RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	RNF213	Q63HN8	5207 aa		7.63	□□□□□ -1.19
TTLL3-233	ENST00000602338	RBX1	P62877	108 aa		7.62	□□□□□ -1.19
TTLL3-233	ENST00000602338	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		7.62	□□□□□ -1.19
TTLL3-233	ENST00000602338	MED28	Q9H204	178 aa		7.62	□□□□□ -1.19
TTLL3-233	ENST00000602338	VAX2	Q9UIW0	290 aa		7.62	□□□□□ -1.19
TTLL3-233	ENST00000602338	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		7.61	□□□□□ -1.19
TTLL3-233	ENST00000602338	BORCS7-ASMT	A0A0B4J1R7	106 aa		7.61	□□□□□ -1.19
TTLL3-233	ENST00000602338	AKR1C3	P42330	323 aa		7.61	□□□□□ -1.19
TTLL3-233	ENST00000602338	GAGE6	Q13070	117 aa		7.61	□□□□□ -1.19
TTLL3-233	ENST00000602338	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	7.61	□□□□□ -1.19
TTLL3-233	ENST00000602338	RGS21	Q2M5E4	152 aa		7.61	□□□□□ -1.19
TTLL3-233	ENST00000602338	AKR1C8P	Q5T2L2	129 aa		7.61	□□□□□ -1.19
TTLL3-233	ENST00000602338	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	7.61	□□□□□ -1.19
TTLL3-233	ENST00000602338	IGLV10-54	A0A075B6I4	117 aa		7.6	□□□□□ -1.19
TTLL3-233	ENST00000602338		G3V3Q6	166 aa		7.6	□□□□□ -1.19
TTLL3-233	ENST00000602338	SNAI2	O43623	268 aa		7.6	□□□□□ -1.19
TTLL3-233	ENST00000602338	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	7.6	□□□□□ -1.19
TTLL3-233	ENST00000602338	CHTF8	P0CG12	524 aa		7.6	□□□□□ -1.19
TTLL3-233	ENST00000602338	FHIT	P49789	147 aa		7.6	□□□□□ -1.19
TTLL3-233	ENST00000602338	CST9LP1	Q5W188	147 aa		7.6	□□□□□ -1.19
TTLL3-233	ENST00000602338	TCEAL7	Q9BRU2	100 aa		7.6	□□□□□ -1.19
TTLL3-233	ENST00000602338	SSBP4	Q9BWG4	385 aa	Predicted RBP	7.6	□□□□□ -1.19
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF471	Q9BX82	626 aa	Predicted RBP	7.6	□□□□□ -1.19
TTLL3-233	ENST00000602338	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		7.6	□□□□□ -1.19
TTLL3-233	ENST00000602338	SLPI	P03973	132 aa		7.59	□□□□□ -1.19
TTLL3-233	ENST00000602338	CXCL1	P09341	107 aa		7.59	□□□□□ -1.19
TTLL3-233	ENST00000602338	SST	P61278	116 aa		7.59	□□□□□ -1.19
TTLL3-233	ENST00000602338	PKIA	P61925	76 aa		7.59	□□□□□ -1.19
TTLL3-233	ENST00000602338	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	7.59	□□□□□ -1.19
TTLL3-233	ENST00000602338		Q6ZRU5	148 aa		7.59	□□□□□ -1.19
TTLL3-233	ENST00000602338	DERL1	Q9BUN8	251 aa		7.59	□□□□□ -1.19
TTLL3-233	ENST00000602338	MLST8	Q9BVC4	326 aa		7.59	□□□□□ -1.19
TTLL3-233	ENST00000602338	CYTL1	Q9NRR1	136 aa		7.59	□□□□□ -1.19
TTLL3-233	ENST00000602338	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		7.58	□□□□□ -1.2
TTLL3-233	ENST00000602338	SCO2	A0A1W2PP80	73 aa		7.58	□□□□□ -1.2
TTLL3-233	ENST00000602338		F5H697	171 aa		7.58	□□□□□ -1.2
TTLL3-233	ENST00000602338	PAGE4	O60829	102 aa		7.58	□□□□□ -1.2
TTLL3-233	ENST00000602338	OR5AL1	P0C617	328 aa		7.58	□□□□□ -1.2
TTLL3-233	ENST00000602338	REG3A	Q06141	175 aa		7.58	□□□□□ -1.2
TTLL3-233	ENST00000602338	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		7.58	□□□□□ -1.2
TTLL3-233	ENST00000602338	STOML3	Q8TAV4	291 aa		7.58	□□□□□ -1.2
TTLL3-233	ENST00000602338	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		7.58	□□□□□ -1.2
TTLL3-233	ENST00000602338	hCG_2014768	A0A024R1R8	64 aa		7.57	□□□□□ -1.2
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A0D9SG52	128 aa		7.57	□□□□□ -1.2
TTLL3-233	ENST00000602338	hDV102S1	A0JD36	115 aa		7.57	□□□□□ -1.2
TTLL3-233	ENST00000602338	ATP6V1G1	O75348	118 aa		7.57	□□□□□ -1.2
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM97	Q5BJF2	176 aa		7.57	□□□□□ -1.2
TTLL3-233	ENST00000602338	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		7.57	□□□□□ -1.2
TTLL3-233	ENST00000602338	SREK1IP1	Q8N9Q2	155 aa	Predicted RBP	7.57	□□□□□ -1.2
TTLL3-233	ENST00000602338	C20orf203	Q8NBC4	194 aa		7.57	□□□□□ -1.2
TTLL3-233	ENST00000602338	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		7.57	□□□□□ -1.2
TTLL3-233	ENST00000602338	IGLV4-60	A0A075B6I1	120 aa		7.56	□□□□□ -1.2
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A087WYN8	130 aa		7.56	□□□□□ -1.2
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A1B0GV50	99 aa		7.56	□□□□□ -1.2
TTLL3-233	ENST00000602338	ODF1	Q14990	250 aa		7.56	□□□□□ -1.2
TTLL3-233	ENST00000602338	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		7.56	□□□□□ -1.2
TTLL3-233	ENST00000602338	AP1S3	Q96PC3	154 aa		7.56	□□□□□ -1.2
TTLL3-233	ENST00000602338	IGHV1-24	A0A0C4DH33	117 aa		7.55	□□□□□ -1.2
TTLL3-233	ENST00000602338		M0QY20	66 aa		7.55	□□□□□ -1.2
TTLL3-233	ENST00000602338	ARPC5	O15511	151 aa		7.55	□□□□□ -1.2
TTLL3-233	ENST00000602338	BAGE2	Q86Y30	109 aa		7.55	□□□□□ -1.2
TTLL3-233	ENST00000602338	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		7.54	□□□□□ -1.2
TTLL3-233	ENST00000602338	PHOX2A	O14813	284 aa		7.54	□□□□□ -1.2
TTLL3-233	ENST00000602338	MGP	P08493	103 aa		7.54	□□□□□ -1.2
TTLL3-233	ENST00000602338	SMIM17	P0DL12	118 aa		7.54	□□□□□ -1.2
TTLL3-233	ENST00000602338	GZMB	P10144	247 aa		7.54	□□□□□ -1.2
TTLL3-233	ENST00000602338	RAB5C	P51148	216 aa		7.54	□□□□□ -1.2
TTLL3-233	ENST00000602338	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		7.54	□□□□□ -1.2
TTLL3-233	ENST00000602338	S100A9	P06702	114 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
TTLL3-233	ENST00000602338	C15orf56	Q8N910	161 aa		7.53	□□□□□ -1.2
TTLL3-233	ENST00000602338	RNF185	Q96GF1	192 aa		7.53	□□□□□ -1.2
TTLL3-233	ENST00000602338	PLAC8	Q9NZF1	115 aa		7.53	□□□□□ -1.2
TTLL3-233	ENST00000602338	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		7.52	□□□□□ -1.21
TTLL3-233	ENST00000602338		P01737	135 aa		7.52	□□□□□ -1.21
TTLL3-233	ENST00000602338	IGLC6	P0CF74	106 aa		7.52	□□□□□ -1.21
TTLL3-233	ENST00000602338	NKX2-5	P52952	324 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
TTLL3-233	ENST00000602338	NDUFA5	Q16718	116 aa		7.52	□□□□□ -1.21
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		7.52	□□□□□ -1.21
TTLL3-233	ENST00000602338	SFT2D1	Q8WV19	159 aa		7.52	□□□□□ -1.21
TTLL3-233	ENST00000602338	MBD3L1	Q8WWY6	194 aa		7.52	□□□□□ -1.21
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM243	Q9BU79	118 aa		7.52	□□□□□ -1.21
TTLL3-233	ENST00000602338	TPPP3	Q9BW30	176 aa		7.52	□□□□□ -1.21
TTLL3-233	ENST00000602338	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A1B0GUV1	79 aa		7.51	□□□□□ -1.21
TTLL3-233	ENST00000602338	SMLR1	H3BR10	107 aa		7.51	□□□□□ -1.21
TTLL3-233	ENST00000602338	RPL35	P42766	123 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
TTLL3-233	ENST00000602338	DPH3	Q96FX2	82 aa		7.51	□□□□□ -1.21
TTLL3-233	ENST00000602338	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		7.51	□□□□□ -1.21
TTLL3-233	ENST00000602338		H7C1H1	209 aa		7.5	□□□□□ -1.21
TTLL3-233	ENST00000602338	S100A1	P23297	94 aa		7.5	□□□□□ -1.21
TTLL3-233	ENST00000602338	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
TTLL3-233	ENST00000602338	COX6A2	Q02221	97 aa		7.5	□□□□□ -1.21
TTLL3-233	ENST00000602338	TMUB2	Q71RG4	321 aa		7.5	□□□□□ -1.21
TTLL3-233	ENST00000602338	FER1L6-AS1	Q8NA97	138 aa		7.5	□□□□□ -1.21
TTLL3-233	ENST00000602338	IGKV2-24	A0A0C4DH68	120 aa		7.49	□□□□□ -1.21
TTLL3-233	ENST00000602338	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		7.49	□□□□□ -1.21
TTLL3-233	ENST00000602338	CENPW	Q5EE01	88 aa		7.49	□□□□□ -1.21
TTLL3-233	ENST00000602338	RASL11A	Q6T310	242 aa		7.49	□□□□□ -1.21
TTLL3-233	ENST00000602338	KCNRG	Q8N5I3	272 aa		7.49	□□□□□ -1.21
TTLL3-233	ENST00000602338	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		7.49	□□□□□ -1.21

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