RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000054930.6

Ptx4-201, Transcript of Pentraxin-4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptx4, Length 1,582 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gm8439G3UWA7 96 aa10.62□□□□□ -0.71
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gfi1bO70237 330 aa10.62□□□□□ -0.71
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Sdc1P18828 311 aa10.62□□□□□ -0.71
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Fgf7P36363 194 aa10.62□□□□□ -0.71
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gm5464Q3UY29 175 aa10.62□□□□□ -0.71
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Cdkn2aQ64364 169 aa10.62□□□□□ -0.71
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Fam206aQ80ZQ9 193 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Ifna14Q810G3 189 aa10.62□□□□□ -0.71
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Slc37a1Q8R070 531 aa10.62□□□□□ -0.71
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Tmem190Q9D2E9 166 aa10.62□□□□□ -0.71
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Fam3bQ9D309 235 aa10.62□□□□□ -0.71
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gtsf1Q9DAN6 167 aa10.62□□□□□ -0.71
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Rnase4Q9JJH1 148 aa10.62□□□□□ -0.71
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Rnd2Q9QYM5 227 aa10.62□□□□□ -0.71
Ptx4-201ENSMUST00000054930 NipblQ6KCD5 2798 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Iglv1A0A075B663 117 aa10.61□□□□□ -0.71
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Vmn1r113G3UWI8 307 aa10.61□□□□□ -0.71
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Ly6lH3BJG9 140 aa10.61□□□□□ -0.71
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Bri3P28662 125 aa10.61□□□□□ -0.71
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Npy1rQ04573 382 aa10.61□□□□□ -0.71
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Krt33bQ61897 404 aa10.61□□□□□ -0.71
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Olfr433Q7TRV9 314 aa10.61□□□□□ -0.71
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Mapk1ip1lQ8BH93 242 aa10.61□□□□□ -0.71
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Smco3Q8BQM7 225 aa10.61□□□□□ -0.71
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Mmp28Q8CGV8 520 aa10.61□□□□□ -0.71
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Rab11fip5Q8R361 645 aa10.61□□□□□ -0.71
Ptx4-201ENSMUST00000054930 NcmapQ99JS0 100 aa10.61□□□□□ -0.71
Ptx4-201ENSMUST00000054930 PpifQ99KR7 206 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Tex13bQ99MW5 186 aa10.61□□□□□ -0.71
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Tceal8Q9CZY2 117 aa10.61□□□□□ -0.71
Ptx4-201ENSMUST00000054930 VsirQ9D659 308 aa10.61□□□□□ -0.71
Ptx4-201ENSMUST00000054930 2200002J24RikQ9D807 110 aa10.61□□□□□ -0.71
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Tex15F8VPN2 2785 aa10.61□□□□□ -0.71
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Vmn1r194J3JS27 296 aa10.6□□□□□ -0.71
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gm21732J3QM79 361 aa10.6□□□□□ -0.71
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gm21921J3QNB5 361 aa10.6□□□□□ -0.71
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Slamf7Q8BHK6 333 aa10.6□□□□□ -0.71
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Rbm48Q8K2X2 371 aa10.6□□□□□ -0.71
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Olfr981Q8VEU2 310 aa10.6□□□□□ -0.71
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gpa33Q9JKA5 319 aa10.6□□□□□ -0.71
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Ighv1-74A0A0G2JGK2 117 aa10.6□□□□□ -0.71
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gm20825J3QM67 227 aa10.6□□□□□ -0.71
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gata2O09100 480 aa10.6□□□□□ -0.71
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gnb4P29387 340 aa10.6□□□□□ -0.71
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Ssty2Q149W4 227 aa10.6□□□□□ -0.71
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Arrdc5Q497K5 325 aa10.6□□□□□ -0.71
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gm21394Q497R7 227 aa10.6□□□□□ -0.71
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gm20854Q62461 227 aa10.6□□□□□ -0.71
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Coq2Q66JT7 374 aa10.6□□□□□ -0.71
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Olfr965Q7TRA7 312 aa10.6□□□□□ -0.71
Ptx4-201ENSMUST00000054930 FuomQ8R2K1 153 aa10.6□□□□□ -0.71
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Olfr1228Q8VGM9 323 aa10.6□□□□□ -0.71
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gm10306Q9CUK2 115 aa10.6□□□□□ -0.71
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Elovl1Q9JLJ5 279 aa10.6□□□□□ -0.71
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Bex3Q9WTZ9 124 aa10.6□□□□□ -0.71
Ptx4-201ENSMUST00000054930 IcosQ9WVS0 200 aa10.6□□□□□ -0.71
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Trbv12-2A0A0B4J1H1 124 aa10.59□□□□□ -0.71
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Trav13n-4A0A0G2JG01 110 aa10.59□□□□□ -0.71
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Amn1B8JKV0 258 aa10.59□□□□□ -0.71
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Olfr747E9PXH6 313 aa10.59□□□□□ -0.71
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Ifna5P07349 189 aa10.59□□□□□ -0.71
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Fabp6P51162 128 aa10.59□□□□□ -0.71
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Pilrb2Q2YFS1 225 aa10.59□□□□□ -0.71
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gm1673Q3UR78 90 aa10.59□□□□□ -0.71
Ptx4-201ENSMUST00000054930 RprmlQ3URD2 117 aa10.59□□□□□ -0.71
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Sf3a2Q62203 475 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Tex261Q62302 196 aa10.59□□□□□ -0.71
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Olfr823Q7TRH2 315 aa10.59□□□□□ -0.71
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Olfr824Q8VFU4 315 aa10.59□□□□□ -0.71
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Mus81Q91ZJ0 551 aa10.59□□□□□ -0.71
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Olfr959Q9EQ86 311 aa10.59□□□□□ -0.71
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Tcte2E9PY37 120 aa10.58□□□□□ -0.72
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Ebi3O35228 228 aa10.58□□□□□ -0.72
Ptx4-201ENSMUST00000054930 PpyP10601 100 aa10.58□□□□□ -0.72
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Fabp7P51880 132 aa10.58□□□□□ -0.72
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Txn2P97493 166 aa10.58□□□□□ -0.72
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Rasl11aQ6IMB1 242 aa10.58□□□□□ -0.72
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Znf474Q6V5K9 347 aa10.58□□□□□ -0.72
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Olfr1382Q7TQT3 311 aa10.58□□□□□ -0.72
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Spock3Q8BKV0 436 aa10.58□□□□□ -0.72
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gm10309Q8C648 119 aa10.58□□□□□ -0.72
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Dok5Q91ZM9 306 aa10.58□□□□□ -0.72
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Slc31a2Q9CPU9 143 aa10.58□□□□□ -0.72
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Plekha2Q9ERS5 425 aa10.58□□□□□ -0.72
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Hey1Q9WV93 299 aa10.58□□□□□ -0.72
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Igkv4-90A0A075B5L3 117 aa10.57□□□□□ -0.72
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gm8797A0A0A6YW67 77 aa10.57□□□□□ -0.72
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Trav7-5A0A0G2JFX6 112 aa10.57□□□□□ -0.72
Ptx4-201ENSMUST00000054930 BC030500E9Q6W0 185 aa10.57□□□□□ -0.72
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Rabl2E9Q9D5 223 aa10.57□□□□□ -0.72
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Krtap24-1G3X9A2 248 aa10.57□□□□□ -0.72
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Hoxd3P09027 433 aa10.57□□□□□ -0.72
Ptx4-201ENSMUST00000054930 IrgcQ8C262 412 aa10.57□□□□□ -0.72
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Klre1Q8CJC7 226 aa10.57□□□□□ -0.72
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Paip2bQ91W45 136 aa10.57□□□□□ -0.72
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Scgb1b27Q91WB5 92 aa10.57□□□□□ -0.72
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Cldn16Q925N4 235 aa10.57□□□□□ -0.72
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Tmem107Q9CPV0 140 aa10.57□□□□□ -0.72
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Tenm1Q9WTS4 2731 aa10.57□□□□□ -0.72
Ptx4-201ENSMUST00000054930 PolqQ8CGS6 2544 aa10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 12.2 ms