -1.4
GINS1-201ENST00000262460 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa6.29□□□□□ -1.4
GINS1-201ENST00000262460 CFAP126Q5VTH2 177 aa6.29□□□□□ -1.4
GINS1-201ENST00000262460 HIVEP1P15822 2718 aa6.28□□□□□ -1.4
GINS1-201ENST00000262460 TMEM223A0PJW6 202 aa6.28□□□□□ -1.4
GINS1-201ENST00000262460 UBE2D1P51668 147 aa6.28□□□□□ -1.4
GINS1-201ENST00000262460 COX6A2Q02221 97 aa6.28□□□□□ -1.4
GINS1-201ENST00000262460 Q6ZTI0 123 aa6.28□□□□□ -1.4
GINS1-201ENST00000262460 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa6.28□□□□□ -1.4
GINS1-201ENST00000262460 ODF3L2Q3SX64 289 aa6.28□□□□□ -1.4
GINS1-201ENST00000262460 TIMM17AQ99595 171 aa6.28□□□□□ -1.4
GINS1-201ENST00000262460 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa6.28□□□□□ -1.4
GINS1-201ENST00000262460 GAGE12HA6NDE8 117 aa6.27□□□□□ -1.41
GINS1-201ENST00000262460 TMEM238C9JI98 176 aa6.27□□□□□ -1.41
GINS1-201ENST00000262460 PPP1R17O96001 155 aa6.27□□□□□ -1.41
GINS1-201ENST00000262460 DEFB113Q30KQ7 82 aa6.27□□□□□ -1.41
GINS1-201ENST00000262460 SLC25A29Q8N8R3 303 aa6.27□□□□□ -1.41
GINS1-201ENST00000262460 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
GINS1-201ENST00000262460 DEFB114Q30KQ6 69 aa6.27□□□□□ -1.41
GINS1-201ENST00000262460 TMEM141Q96I45 108 aa6.27□□□□□ -1.41
GINS1-201ENST00000262460 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa6.27□□□□□ -1.41
GINS1-201ENST00000262460 TAL2Q16559 108 aa6.27□□□□□ -1.41
GINS1-201ENST00000262460 TRGV11A0A075B6L2 103 aa6.26□□□□□ -1.41
GINS1-201ENST00000262460 A0A0J9YXY3 114 aa6.26□□□□□ -1.41
GINS1-201ENST00000262460 GAGE12JA6NER3 117 aa6.26□□□□□ -1.41
GINS1-201ENST00000262460 GATA3P23771 443 aa6.26□□□□□ -1.41
GINS1-201ENST00000262460 GAGE4Q13068 117 aa6.26□□□□□ -1.41
GINS1-201ENST00000262460 GAGE5Q13069 117 aa6.26□□□□□ -1.41
GINS1-201ENST00000262460 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa6.26□□□□□ -1.41
GINS1-201ENST00000262460 CARD19Q96LW7 228 aa6.26□□□□□ -1.41
GINS1-201ENST00000262460 CHCHD7Q9BUK0 85 aa6.26□□□□□ -1.41
GINS1-201ENST00000262460 TIMM21Q9BVV7 248 aa6.26□□□□□ -1.41
GINS1-201ENST00000262460 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
GINS1-201ENST00000262460 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa6.26□□□□□ -1.41
GINS1-201ENST00000262460 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa6.26□□□□□ -1.41
GINS1-201ENST00000262460 C9JAW5 83 aa6.26□□□□□ -1.41
GINS1-201ENST00000262460 F8W1H4 67 aa6.26□□□□□ -1.41
GINS1-201ENST00000262460 SAMD13Q5VXD3 122 aa6.26□□□□□ -1.41
GINS1-201ENST00000262460 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
GINS1-201ENST00000262460 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa6.25□□□□□ -1.41
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