RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639221.1

SLC35A3-216, Transcript of solute carrier family 35 member A3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SLC35A3, Length 1,032 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A3-216ENST00000639221 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa15.2■□□□□ 0.02
SLC35A3-216ENST00000639221 DNAJC30Q96LL9 226 aa15.19■□□□□ 0.02
SLC35A3-216ENST00000639221 CNFNQ9BYD5 112 aa15.19■□□□□ 0.02
SLC35A3-216ENST00000639221 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa15.18■□□□□ 0.02
SLC35A3-216ENST00000639221 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
SLC35A3-216ENST00000639221 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
SLC35A3-216ENST00000639221 OSTCQ9NRP0 149 aa15.18■□□□□ 0.02
SLC35A3-216ENST00000639221 PSCAO43653 123 aa15.17■□□□□ 0.02
SLC35A3-216ENST00000639221 PKIAP61925 76 aa15.17■□□□□ 0.02
SLC35A3-216ENST00000639221 LAGE3Q14657 143 aa15.17■□□□□ 0.02
SLC35A3-216ENST00000639221 DNAH17Q9UFH2 4485 aa15.17■□□□□ 0.02
SLC35A3-216ENST00000639221 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa15.16■□□□□ 0.02
SLC35A3-216ENST00000639221 A0A087WX48 190 aa15.16■□□□□ 0.02
SLC35A3-216ENST00000639221 ELOBQ15370 118 aa15.16■□□□□ 0.02
SLC35A3-216ENST00000639221 NAT8Q9UHE5 227 aa15.16■□□□□ 0.02
SLC35A3-216ENST00000639221 SUMO4Q6EEV6 95 aa15.15■□□□□ 0.02
SLC35A3-216ENST00000639221 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
SLC35A3-216ENST00000639221 TSKUQ8WUA8 353 aa15.15■□□□□ 0.02
SLC35A3-216ENST00000639221 CHCHD7Q9BUK0 85 aa15.15■□□□□ 0.02
SLC35A3-216ENST00000639221 GFRA4Q9GZZ7 299 aa15.15■□□□□ 0.02
SLC35A3-216ENST00000639221 FAT2Q9NYQ8 4349 aa15.15■□□□□ 0.02
SLC35A3-216ENST00000639221 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa15.14■□□□□ 0.01
SLC35A3-216ENST00000639221 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa15.14■□□□□ 0.01
SLC35A3-216ENST00000639221 FAM231BA6NCW3 169 aa15.14■□□□□ 0.01
SLC35A3-216ENST00000639221 M0QY20 66 aa15.14■□□□□ 0.01
SLC35A3-216ENST00000639221 RASL11AQ6T310 242 aa15.14■□□□□ 0.01
SLC35A3-216ENST00000639221 GTSF1Q8WW33 167 aa15.14■□□□□ 0.01
SLC35A3-216ENST00000639221 PGLYRP4Q96LB8 373 aa15.14■□□□□ 0.01
SLC35A3-216ENST00000639221 TM2D2Q9BX73 214 aa15.14■□□□□ 0.01
SLC35A3-216ENST00000639221 C16orf90A8MZG2 172 aa15.13■□□□□ 0.01
SLC35A3-216ENST00000639221 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
SLC35A3-216ENST00000639221 ADIRFQ15847 76 aa15.13■□□□□ 0.01
SLC35A3-216ENST00000639221 Q9HAA7 133 aa15.13■□□□□ 0.01
SLC35A3-216ENST00000639221 TMEM262E9PQX1 116 aa15.12■□□□□ 0.01
SLC35A3-216ENST00000639221 SPATA12Q7Z6I5 190 aa15.12■□□□□ 0.01
SLC35A3-216ENST00000639221 NIT1Q86X76 327 aa15.12■□□□□ 0.01
SLC35A3-216ENST00000639221 FRZBQ92765 325 aa15.12■□□□□ 0.01
SLC35A3-216ENST00000639221 ISOC2Q96AB3 205 aa15.11■□□□□ 0.01
SLC35A3-216ENST00000639221 RMI2Q96E14 147 aa15.11■□□□□ 0.01
SLC35A3-216ENST00000639221 NIT2Q9NQR4 276 aa15.11■□□□□ 0.01
SLC35A3-216ENST00000639221 A0A1B0GUT8 65 aa15.1■□□□□ 0.01
SLC35A3-216ENST00000639221 HIGD1CA8MV81 97 aa15.1■□□□□ 0.01
SLC35A3-216ENST00000639221 RPL23P62829 140 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
SLC35A3-216ENST00000639221 CHCHD5Q9BSY4 110 aa15.1■□□□□ 0.01
SLC35A3-216ENST00000639221 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa15.09■□□□□ 0.01
SLC35A3-216ENST00000639221 C9JQL5 133 aa15.09■□□□□ 0.01
SLC35A3-216ENST00000639221 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
SLC35A3-216ENST00000639221 COX11Q9Y6N1 276 aa15.09■□□□□ 0.01
SLC35A3-216ENST00000639221 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa15.08■□□□□ 0
SLC35A3-216ENST00000639221 A0A087WTM6 91 aa15.06■□□□□ 0
SLC35A3-216ENST00000639221 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa15.06■□□□□ 0
SLC35A3-216ENST00000639221 RIGQ13278 110 aa15.06■□□□□ 0
SLC35A3-216ENST00000639221 NAT8BQ9UHF3 227 aa15.06■□□□□ 0
SLC35A3-216ENST00000639221 V9GYV3 84 aa15.06■□□□□ 0
SLC35A3-216ENST00000639221 Q0VG73 95 aa15.05■□□□□ -0
SLC35A3-216ENST00000639221 KLK12Q9UKR0 248 aa15.05■□□□□ -0
SLC35A3-216ENST00000639221 CDPF1Q6NVV7 123 aa15.04■□□□□ -0
SLC35A3-216ENST00000639221 Q8N3U1 123 aa15.04■□□□□ -0
SLC35A3-216ENST00000639221 CRPP02741 224 aa15.03■□□□□ -0
SLC35A3-216ENST00000639221 COTL1Q14019 142 aa15.03■□□□□ -0
SLC35A3-216ENST00000639221 IQCJQ1A5X6 159 aa15.03■□□□□ -0
SLC35A3-216ENST00000639221 GATD1Q8NB37 220 aa15.03■□□□□ -0
SLC35A3-216ENST00000639221 TMEM191AQ9H0A3 160 aa15.03■□□□□ -0
SLC35A3-216ENST00000639221 CLLU1Q5K131 121 aa15.02■□□□□ -0
SLC35A3-216ENST00000639221 UBE2WQ96B02 151 aa15.02■□□□□ -0
SLC35A3-216ENST00000639221 ANGP03950 147 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
SLC35A3-216ENST00000639221 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa15.01□□□□□ -0.01
SLC35A3-216ENST00000639221 NUP35Q8NFH5 326 aa15.01□□□□□ -0.01
SLC35A3-216ENST00000639221 TMEM243Q9BU79 118 aa15.01□□□□□ -0.01
SLC35A3-216ENST00000639221 PKD1P98161 4303 aa15.01□□□□□ -0.01
SLC35A3-216ENST00000639221 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa15□□□□□ -0.01
SLC35A3-216ENST00000639221 UBE2L6O14933 153 aa15□□□□□ -0.01
SLC35A3-216ENST00000639221 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa14.99□□□□□ -0.01
SLC35A3-216ENST00000639221 A0A1B0GW15 77 aa14.99□□□□□ -0.01
SLC35A3-216ENST00000639221 PPP1R2P9O14990 202 aa14.99□□□□□ -0.01
SLC35A3-216ENST00000639221 KRTAP10-2P60368 255 aa14.99□□□□□ -0.01
SLC35A3-216ENST00000639221 GAGE6Q13070 117 aa14.99□□□□□ -0.01
SLC35A3-216ENST00000639221 MPV17L2Q567V2 206 aa14.99□□□□□ -0.01
SLC35A3-216ENST00000639221 S100A8P05109 93 aa14.98□□□□□ -0.01
SLC35A3-216ENST00000639221 AMTP48728 403 aa14.98□□□□□ -0.01
SLC35A3-216ENST00000639221 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
SLC35A3-216ENST00000639221 ATRAIDQ6UW56 229 aa14.98□□□□□ -0.01
SLC35A3-216ENST00000639221 MRAP2Q96G30 205 aa14.98□□□□□ -0.01
SLC35A3-216ENST00000639221 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa14.97□□□□□ -0.01
SLC35A3-216ENST00000639221 PPP1R17O96001 155 aa14.97□□□□□ -0.01
SLC35A3-216ENST00000639221 C1orf43Q9BWL3 253 aa14.97□□□□□ -0.01
SLC35A3-216ENST00000639221 PKHD1P08F94 4074 aa14.97□□□□□ -0.01
SLC35A3-216ENST00000639221 NCR2O95944 276 aa14.96□□□□□ -0.01
SLC35A3-216ENST00000639221 RBX1P62877 108 aa14.96□□□□□ -0.01
SLC35A3-216ENST00000639221 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
SLC35A3-216ENST00000639221 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
SLC35A3-216ENST00000639221 Q8N976 141 aa14.95□□□□□ -0.02
SLC35A3-216ENST00000639221 ST20Q9HBF5 79 aa14.95□□□□□ -0.02
SLC35A3-216ENST00000639221 DNAH11Q96DT5 4516 aa14.95□□□□□ -0.02
SLC35A3-216ENST00000639221 LRCOL1A6NCL2 159 aa14.94□□□□□ -0.02
SLC35A3-216ENST00000639221 SDHAF1A6NFY7 115 aa14.94□□□□□ -0.02
SLC35A3-216ENST00000639221 RAB4AP20338 218 aa14.94□□□□□ -0.02
SLC35A3-216ENST00000639221 PMCHP20382 165 aa14.94□□□□□ -0.02
SLC35A3-216ENST00000639221 MIAQ16674 131 aa14.94□□□□□ -0.02
SLC35A3-216ENST00000639221 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57 ms