RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258243.6

URB2-201, Transcript of URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene URB2, Length 5,613 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
URB2-201ENST00000258243 KMT2EQ8IZD2 1858 aa8.3□□□□□ -1.08
URB2-201ENST00000258243 SPAG11BQ08648 103 aa8.29□□□□□ -1.08
URB2-201ENST00000258243 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa8.29□□□□□ -1.08
URB2-201ENST00000258243 MAP6D1Q9H9H5 199 aa8.29□□□□□ -1.08
URB2-201ENST00000258243 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
URB2-201ENST00000258243 HILS1P60008 231 aa8.29□□□□□ -1.08
URB2-201ENST00000258243 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
URB2-201ENST00000258243 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
URB2-201ENST00000258243 TIRAPP58753 221 aa8.28□□□□□ -1.08
URB2-201ENST00000258243 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
URB2-201ENST00000258243 Q6ZPA2 131 aa8.28□□□□□ -1.08
URB2-201ENST00000258243 DIRC1Q969H9 104 aa8.28□□□□□ -1.08
URB2-201ENST00000258243 CEP192Q8TEP8 1941 aa8.28□□□□□ -1.08
URB2-201ENST00000258243 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
URB2-201ENST00000258243 IGF1P05019 195 aa8.28□□□□□ -1.08
URB2-201ENST00000258243 ALPK3Q96L96 1907 aa8.28□□□□□ -1.08
URB2-201ENST00000258243 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa8.28□□□□□ -1.08
URB2-201ENST00000258243 ENHOQ6UWT2 76 aa8.28□□□□□ -1.08
URB2-201ENST00000258243 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa8.28□□□□□ -1.08
URB2-201ENST00000258243 SPATA12Q7Z6I5 190 aa8.28□□□□□ -1.08
URB2-201ENST00000258243 NOTCH3Q9UM47 2321 aa8.28□□□□□ -1.08
URB2-201ENST00000258243 CCDC179H3BU77 68 aa8.28□□□□□ -1.08
URB2-201ENST00000258243 CLEC2BQ92478 149 aa8.28□□□□□ -1.08
URB2-201ENST00000258243 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP8.27□□□□□ -1.081e-7■■■■■ 33.2
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URB2-201ENST00000258243 EML6Q6ZMW3 1958 aa8.27□□□□□ -1.09
URB2-201ENST00000258243 LINC00574Q9H8X3 128 aa8.27□□□□□ -1.09
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URB2-201ENST00000258243 TP73-AS1Q9UF72 201 aa8.27□□□□□ -1.09
URB2-201ENST00000258243 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
URB2-201ENST00000258243 CRIP3Q6Q6R5 217 aa8.26□□□□□ -1.09
URB2-201ENST00000258243 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
URB2-201ENST00000258243 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa8.26□□□□□ -1.09
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URB2-201ENST00000258243 SNURFQ9Y675 71 aa8.26□□□□□ -1.09
URB2-201ENST00000258243 P0C879 139 aa8.26□□□□□ -1.09
URB2-201ENST00000258243 MBD6Q96DN6 1003 aa8.26□□□□□ -1.09
URB2-201ENST00000258243 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa8.25□□□□□ -1.09
URB2-201ENST00000258243 LINC01548A6NM66 108 aa8.25□□□□□ -1.09
URB2-201ENST00000258243 CTRLP40313 264 aa8.25□□□□□ -1.09
URB2-201ENST00000258243 C10orf142B7Z368 130 aa8.25□□□□□ -1.09
URB2-201ENST00000258243 IGLV2-8P01709 118 aa8.25□□□□□ -1.09
URB2-201ENST00000258243 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
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URB2-201ENST00000258243 A0A1B0GXF2 115 aa8.25□□□□□ -1.09
URB2-201ENST00000258243 E7EUB6 86 aa8.25□□□□□ -1.09
URB2-201ENST00000258243 P0DMU3 169 aa8.25□□□□□ -1.09
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URB2-201ENST00000258243 A0A0J9YX75 114 aa8.24□□□□□ -1.09
URB2-201ENST00000258243 MED13Q9UHV7 2174 aa8.24□□□□□ -1.09
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URB2-201ENST00000258243 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa8.24□□□□□ -1.09
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URB2-201ENST00000258243 ODF1Q14990 250 aa8.23□□□□□ -1.09
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URB2-201ENST00000258243 C5orf38Q86SI9 138 aa8.23□□□□□ -1.09
URB2-201ENST00000258243 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
URB2-201ENST00000258243 PRO0255Q9UI72 69 aa8.23□□□□□ -1.09
URB2-201ENST00000258243 MED13LQ71F56 2210 aa8.23□□□□□ -1.09
URB2-201ENST00000258243 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa8.23□□□□□ -1.09
URB2-201ENST00000258243 TCL1BO95988 128 aa8.23□□□□□ -1.09
URB2-201ENST00000258243 UBE2D2P62837 147 aa8.23□□□□□ -1.09
URB2-201ENST00000258243 TMEM254Q8TBM7 123 aa8.23□□□□□ -1.09
URB2-201ENST00000258243 COX7BP24311 80 aa8.22□□□□□ -1.09
URB2-201ENST00000258243 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa8.22□□□□□ -1.09
URB2-201ENST00000258243 DYSFO75923 2080 aa8.22□□□□□ -1.09
URB2-201ENST00000258243 MIFP14174 115 aa8.22□□□□□ -1.09
URB2-201ENST00000258243 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa8.22□□□□□ -1.09
URB2-201ENST00000258243 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa8.22□□□□□ -1.09
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URB2-201ENST00000258243 CRYGDP07320 174 aa8.22□□□□□ -1.09
URB2-201ENST00000258243 MED14OSP0DP75 135 aa8.22□□□□□ -1.09
URB2-201ENST00000258243 BRWD1-AS2P59051 145 aa8.22□□□□□ -1.09
URB2-201ENST00000258243 ZNF702PQ9H963 129 aa8.22□□□□□ -1.09
URB2-201ENST00000258243 LINC01006Q8NI28 216 aa8.21□□□□□ -1.09
URB2-201ENST00000258243 NUP210LQ5VU65 1888 aa8.21□□□□□ -1.09
URB2-201ENST00000258243 EBI3Q14213 229 aa8.21□□□□□ -1.09
URB2-201ENST00000258243 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.09
URB2-201ENST00000258243 CDSNQ15517 529 aa8.21□□□□□ -1.1
URB2-201ENST00000258243 NCR3O14931 201 aa8.21□□□□□ -1.1
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URB2-201ENST00000258243 LY6LH3BQJ8 138 aa8.21□□□□□ -1.1
URB2-201ENST00000258243 E9PLD3 99 aa8.2□□□□□ -1.1
URB2-201ENST00000258243 DEFB1P60022 68 aa8.2□□□□□ -1.1
URB2-201ENST00000258243 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa8.2□□□□□ -1.1
URB2-201ENST00000258243 C14orf177Q52M58 125 aa8.2□□□□□ -1.1
URB2-201ENST00000258243 PLCE1Q9P212 2302 aa8.2□□□□□ -1.1
URB2-201ENST00000258243 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
URB2-201ENST00000258243 KRTAP10-9P60411 292 aa8.19□□□□□ -1.1
URB2-201ENST00000258243 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa8.19□□□□□ -1.1
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