RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629219.1

PKP4-218, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PKP4, Length 162 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-218ENST00000629219 IGHV3-30P01768 117 aa6.04□□□□□ -1.44
PKP4-218ENST00000629219 IGHV3-33P01772 117 aa6.04□□□□□ -1.44
PKP4-218ENST00000629219 SMIM17P0DL12 118 aa6.04□□□□□ -1.44
PKP4-218ENST00000629219 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa6.04□□□□□ -1.44
PKP4-218ENST00000629219 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa6.04□□□□□ -1.44
PKP4-218ENST00000629219 CTRLP40313 264 aa6.04□□□□□ -1.44
PKP4-218ENST00000629219 Q0VG73 95 aa6.04□□□□□ -1.44
PKP4-218ENST00000629219 ZNF56Q15929 161 aa6.04□□□□□ -1.44
PKP4-218ENST00000629219 Q8N814 137 aa6.04□□□□□ -1.44
PKP4-218ENST00000629219 OR2D3Q8NGH3 330 aa6.04□□□□□ -1.44
PKP4-218ENST00000629219 FRZBQ92765 325 aa6.04□□□□□ -1.44
PKP4-218ENST00000629219 DNAH8Q96JB1 4490 aa6.04□□□□□ -1.44
PKP4-218ENST00000629219 RAB19A4D1S5 217 aa6.03□□□□□ -1.44
PKP4-218ENST00000629219 TRGC1P0CF51 173 aa6.03□□□□□ -1.44
PKP4-218ENST00000629219 GCSHP23434 173 aa6.03□□□□□ -1.44
PKP4-218ENST00000629219 KCNIP4Q6PIL6 250 aa6.03□□□□□ -1.44
PKP4-218ENST00000629219 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
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PKP4-218ENST00000629219 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa6.02□□□□□ -1.45
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PKP4-218ENST00000629219 CT83Q5H943 113 aa6.02□□□□□ -1.45
PKP4-218ENST00000629219 FAM231DQ6ZW35 169 aa6.02□□□□□ -1.45
PKP4-218ENST00000629219 Q9HAA7 133 aa6.02□□□□□ -1.45
PKP4-218ENST00000629219 XGP55808 180 aa6.01□□□□□ -1.45
PKP4-218ENST00000629219 KRTAP10-1P60331 282 aa6.01□□□□□ -1.45
PKP4-218ENST00000629219 IQCJQ1A5X6 159 aa6.01□□□□□ -1.45
PKP4-218ENST00000629219 Q8N3U1 123 aa6.01□□□□□ -1.45
PKP4-218ENST00000629219 NUDT10Q8NFP7 164 aa6.01□□□□□ -1.45
PKP4-218ENST00000629219 NUDT11Q96G61 164 aa6.01□□□□□ -1.45
PKP4-218ENST00000629219 PGLYRP4Q96LB8 373 aa6.01□□□□□ -1.45
PKP4-218ENST00000629219 DPH3P1Q9H4G8 78 aa6.01□□□□□ -1.45
PKP4-218ENST00000629219 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
PKP4-218ENST00000629219 F5H697 171 aa6□□□□□ -1.45
PKP4-218ENST00000629219 SUMO4Q6EEV6 95 aa6□□□□□ -1.45
PKP4-218ENST00000629219 LYZL1Q6UWQ5 148 aa6□□□□□ -1.45
PKP4-218ENST00000629219 ALKAL2Q6UX46 152 aa6□□□□□ -1.45
PKP4-218ENST00000629219 Q8N976 141 aa6□□□□□ -1.45
PKP4-218ENST00000629219 OCC1Q8TAD7 63 aa6□□□□□ -1.45
PKP4-218ENST00000629219 FAM210AQ96ND0 272 aa6□□□□□ -1.45
PKP4-218ENST00000629219 PRR34Q9NV39 138 aa6□□□□□ -1.45
PKP4-218ENST00000629219 MYCBP2O75592 4640 aa5.99□□□□□ -1.45
PKP4-218ENST00000629219 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa5.99□□□□□ -1.45
PKP4-218ENST00000629219 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa5.99□□□□□ -1.45
PKP4-218ENST00000629219 K7EN84 100 aa5.99□□□□□ -1.45
PKP4-218ENST00000629219 GZMBP10144 247 aa5.99□□□□□ -1.45
PKP4-218ENST00000629219 NTF3P20783 257 aa5.99□□□□□ -1.45
PKP4-218ENST00000629219 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PKP4-218ENST00000629219 MIAQ16674 131 aa5.99□□□□□ -1.45
PKP4-218ENST00000629219 C14orf177Q52M58 125 aa5.99□□□□□ -1.45
PKP4-218ENST00000629219 RASL11AQ6T310 242 aa5.99□□□□□ -1.45
PKP4-218ENST00000629219 TEX261Q6UWH6 196 aa5.99□□□□□ -1.45
PKP4-218ENST00000629219 Q6ZSA8 131 aa5.99□□□□□ -1.45
PKP4-218ENST00000629219 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa5.99□□□□□ -1.45
PKP4-218ENST00000629219 NIT2Q9NQR4 276 aa5.99□□□□□ -1.45
PKP4-218ENST00000629219 KLK12Q9UKR0 248 aa5.99□□□□□ -1.45
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PKP4-218ENST00000629219 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa5.98□□□□□ -1.45
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PKP4-218ENST00000629219 MPV17L2Q567V2 206 aa5.98□□□□□ -1.45
PKP4-218ENST00000629219 UBE2WQ96B02 151 aa5.98□□□□□ -1.45
PKP4-218ENST00000629219 CHCHD5Q9BSY4 110 aa5.98□□□□□ -1.45
PKP4-218ENST00000629219 TPPP3Q9BW30 176 aa5.98□□□□□ -1.45
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PKP4-218ENST00000629219 GFRA4Q9GZZ7 299 aa5.98□□□□□ -1.45
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PKP4-218ENST00000629219 TMEM262E9PQX1 116 aa5.97□□□□□ -1.45
PKP4-218ENST00000629219 MGPP08493 103 aa5.97□□□□□ -1.45
PKP4-218ENST00000629219 ENHOQ6UWT2 76 aa5.97□□□□□ -1.45
PKP4-218ENST00000629219 SMIM15Q7Z3B0 74 aa5.97□□□□□ -1.45
PKP4-218ENST00000629219 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
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PKP4-218ENST00000629219 NCR2O95944 276 aa5.96□□□□□ -1.46
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PKP4-218ENST00000629219 TWIST1Q15672 202 aa5.96□□□□□ -1.46
PKP4-218ENST00000629219 FAM74A3Q4VXF1 159 aa5.96□□□□□ -1.46
PKP4-218ENST00000629219 C15orf54Q8N8G6 183 aa5.96□□□□□ -1.46
PKP4-218ENST00000629219 GTSF1Q8WW33 167 aa5.96□□□□□ -1.46
PKP4-218ENST00000629219 SMDT1Q9H4I9 107 aa5.96□□□□□ -1.46
PKP4-218ENST00000629219 OSTCQ9NRP0 149 aa5.96□□□□□ -1.46
PKP4-218ENST00000629219 H7C423 109 aa5.95□□□□□ -1.46
PKP4-218ENST00000629219 ANGP03950 147 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PKP4-218ENST00000629219 INAFM2P0DMQ5 153 aa5.95□□□□□ -1.46
PKP4-218ENST00000629219 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PKP4-218ENST00000629219 LINC01551Q86U37 167 aa5.95□□□□□ -1.46
PKP4-218ENST00000629219 BAALCQ8WXS3 180 aa5.95□□□□□ -1.46
PKP4-218ENST00000629219 SMIM7Q9BQ49 75 aa5.95□□□□□ -1.46
PKP4-218ENST00000629219 TMEM243Q9BU79 118 aa5.95□□□□□ -1.46
PKP4-218ENST00000629219 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PKP4-218ENST00000629219 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
PKP4-218ENST00000629219 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa5.94□□□□□ -1.46
PKP4-218ENST00000629219 SRP19P09132 144 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
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