RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000606749.1

CUX1-219, Transcript of cut like homeobox 1, human

TSL 4

Gene CUX1, Length 601 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CUX1-219	ENST00000606749	C15orf54	Q8N8G6	183 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CUX1-219	ENST00000606749	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CUX1-219	ENST00000606749	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CUX1-219	ENST00000606749	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CUX1-219	ENST00000606749	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CUX1-219	ENST00000606749		J3QL48	77 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CUX1-219	ENST00000606749	BCL2L11	O43521	198 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CUX1-219	ENST00000606749	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CUX1-219	ENST00000606749	RPL35	P42766	123 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CUX1-219	ENST00000606749	C14orf177	Q52M58	125 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CUX1-219	ENST00000606749	MPV17L2	Q567V2	206 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CUX1-219	ENST00000606749	SREK1IP1	Q8N9Q2	155 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CUX1-219	ENST00000606749	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CUX1-219	ENST00000606749	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CUX1-219	ENST00000606749	VAX2	Q9UIW0	290 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CUX1-219	ENST00000606749	TRAV1-1	A0A0B4J248	108 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CUX1-219	ENST00000606749	IGLV2-8	P01709	118 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CUX1-219	ENST00000606749	SMIM17	P0DL12	118 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CUX1-219	ENST00000606749	PKIA	P61925	76 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CUX1-219	ENST00000606749	EIF5A	P63241	154 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CUX1-219	ENST00000606749	TMEM97	Q5BJF2	176 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CUX1-219	ENST00000606749	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CUX1-219	ENST00000606749	DERL1	Q9BUN8	251 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CUX1-219	ENST00000606749	MANBAL	Q9NQG1	85 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CUX1-219	ENST00000606749	GNG13	Q9P2W3	67 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CUX1-219	ENST00000606749	MYCBP2	O75592	4640 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CUX1-219	ENST00000606749	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CUX1-219	ENST00000606749	USP17L23	D6RBM5	183 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-219	ENST00000606749		M0QY20	66 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-219	ENST00000606749	CRP	P02741	224 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-219	ENST00000606749	PRSS1	P07477	247 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-219	ENST00000606749	GZMB	P10144	247 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-219	ENST00000606749	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-219	ENST00000606749	RBX1	P62877	108 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-219	ENST00000606749	MIA	Q16674	131 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-219	ENST00000606749	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-219	ENST00000606749	C11orf52	Q96A22	123 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-219	ENST00000606749	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-219	ENST00000606749	PRR34	Q9NV39	138 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CUX1-219	ENST00000606749	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUX1-219	ENST00000606749	RAB19	A4D1S5	217 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUX1-219	ENST00000606749	C19orf71	A6NCJ1	209 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUX1-219	ENST00000606749	HLA-DQA1	P01909	254 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUX1-219	ENST00000606749	IGLC6	P0CF74	106 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUX1-219	ENST00000606749	RAB5C	P51148	216 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUX1-219	ENST00000606749	RPS20	P60866	119 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CUX1-219	ENST00000606749	GAGE6	Q13070	117 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUX1-219	ENST00000606749	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUX1-219	ENST00000606749	CENPW	Q5EE01	88 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUX1-219	ENST00000606749	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUX1-219	ENST00000606749	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUX1-219	ENST00000606749	FER1L6-AS1	Q8NA97	138 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUX1-219	ENST00000606749	OR2D3	Q8NGH3	330 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUX1-219	ENST00000606749	AP1S3	Q96PC3	154 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUX1-219	ENST00000606749	TPPP3	Q9BW30	176 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUX1-219	ENST00000606749	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-219	ENST00000606749	IGHV1-24	A0A0C4DH33	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-219	ENST00000606749		F2Z2F3	143 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-219	ENST00000606749		H7C1H1	209 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-219	ENST00000606749	MGP	P08493	103 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-219	ENST00000606749	SULT1A2	P50226	295 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-219	ENST00000606749	CACNG7	P62955	275 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-219	ENST00000606749	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-219	ENST00000606749	EIF5AL1	Q6IS14	154 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-219	ENST00000606749	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-219	ENST00000606749	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-219	ENST00000606749	SMIM12	Q96EX1	92 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUX1-219	ENST00000606749	TRBV20OR9-2	A0A075B6H5	130 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUX1-219	ENST00000606749		A0A1B0GUV1	79 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUX1-219	ENST00000606749	XKRY2	A2RUG3	117 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUX1-219	ENST00000606749	TEX46	H3BTG2	121 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUX1-219	ENST00000606749	PDE6D	O43924	150 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUX1-219	ENST00000606749		P01737	135 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUX1-219	ENST00000606749	NTF3	P20783	257 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUX1-219	ENST00000606749	SMCP	P49901	116 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CUX1-219	ENST00000606749	GNG4	P50150	75 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUX1-219	ENST00000606749	NKX2-5	P52952	324 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CUX1-219	ENST00000606749	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CUX1-219	ENST00000606749	REG3A	Q06141	175 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUX1-219	ENST00000606749	RASL11A	Q6T310	242 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUX1-219	ENST00000606749	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUX1-219	ENST00000606749	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUX1-219	ENST00000606749	C9orf62	Q8N4C0	152 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUX1-219	ENST00000606749	C20orf203	Q8NBC4	194 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUX1-219	ENST00000606749	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUX1-219	ENST00000606749	MED9	Q9NWA0	146 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUX1-219	ENST00000606749	IGLV4-60	A0A075B6I1	120 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CUX1-219	ENST00000606749	IGLV10-54	A0A075B6I4	117 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CUX1-219	ENST00000606749	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CUX1-219	ENST00000606749	OXT	P01178	125 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CUX1-219	ENST00000606749	IFNA1	P01562	189 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CUX1-219	ENST00000606749	WDR73	Q6P4I2	378 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CUX1-219	ENST00000606749	NUDT10	Q8NFP7	164 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CUX1-219	ENST00000606749	NUDT11	Q96G61	164 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CUX1-219	ENST00000606749	TMEM243	Q9BU79	118 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CUX1-219	ENST00000606749	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CUX1-219	ENST00000606749	NIT2	Q9NQR4	276 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CUX1-219	ENST00000606749	BIN3	Q9NQY0	253 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CUX1-219	ENST00000606749	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CUX1-219	ENST00000606749	PANO1	I0J062	215 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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