RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249377.4

LRRC17-201, Transcript of leucine rich repeat containing 17, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRC17, Length 2,002 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17-201ENST00000249377 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa10□□□□□ -0.81
LRRC17-201ENST00000249377 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
LRRC17-201ENST00000249377 BLCAPP62952 87 aa10□□□□□ -0.81
LRRC17-201ENST00000249377 TIMM21Q9BVV7 248 aa10□□□□□ -0.81
LRRC17-201ENST00000249377 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa9.99□□□□□ -0.81
LRRC17-201ENST00000249377 H3BMM0 161 aa9.99□□□□□ -0.81
LRRC17-201ENST00000249377 H3BUX3 64 aa9.99□□□□□ -0.81
LRRC17-201ENST00000249377 RNF152Q8N8N0 203 aa9.99□□□□□ -0.81
LRRC17-201ENST00000249377 UBE2WQ96B02 151 aa9.99□□□□□ -0.81
LRRC17-201ENST00000249377 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa9.99□□□□□ -0.81
LRRC17-201ENST00000249377 ICOSQ9Y6W8 199 aa9.99□□□□□ -0.81
LRRC17-201ENST00000249377 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
LRRC17-201ENST00000249377 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa9.98□□□□□ -0.81
LRRC17-201ENST00000249377 SPXQ9BT56 116 aa9.98□□□□□ -0.81
LRRC17-201ENST00000249377 ABCA2Q9BZC7 2435 aa9.97□□□□□ -0.81
LRRC17-201ENST00000249377 H3BT86 120 aa9.97□□□□□ -0.81
LRRC17-201ENST00000249377 CD28P10747 220 aa9.97□□□□□ -0.81
LRRC17-201ENST00000249377 CCL19Q99731 98 aa9.97□□□□□ -0.81
LRRC17-201ENST00000249377 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa9.97□□□□□ -0.81
LRRC17-201ENST00000249377 H7C423 109 aa9.97□□□□□ -0.81
LRRC17-201ENST00000249377 K7EQG2 157 aa9.97□□□□□ -0.81
LRRC17-201ENST00000249377 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
LRRC17-201ENST00000249377 MIAQ16674 131 aa9.97□□□□□ -0.81
LRRC17-201ENST00000249377 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa9.97□□□□□ -0.81
LRRC17-201ENST00000249377 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
LRRC17-201ENST00000249377 SS18L2Q9UHA2 77 aa9.97□□□□□ -0.81
LRRC17-201ENST00000249377 SPG11Q96JI7 2443 aa9.96□□□□□ -0.81
LRRC17-201ENST00000249377 TRGV11A0A075B6L2 103 aa9.96□□□□□ -0.81
LRRC17-201ENST00000249377 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa9.96□□□□□ -0.81
LRRC17-201ENST00000249377 IFITM1P13164 125 aa9.96□□□□□ -0.81
LRRC17-201ENST00000249377 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
LRRC17-201ENST00000249377 SPINK13Q1W4C9 94 aa9.96□□□□□ -0.81
LRRC17-201ENST00000249377 FBN2P35556 2912 aa9.96□□□□□ -0.82
LRRC17-201ENST00000249377 IGKV3-20P01619 116 aa9.95□□□□□ -0.82
LRRC17-201ENST00000249377 C2orf82Q6UX34 121 aa9.95□□□□□ -0.82
LRRC17-201ENST00000249377 VSIG2Q96IQ7 327 aa9.95□□□□□ -0.82
LRRC17-201ENST00000249377 NDUFA12Q9UI09 145 aa9.95□□□□□ -0.82
LRRC17-201ENST00000249377 ABCA12Q86UK0 2595 aa9.95□□□□□ -0.82
LRRC17-201ENST00000249377 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa9.95□□□□□ -0.82
LRRC17-201ENST00000249377 B5MCH6 92 aa9.95□□□□□ -0.82
LRRC17-201ENST00000249377 TTC32Q5I0X7 151 aa9.95□□□□□ -0.82
LRRC17-201ENST00000249377 DEFB121Q5J5C9 76 aa9.95□□□□□ -0.82
LRRC17-201ENST00000249377 C15orf53Q8NAA6 179 aa9.95□□□□□ -0.82
LRRC17-201ENST00000249377 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa9.94□□□□□ -0.82
LRRC17-201ENST00000249377 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa9.94□□□□□ -0.82
LRRC17-201ENST00000249377 COX6CP09669 75 aa9.94□□□□□ -0.82
LRRC17-201ENST00000249377 PSMB8P28062 276 aa9.94□□□□□ -0.82
LRRC17-201ENST00000249377 LST1O00453 97 aa9.94□□□□□ -0.82
LRRC17-201ENST00000249377 TIMM17BO60830 172 aa9.94□□□□□ -0.82
LRRC17-201ENST00000249377 PRSS2P07478 247 aa9.94□□□□□ -0.82
LRRC17-201ENST00000249377 CSMD2Q7Z408 3487 aa9.93□□□□□ -0.82
LRRC17-201ENST00000249377 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
LRRC17-201ENST00000249377 GAGE12JA6NER3 117 aa9.93□□□□□ -0.82
LRRC17-201ENST00000249377 GAGE7O76087 117 aa9.93□□□□□ -0.82
LRRC17-201ENST00000249377 GAGE12FP0CL80 117 aa9.93□□□□□ -0.82
LRRC17-201ENST00000249377 GAGE12GP0CL81 117 aa9.93□□□□□ -0.82
LRRC17-201ENST00000249377 GAGE12IP0CL82 117 aa9.93□□□□□ -0.82
LRRC17-201ENST00000249377 GAGE4Q13068 117 aa9.93□□□□□ -0.82
LRRC17-201ENST00000249377 TMEM61Q8N0U2 210 aa9.93□□□□□ -0.82
LRRC17-201ENST00000249377 YAE1D1Q9NRH1 226 aa9.93□□□□□ -0.82
LRRC17-201ENST00000249377 APCP25054 2843 aa9.93□□□□□ -0.82
LRRC17-201ENST00000249377 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
LRRC17-201ENST00000249377 SPANXA1Q9NS26 97 aa9.92□□□□□ -0.82
LRRC17-201ENST00000249377 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
LRRC17-201ENST00000249377 POLQO75417 2590 aa9.92□□□□□ -0.82
LRRC17-201ENST00000249377 PIMREGQ9BSJ6 248 aa9.92□□□□□ -0.82
LRRC17-201ENST00000249377 CHCHD7Q9BUK0 85 aa9.92□□□□□ -0.82
LRRC17-201ENST00000249377 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa9.92□□□□□ -0.82
LRRC17-201ENST00000249377 CCDC179H3BU77 68 aa9.91□□□□□ -0.82
LRRC17-201ENST00000249377 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
LRRC17-201ENST00000249377 RBMY1CP0DJD4 496 aa9.91□□□□□ -0.82
LRRC17-201ENST00000249377 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
LRRC17-201ENST00000249377 Q6ZSV7 163 aa9.91□□□□□ -0.82
LRRC17-201ENST00000249377 PROK1P58294 105 aa9.9□□□□□ -0.82
LRRC17-201ENST00000249377 TMEM95Q3KNT9 176 aa9.9□□□□□ -0.82
LRRC17-201ENST00000249377 CLEC2BQ92478 149 aa9.9□□□□□ -0.82
LRRC17-201ENST00000249377 ITPR2Q14571 2701 aa9.9□□□□□ -0.82
LRRC17-201ENST00000249377 TMEM89A2RUT3 159 aa9.9□□□□□ -0.82
LRRC17-201ENST00000249377 ATP5J2P56134 94 aa9.9□□□□□ -0.82
LRRC17-201ENST00000249377 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
LRRC17-201ENST00000249377 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa9.9□□□□□ -0.82
LRRC17-201ENST00000249377 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
LRRC17-201ENST00000249377 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa9.89□□□□□ -0.83
LRRC17-201ENST00000249377 A8MZ25 164 aa9.89□□□□□ -0.83
LRRC17-201ENST00000249377 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa9.89□□□□□ -0.83
LRRC17-201ENST00000249377 C10orf105Q8TEF2 133 aa9.89□□□□□ -0.83
LRRC17-201ENST00000249377 CYSRT1A8MQ03 144 aa9.89□□□□□ -0.83
LRRC17-201ENST00000249377 DEFB113Q30KQ7 82 aa9.89□□□□□ -0.83
LRRC17-201ENST00000249377 UNC79Q9P2D8 2635 aa9.88□□□□□ -0.83
LRRC17-201ENST00000249377 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa9.88□□□□□ -0.83
LRRC17-201ENST00000249377 NPC2P61916 151 aa9.88□□□□□ -0.83
LRRC17-201ENST00000249377 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa9.87□□□□□ -0.83
LRRC17-201ENST00000249377 A8MTW9 85 aa9.87□□□□□ -0.83
LRRC17-201ENST00000249377 NDUFA1O15239 70 aa9.87□□□□□ -0.83
LRRC17-201ENST00000249377 TIRAPP58753 221 aa9.87□□□□□ -0.83
LRRC17-201ENST00000249377 C10orf99Q6UWK7 81 aa9.87□□□□□ -0.83
LRRC17-201ENST00000249377 VPS13CQ709C8 3753 aa9.86□□□□□ -0.83
LRRC17-201ENST00000249377 MSMBP08118 114 aa9.86□□□□□ -0.83
LRRC17-201ENST00000249377 Q6ZSN1 163 aa9.86□□□□□ -0.83
LRRC17-201ENST00000249377 DUX3Q96PT4 197 aa9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.6 ms