RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa15.33■□□□□ 0.05
CTDP1-208ENST00000613122 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa15.33■□□□□ 0.04
CTDP1-208ENST00000613122 C22orf34Q6ZV56 151 aa15.33■□□□□ 0.04
CTDP1-208ENST00000613122 ANKRD29Q8N6D5 301 aa15.32■□□□□ 0.04
CTDP1-208ENST00000613122 BAALCQ8WXS3 180 aa15.32■□□□□ 0.04
CTDP1-208ENST00000613122 SMIM9A6NGZ8 99 aa15.32■□□□□ 0.04
CTDP1-208ENST00000613122 DEFB114Q30KQ6 69 aa15.32■□□□□ 0.04
CTDP1-208ENST00000613122 Q6ZSV7 163 aa15.32■□□□□ 0.04
CTDP1-208ENST00000613122 GAGE12HA6NDE8 117 aa15.31■□□□□ 0.04
CTDP1-208ENST00000613122 K7EP13 123 aa15.31■□□□□ 0.04
CTDP1-208ENST00000613122 LYRM9A8MSI8 78 aa15.31■□□□□ 0.04
CTDP1-208ENST00000613122 H3BQ85 93 aa15.3■□□□□ 0.04
CTDP1-208ENST00000613122 FAM222AQ5U5X8 452 aa15.3■□□□□ 0.04
CTDP1-208ENST00000613122 COL4A3Q01955 1670 aa15.3■□□□□ 0.04
CTDP1-208ENST00000613122 NOTCH2Q04721 2471 aa15.3■□□□□ 0.04
CTDP1-208ENST00000613122 DAND5Q8N907 189 aa15.3■□□□□ 0.04
CTDP1-208ENST00000613122 C11orf71Q6IPW1 123 aa15.29■□□□□ 0.04
CTDP1-208ENST00000613122 CRYBA4P53673 196 aa15.29■□□□□ 0.04
CTDP1-208ENST00000613122 Q6ZTI0 123 aa15.29■□□□□ 0.04
CTDP1-208ENST00000613122 ACACBO00763 2458 aa15.29■□□□□ 0.04
CTDP1-208ENST00000613122 ODF3Q96PU9 254 aa15.29■□□□□ 0.04
CTDP1-208ENST00000613122 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa15.28■□□□□ 0.04
CTDP1-208ENST00000613122 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa15.28■□□□□ 0.04
CTDP1-208ENST00000613122 A4D1N5 150 aa15.28■□□□□ 0.04
CTDP1-208ENST00000613122 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa15.28■□□□□ 0.04
CTDP1-208ENST00000613122 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
CTDP1-208ENST00000613122 LINC00173Q6ZV60 143 aa15.27■□□□□ 0.04
CTDP1-208ENST00000613122 DIRC1Q969H9 104 aa15.27■□□□□ 0.04
CTDP1-208ENST00000613122 CUL9Q8IWT3 2517 aa15.27■□□□□ 0.03
CTDP1-208ENST00000613122 K7EQG2 157 aa15.26■□□□□ 0.03
CTDP1-208ENST00000613122 C20orf203Q8NBC4 194 aa15.26■□□□□ 0.03
CTDP1-208ENST00000613122 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa15.26■□□□□ 0.03
CTDP1-208ENST00000613122 B9D2Q9BPU9 175 aa15.26■□□□□ 0.03
CTDP1-208ENST00000613122 DENND4AQ7Z401 1863 aa15.25■□□□□ 0.03
CTDP1-208ENST00000613122 RS1O15537 224 aa15.25■□□□□ 0.03
CTDP1-208ENST00000613122 HIGD2BQ4VC39 106 aa15.25■□□□□ 0.03
CTDP1-208ENST00000613122 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa15.25■□□□□ 0.03
CTDP1-208ENST00000613122 PLCE1Q9P212 2302 aa15.25■□□□□ 0.03
CTDP1-208ENST00000613122 C11orf86A6NJI1 115 aa15.25■□□□□ 0.03
CTDP1-208ENST00000613122 FAM110AQ9BQ89 295 aa15.24■□□□□ 0.03
CTDP1-208ENST00000613122 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa15.24■□□□□ 0.03
CTDP1-208ENST00000613122 CRYGDP07320 174 aa15.24■□□□□ 0.03
CTDP1-208ENST00000613122 OBSL1O75147 1896 aa15.23■□□□□ 0.03
CTDP1-208ENST00000613122 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa15.23■□□□□ 0.03
CTDP1-208ENST00000613122 CITED1Q99966 193 aa15.23■□□□□ 0.03
CTDP1-208ENST00000613122 ANKRD39Q53RE8 183 aa15.23■□□□□ 0.03
CTDP1-208ENST00000613122 REG3AQ06141 175 aa15.23■□□□□ 0.03
CTDP1-208ENST00000613122 LINC00269Q8N2A0 174 aa15.23■□□□□ 0.03
CTDP1-208ENST00000613122 LINC00482Q8N8I6 264 aa15.23■□□□□ 0.03
CTDP1-208ENST00000613122 NREPQ16612 68 aa15.22■□□□□ 0.03
CTDP1-208ENST00000613122 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa15.22■□□□□ 0.03
CTDP1-208ENST00000613122 P0C879 139 aa15.22■□□□□ 0.03
CTDP1-208ENST00000613122 EBI3Q14213 229 aa15.22■□□□□ 0.03
CTDP1-208ENST00000613122 C19orf71A6NCJ1 209 aa15.21■□□□□ 0.03
CTDP1-208ENST00000613122 Q6ZUT4 128 aa15.21■□□□□ 0.03
CTDP1-208ENST00000613122 E9PLD3 99 aa15.21■□□□□ 0.03
CTDP1-208ENST00000613122 MIFP14174 115 aa15.21■□□□□ 0.03
CTDP1-208ENST00000613122 P0DMU3 169 aa15.21■□□□□ 0.02
CTDP1-208ENST00000613122 FAM231AP0DMU4 169 aa15.21■□□□□ 0.02
CTDP1-208ENST00000613122 FAM231CP0DMU5 169 aa15.21■□□□□ 0.02
CTDP1-208ENST00000613122 PLA2G2AP14555 144 aa15.2■□□□□ 0.02
CTDP1-208ENST00000613122 ACYP1P07311 99 aa15.2■□□□□ 0.02
CTDP1-208ENST00000613122 LY6LH3BQJ8 138 aa15.2■□□□□ 0.02
CTDP1-208ENST00000613122 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
CTDP1-208ENST00000613122 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa15.19■□□□□ 0.02
CTDP1-208ENST00000613122 NACAE9PAV3 2078 aa15.18■□□□□ 0.02
CTDP1-208ENST00000613122 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
CTDP1-208ENST00000613122 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa15.18■□□□□ 0.02
CTDP1-208ENST00000613122 LECT2O14960 151 aa15.18■□□□□ 0.02
CTDP1-208ENST00000613122 CRYGBP07316 175 aa15.18■□□□□ 0.02
CTDP1-208ENST00000613122 NUPR1O60356 82 aa15.17■□□□□ 0.02
CTDP1-208ENST00000613122 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
CTDP1-208ENST00000613122 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
CTDP1-208ENST00000613122 UFSP1Q6NVU6 142 aa15.17■□□□□ 0.02
CTDP1-208ENST00000613122 C10orf99Q6UWK7 81 aa15.17■□□□□ 0.02
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF702PQ9H963 129 aa15.17■□□□□ 0.02
CTDP1-208ENST00000613122 C20orf173Q96LM9 149 aa15.16■□□□□ 0.02
CTDP1-208ENST00000613122 SPG11Q96JI7 2443 aa15.16■□□□□ 0.02
CTDP1-208ENST00000613122 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa15.16■□□□□ 0.02
CTDP1-208ENST00000613122 COX7BP24311 80 aa15.16■□□□□ 0.02
CTDP1-208ENST00000613122 BRWD1-AS2P59051 145 aa15.16■□□□□ 0.02
CTDP1-208ENST00000613122 C11orf1Q9H5F2 150 aa15.16■□□□□ 0.02
CTDP1-208ENST00000613122 LINC01006Q8NI28 216 aa15.15■□□□□ 0.02
CTDP1-208ENST00000613122 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
CTDP1-208ENST00000613122 NPSP0C0P6 89 aa15.15■□□□□ 0.02
CTDP1-208ENST00000613122 TRAV10A0A0B4J240 114 aa15.14■□□□□ 0.01
CTDP1-208ENST00000613122 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa15.14■□□□□ 0.01
CTDP1-208ENST00000613122 MP68P56378 58 aa15.13■□□□□ 0.01
CTDP1-208ENST00000613122 TNCP24821 2201 aa15.13■□□□□ 0.01
CTDP1-208ENST00000613122 H7C423 109 aa15.13■□□□□ 0.01
CTDP1-208ENST00000613122 TTTY13Q9BZ97 58 aa15.13■□□□□ 0.01
CTDP1-208ENST00000613122 FREM1Q5H8C1 2179 aa15.13■□□□□ 0.01
CTDP1-208ENST00000613122 ODF1Q14990 250 aa15.12■□□□□ 0.01
CTDP1-208ENST00000613122 HIGD1BQ9P298 99 aa15.12■□□□□ 0.01
CTDP1-208ENST00000613122 A0A1B0GX51 115 aa15.12■□□□□ 0.01
CTDP1-208ENST00000613122 LINC01620Q4KN68 170 aa15.12■□□□□ 0.01
CTDP1-208ENST00000613122 NFE4Q86UQ8 179 aa15.12■□□□□ 0.01
CTDP1-208ENST00000613122 HIGD2AQ9BW72 106 aa15.12■□□□□ 0.01
CTDP1-208ENST00000613122 ZFAND3Q9H8U3 227 aa15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 105.5 ms