RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620074.4

UBXN8-209, Transcript of UBX domain protein 8, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene UBXN8, Length 1,058 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8-209ENST00000620074 BOD1L2Q8IYS8 172 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-209ENST00000620074 SCRT2Q9NQ03 307 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-209ENST00000620074 NIT2Q9NQR4 276 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-209ENST00000620074 LY96Q9Y6Y9 160 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-209ENST00000620074 PDE6DO43924 150 aa7.54□□□□□ -1.2
UBXN8-209ENST00000620074 CAMPP49913 170 aa7.54□□□□□ -1.2
UBXN8-209ENST00000620074 LINC00315P59091 139 aa7.54□□□□□ -1.2
UBXN8-209ENST00000620074 HERV-K104P63124 156 aa7.54□□□□□ -1.2
UBXN8-209ENST00000620074 UFSP1Q6NVU6 142 aa7.54□□□□□ -1.2
UBXN8-209ENST00000620074 CDPF1Q6NVV7 123 aa7.54□□□□□ -1.2
UBXN8-209ENST00000620074 ZNF575Q86XF7 245 aa7.54□□□□□ -1.2
UBXN8-209ENST00000620074 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa7.54□□□□□ -1.2
UBXN8-209ENST00000620074 M0R381 172 aa7.53□□□□□ -1.2
UBXN8-209ENST00000620074 DNAH10OSP0CZ25 163 aa7.53□□□□□ -1.2
UBXN8-209ENST00000620074 BCL2P10415 239 aa7.53□□□□□ -1.2
UBXN8-209ENST00000620074 EVI2AP22794 236 aa7.53□□□□□ -1.2
UBXN8-209ENST00000620074 RPL19P84098 196 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
UBXN8-209ENST00000620074 CENPWQ5EE01 88 aa7.53□□□□□ -1.2
UBXN8-209ENST00000620074 PRR27Q6MZM9 219 aa7.53□□□□□ -1.2
UBXN8-209ENST00000620074 WFDC10BQ8IUB3 73 aa7.53□□□□□ -1.2
UBXN8-209ENST00000620074 SFRP2Q96HF1 295 aa7.53□□□□□ -1.2
UBXN8-209ENST00000620074 DERL1Q9BUN8 251 aa7.53□□□□□ -1.2
UBXN8-209ENST00000620074 HERC2O95714 4834 aa7.52□□□□□ -1.21
UBXN8-209ENST00000620074 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa7.52□□□□□ -1.21
UBXN8-209ENST00000620074 LINC00694P0DN24 101 aa7.52□□□□□ -1.21
UBXN8-209ENST00000620074 Q6ZSN1 163 aa7.52□□□□□ -1.21
UBXN8-209ENST00000620074 ERASQ7Z444 233 aa7.52□□□□□ -1.21
UBXN8-209ENST00000620074 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
UBXN8-209ENST00000620074 NFE4Q86UQ8 179 aa7.52□□□□□ -1.21
UBXN8-209ENST00000620074 C10orf126Q8N4M7 172 aa7.52□□□□□ -1.21
UBXN8-209ENST00000620074 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa7.52□□□□□ -1.21
UBXN8-209ENST00000620074 SAMD10Q9BYL1 202 aa7.52□□□□□ -1.21
UBXN8-209ENST00000620074 GTSF1LQ9H1H1 148 aa7.52□□□□□ -1.21
UBXN8-209ENST00000620074 JPT2Q9H910 190 aa7.52□□□□□ -1.21
UBXN8-209ENST00000620074 VAX2Q9UIW0 290 aa7.52□□□□□ -1.21
UBXN8-209ENST00000620074 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa7.51□□□□□ -1.21
UBXN8-209ENST00000620074 SNAI2O43623 268 aa7.51□□□□□ -1.21
UBXN8-209ENST00000620074 GNG4P50150 75 aa7.51□□□□□ -1.21
UBXN8-209ENST00000620074 LELP1Q5T871 98 aa7.51□□□□□ -1.21
UBXN8-209ENST00000620074 FAM74A4Q5TZK3 123 aa7.51□□□□□ -1.21
UBXN8-209ENST00000620074 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
UBXN8-209ENST00000620074 C14orf144Q96I85 54 aa7.51□□□□□ -1.21
UBXN8-209ENST00000620074 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa7.51□□□□□ -1.21
UBXN8-209ENST00000620074 A0A087WWL8 130 aa7.5□□□□□ -1.21
UBXN8-209ENST00000620074 LINC00862A6NCI5 91 aa7.5□□□□□ -1.21
UBXN8-209ENST00000620074 GAGE12JA6NER3 117 aa7.5□□□□□ -1.21
UBXN8-209ENST00000620074 IGLV2-8P01709 118 aa7.5□□□□□ -1.21
UBXN8-209ENST00000620074 CRYGDP07320 174 aa7.5□□□□□ -1.21
UBXN8-209ENST00000620074 OR5AL1P0C617 328 aa7.5□□□□□ -1.21
UBXN8-209ENST00000620074 GAGE4Q13068 117 aa7.5□□□□□ -1.21
UBXN8-209ENST00000620074 GAGE5Q13069 117 aa7.5□□□□□ -1.21
UBXN8-209ENST00000620074 GAGE13Q4V321 117 aa7.5□□□□□ -1.21
UBXN8-209ENST00000620074 LINC01556Q5JQF7 62 aa7.5□□□□□ -1.21
UBXN8-209ENST00000620074 OR10J3Q5JRS4 329 aa7.5□□□□□ -1.21
UBXN8-209ENST00000620074 ALKAL2Q6UX46 152 aa7.5□□□□□ -1.21
UBXN8-209ENST00000620074 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
UBXN8-209ENST00000620074 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
UBXN8-209ENST00000620074 MED9Q9NWA0 146 aa7.5□□□□□ -1.21
UBXN8-209ENST00000620074 KIAA1109Q2LD37 5005 aa7.49□□□□□ -1.21
UBXN8-209ENST00000620074 RPS20P60866 119 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
UBXN8-209ENST00000620074 RNF151Q2KHN1 245 aa7.49□□□□□ -1.21
UBXN8-209ENST00000620074 SPANXN1Q5VSR9 72 aa7.49□□□□□ -1.21
UBXN8-209ENST00000620074 OR10AG1Q8NH19 301 aa7.49□□□□□ -1.21
UBXN8-209ENST00000620074 MSRB1Q9NZV6 116 aa7.49□□□□□ -1.21
UBXN8-209ENST00000620074 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa7.48□□□□□ -1.21
UBXN8-209ENST00000620074 A0A087WWC5 75 aa7.48□□□□□ -1.21
UBXN8-209ENST00000620074 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa7.48□□□□□ -1.21
UBXN8-209ENST00000620074 C19orf71A6NCJ1 209 aa7.48□□□□□ -1.21
UBXN8-209ENST00000620074 C16orf90A8MZG2 172 aa7.48□□□□□ -1.21
UBXN8-209ENST00000620074 P01737 135 aa7.47□□□□□ -1.21
UBXN8-209ENST00000620074 ERVFC1-1P60608 527 aa7.47□□□□□ -1.21
UBXN8-209ENST00000620074 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
UBXN8-209ENST00000620074 SPATA12Q7Z6I5 190 aa7.47□□□□□ -1.21
UBXN8-209ENST00000620074 LYPD6BQ8NI32 183 aa7.47□□□□□ -1.21
UBXN8-209ENST00000620074 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
UBXN8-209ENST00000620074 AP1S3Q96PC3 154 aa7.47□□□□□ -1.21
UBXN8-209ENST00000620074 LRP1BQ9NZR2 4599 aa7.46□□□□□ -1.22
UBXN8-209ENST00000620074 TMEM250H0YL14 139 aa7.46□□□□□ -1.22
UBXN8-209ENST00000620074 IGLC6P0CF74 106 aa7.46□□□□□ -1.22
UBXN8-209ENST00000620074 LAGE3Q14657 143 aa7.46□□□□□ -1.22
UBXN8-209ENST00000620074 ZNF56Q15929 161 aa7.46□□□□□ -1.22
UBXN8-209ENST00000620074 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa7.46□□□□□ -1.22
UBXN8-209ENST00000620074 OR10G8Q8NGN5 311 aa7.46□□□□□ -1.22
UBXN8-209ENST00000620074 Q9UF83 564 aa7.46□□□□□ -1.22
UBXN8-209ENST00000620074 RYR1P21817 5038 aa7.45□□□□□ -1.22
UBXN8-209ENST00000620074 DNAH5Q8TE73 4624 aa7.45□□□□□ -1.22
UBXN8-209ENST00000620074 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa7.45□□□□□ -1.22
UBXN8-209ENST00000620074 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa7.45□□□□□ -1.22
UBXN8-209ENST00000620074 MUC21A0A140T8X8 626 aa7.45□□□□□ -1.22
UBXN8-209ENST00000620074 RBFOX3A6NFN3 312 aa7.45□□□□□ -1.22
UBXN8-209ENST00000620074 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa7.45□□□□□ -1.22
UBXN8-209ENST00000620074 SMIM17P0DL12 118 aa7.45□□□□□ -1.22
UBXN8-209ENST00000620074 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
UBXN8-209ENST00000620074 UBE2D3P61077 147 aa7.45□□□□□ -1.22
UBXN8-209ENST00000620074 UBE2D2P62837 147 aa7.45□□□□□ -1.22
UBXN8-209ENST00000620074 CACNG7P62955 275 aa7.45□□□□□ -1.22
UBXN8-209ENST00000620074 VPS25Q9BRG1 176 aa7.45□□□□□ -1.22
UBXN8-209ENST00000620074 SPANXA1Q9NS26 97 aa7.45□□□□□ -1.22
UBXN8-209ENST00000620074 F2Z2F3 143 aa7.44□□□□□ -1.22
UBXN8-209ENST00000620074 IGHV3-30P01768 117 aa7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.9 ms